시스템 생물 시각화 소프트웨어 목록

List of systems biology visualization software

온라인 소프트웨어

이름 설명 사이트
게스탈트 워크벤치 대규모 게놈 시퀀스 데이터 분석을 위한 그래픽 워크벤치 [1]
N-브라우즈 생물학적 네트워크를 위한 대화형 그래픽 브라우저 [2]
넷패스 인간 신호 전달 경로에 대한 통제된 자원 [3]
메가 무료, 온라인, 오픈 소스, 유전체 분석, 도면 등 [4]
리액텀 인간 생물학의 많은 영역을 포괄하는 무료 온라인 오픈 소스, 큐레이션된 경로 데이터베이스 [5]
위키패스웨이즈 생물학적 경로를 교정하다. [6]
메타보맵스 공유 대사 경로에 대한 오믹스 데이터를 시각화하다. [7]

적용들

이름 설명 OS 면허증 사이트
바이오타페스트리 유전자 규제 네트워크의 구축, 시각화 및 시뮬레이션을 위한 대화형 도구 다중 형식(Java 기반) LGPL [8]
사이토스케이프 데이터 통합, 네트워크 시각화 및 분석 다중 형식(Java 기반) LGPL [9]
겐맵 경로의 맥락에서 유전 데이터를 시각화하고 분석한다. 창문들 아파치 라이선스 [10]
매트랩 동적 생물학적 시스템의 모델링, 시뮬레이션 및 분석을 위한 도구 Windows, Linux, MacOS 소유권 [11]
메가 무료, 온라인, 오픈 소스, 유전체 분석, 도면 등 Windows/DOS-Win/Mac/리눅스 셰어웨어 [12]
경로비시오 생물학적 경로를 표시하고 편집하는 도구 다중 형식(Java 기반) 아파치 라이선스 [13]
인크로맵 경로에서 실험 데이터의 합체 및 공동 시각화를 위한 도구 다중 형식(Java 기반) LGPL [14]
경로 보기 경로 기반 데이터 통합 및 시각화, 사용하기 쉽고 경로 분석에 통합 멀티플랫폼(R/바이오콘덕터) GPL [15] [16]
시스트립 생물학적 네트워크의 맥락에서 시계열 데이터의 분석 Windows, Linux LGPL, GPL [17]

참조

  1. ^ Koblitz, Julia; Schomburg, Dietmar; Neumann-Schaal, Meina (2020). "MetaboMAPS: Pathway sharing and multi-omics data visualization in metabolic context". F1000Research. 9: 288. doi:10.12688/f1000research.23427.2. PMC 7383707. PMID 32765840.