할로아르쿨라
Haloarcula할로아르쿨라 | |
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속: | 할로아르쿨라 |
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헤일로아큘라 제네라[2]
후일라큘라 종은 극도의 할로필릭 고고학이다.그들은 TGD-2 극지방질의 특정 파생상품이 존재하여 할로박테리아과 계열의 다른 제네라와 구별된다.현재 인정된 7종의 종은 H. vallismortis, H. marismortui, H. hispanica, H. japonica, H. argentinensis, H. mukohataei, H. quadrata 등 7종이다.H. 쿼드라타는 2004년까지만 해도 감별할 수 없을 것으로 여겨졌던 후광류인 할로카드라툼 월스비이를 연구자들이 배양하려 할 때 처음 격리되었다.H. 쿼드라타는 주로 평평하고 사각형 모양의, 다소 플롬픽셀을 가지고 있다.[3]H. marismortui는 지금까지 결정화된 두 개의 원핵성 큰 리보솜 아유니트 중 하나를 가지고 있다.다른 하나는 다이노코쿠스 라디오두란스다.null
Haloarcula 종은 40–45 °C에서 최적으로 자란다.성장은 정사각형이나 삼각형 모양으로 65개까지의 세포로 이루어진 시트에서 자주 나타난다.null
할로아르쿨라 마리스모르투이
형태학
Haloarcula marismortui는 그람 음의 고고학자로 세포 크기가 1.0-2.x 2.0-3.0μm(지름 x 길이)이다.세포는 직사각형의 짧은 막대로서 나타나는 편모형이다.H. marismortui는 아르카엘룸을 경유하는 운동성이며 트리글리코실, 디에테르 지질, 당단백질 등으로 구성된 세포막을 가지고 있다.[4]null
신진대사
H. marismortui는 글리콜리시스(glycolisisis)를 이용하는 에어로빅 화학조직을 말하는데, 영양소의 파괴를 위해 변형된 Entner-Doudaroff 통로다.H. marismortui는 질소, 대사 탄소, 산을 부산물로 생산하면서 포도당, 자당, 과당, 글리세롤, 말산염, 아세테이트 & 숙사인과 같은 에너지원을 이용한다.질산염을 전자 수용기로 사용함으로써 혐기적으로 자랄 수도 있다.[4]null
게놈 특성
H. marismortui의 게놈은 9개의 순환 복제체로 구성되어 있으며, 각각의 G+C 내용은 54%에서 62%[5]까지 다양하다.H. marismortui는 4,366개의 유전자와 4,274,642개의 염기쌍(Strain ATCC 43049)을 함유하고 있다.[6]null
생태학
해비타트
헤일로아큘라 종은 염호, 해양 솔턴, 식염수 토양과 같은 중립적인 식염수 환경에서 발견된다.할로바르쿨라과는 다른 핼로박테리아과와 마찬가지로 성장을 위해서는 최소 1.5 M NaCl이 필요하지만 2.0~4.5 M NaCl에서 최적으로 성장한다.[7]할로아르쿨라 마리스모르투이는 극도의 할로파일로 여겨져 사해로부터 고립되어 왔다.[5]H. marismortui는 40~50°C 사이의 온도 최적화와 5.5~8.0의 pH 범위를 가지고 있다. 성장은 5~35%에 이르는 광범위한 NaCl 농도에서 발생할 수 있으며, 최적의 성장률은 15~25%[4]이다.H. marismortui 게놈에서 발견되는 환경 규제 유전자의 수가 유난히 많다는 것은 다른 종류의 할로박테리움보다 극한 환경에서의 적합성이 높다는 것을 시사한다.[5]null
환경 적응성
H. marismortui는 Opsin단백질 "Sop I&Ⅱ, Hop, Bop"을 포함한 센서와 조절기 역할을 하는 다영역 단백질(49)의 대가족을 암호화하고 있다.이 단백질들은 생리적 이온 농도를 유지하고, 광축을 촉진하며, 양성자 구배를 통해 화학 에너지를 생성하는데 도움을 준다.[5]H. marismortui는 환경 스트레스에서 같은 기능을 수행하는 100개 이상의 에코파롤로그를 보유하고 있으며, 이 유전자는 환경 적응력을 유지하는 데 도움을 준다.복수의 유전자가 온도조절(rrnA/B/C)과 세포운동성(FlaA2 & FlaB)에 인자를 갖는 것으로 나타났다.[8]H. marismortui는 환경 규제자와 센서의 역할을 하는 다단백질(49)의 대가족을 암호로 한다.[5]이것은 H. 마리모르투이가 매우 가변적인 환경 조건에서도 살아남을 수 있게 해준다.null
퓨처 리서치
높은 환경 적응성은 H. marismortui를 환경 정화에서 환경 감각 유전자를 활용할 수 있는 잠재력을 가진 미래 생물 매개 연구의 이상적인 후보자로 만든다.[5]null
참조
- ^ Haloarcula의 NCBI 웹 페이지를 참조하십시오.에서 추출된 데이터"NCBI taxonomy resources". National Center for Biotechnology Information. Retrieved 2007-03-19.
- ^ Oren, Aharon (2014), Rosenberg, Eugene; DeLong, Edward F.; Lory, Stephen; Stackebrandt, Erko (eds.), "The Family Halobacteriaceae", The Prokaryotes: Other Major Lineages of Bacteria and The Archaea, Berlin, Heidelberg: Springer, pp. 41–121, doi:10.1007/978-3-642-38954-2_313, ISBN 978-3-642-38954-2, retrieved 2021-11-17
- ^ Oren, A.; Ventosa, A.; Gutierrez, M. C.; Kamekura, M. (1999). "Haloarcula quadrata sp. nov., a square, motile archaeon isolated from a brine pool in Sinai (Egypt)". International Journal of Systematic Bacteriology. 49 (3): 1149–1155. doi:10.1099/00207713-49-3-1149. PMID 10425773.
- ^ a b c Oren, Aharon (2014), Rosenberg, Eugene; DeLong, Edward F.; Lory, Stephen; Stackebrandt, Erko (eds.), "The Family Halobacteriaceae", The Prokaryotes: Other Major Lineages of Bacteria and The Archaea, Berlin, Heidelberg: Springer, pp. 41–121, doi:10.1007/978-3-642-38954-2_313, ISBN 978-3-642-38954-2, retrieved 2021-11-17
- ^ a b c d e f Baliga, Nitin S.; Bonneau, Richard; Facciotti, Marc T.; Pan, Min; Glusman, Gustavo; Deutsch, Eric W.; Shannon, Paul; Chiu, Yulun; Weng, Rueyhung Sting; Gan, Rueichi Richie; Hung, Pingliang (2004-11-01). "Genome sequence of Haloarcula marismortui: A halophilic archaeon from the Dead Sea". Genome Research. 14 (11): 2221–2234. doi:10.1101/gr.2700304. ISSN 1088-9051. PMC 525680. PMID 15520287.
- ^ "Haloarcula marismortui". NCBI. Retrieved 2021-11-22.
- ^ Haloarcula에서 NCBI 웹 페이지를 참조하십시오.에서 추출된 데이터
- ^ Syutkin, Alexey S.; Pyatibratov, Mikhail G.; Galzitskaya, Oxana V.; Rodríguez-Valera, Francisco; Fedorov, Oleg V. (2014-03-01). "Haloarcula marismortui archaellin genes as ecoparalogs". Extremophiles. 18 (2): 341–349. doi:10.1007/s00792-013-0619-4. ISSN 1433-4909.
추가 읽기
- Torreblanca M, Rodriquez-Valera F, Juez G, Ventosa A, Kamekura M, Kates M (1986). "Classification of non-alkaliphilic halobacteria based on numerical taxonomy and polar lipid composition, and description of Haloarcula gen. nov. and Haloferax gen.nov". Syst. Appl. Microbiol. 8 (1–2): 89–99. doi:10.1016/s0723-2020(86)80155-2.
- Oren A, Ventosa A (2000). "International Committee on Systematic Bacteriology Subcommittee on the taxonomy of Halobacteriaceae. Minutes of the meetings, 16 August 1999, Sydney, Australia". Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 50 (3): 1405–1407. doi:10.1099/00207713-50-3-1405. PMID 10843089.
- Javor B, Requadt C, Stoeckenius W (1982). "Box-shaped halophilic bacteria". J. Bacteriol. 151 (3): 1532–1542. doi:10.1128/jb.151.3.1532-1542.1982. PMC 220435. PMID 6286602.
외부 링크
- Haloarcula에 대한 NCBI 분류법 페이지
- Haloarcula에 대한 생명의 나무 분류법 페이지 검색
- Haloarcula에 대한 Search Perces2000 페이지
- Haloarcula용 MicrobeWiki 페이지
- Haloarcula에 대한 LPSN 페이지
- BacDive의 Haloarcula - 박테리아 다양성 메타다타베이스