포스다
PHOSIDA| 내용물 | |
|---|---|
| 묘사 | 번역 후 수정 데이터베이스. |
| 연락 | |
| 연구소 | 막스플랑크 생화학연구소 |
| 실험실. | 프로테오믹스 및 신호변환학과 |
| 작가들 | 플로리안 그나드 |
| 1차 인용 | Gnad & al. (2011)[1] |
| 발매일 | 2009 |
| 접근 | |
| 웹사이트 | http://www.phosida.com |
PHOsphorilation SITE DAtabase PHOSIDA는 질량 분석 기술을 기반으로 다양한 종에서 확인된 수천 개의 높은 신뢰도의 생체 인지질을 통합합니다.각 포스파이트에 대해 PHOSIDA는 일치하는 키나제 모티브, 예측된 2차 구조, 보존 패턴 및 자극 또는 키나제 억제와 같은 다른 치료법에 대한 동적 조절을 나열합니다.그것은 인간과 효모와 같은 진핵생물에서부터 대장균과 락토코커스 락티스와 같은 박테리아에 이르는 다양한 유기체의 인단백질을 포함합니다.심지어 고고학 유기체의 인단백질, 즉 할로박테리움 살리나리움도 이용할 수 있습니다.대표적으로 계통발생학적 나무를 포함하는 유기체에서 확인된 인단백질의 통합은 시간 [1]내 보존 및 진화 보존을 포함한 세계적 관점에서 인산화 사건을 조사할 수 있게 합니다.
게다가, PHOSIDA는 또한 지원 벡터 기계를 기반으로 포스파이트를 예측합니다.
레퍼런스
- ^ a b Gnad, Florian; Gunawardena Jeremy; Mann Matthias (Jan 2011). "PHOSIDA 2011: the posttranslational modification database". Nucleic Acids Res. 39 (Database issue): D253-60. doi:10.1093/nar/gkq1159. PMC 3013726. PMID 21081558.