파에칼리박테리움

Faecalibacterium
파에칼리박테리움
과학적 분류
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패밀리:
속:
파에칼리박테리움

던컨 외, 2002년
종:
프라우스니치
이항식 이름
파에칼리박테리움 프라우스니치
(Hauduroy et al., 1937) Duncan et al., 2002

페칼리박테리움은 박테리아의 속이다.그것의 유일한 알려진 종인 Faecalibacterium prausnitzi는 그램 양성,[1] 중소필릭, 막대 모양,[2] 혐기성으로[3], 인간의 내장 마이크로바이오타에서 가장 풍부하고 중요한 균등 박테리아 중 하나이다.그것은 비스포어 형성과 운동성이 아니다.[4]이 박테리아는 식이섬유의 발효를 통해 부티레이트 및 기타 쇼트체인 지방산을 생산한다.

역사

이전에 후소박테리움의 일원으로 여겨졌던 이 박테리아는 독일의 박테리아학자 오토 프라우스니츠를 기리기 위해 이름이 붙여졌다.2002년에는 고립체로부터의 페이칼리박테리움 프라우스니치균종(Faecalibacterium prausnitzii)이 포함된 자체 속(Faecalibacterium)으로 재분류할 것을 제안받았는데, 이는 고립체로부터의 페이칼리박테리움 분석 결과 후소박테리움과 거리가 멀 뿐이며 클로스트리디움 군집 4의 더 가까운 구성원으로 나타났다.[5]

유전학

Faecalibacterium prausnitzii는 길이 2,868,932bp의 게놈을 가지고 있으며 GC-함유량은 56.9%이다.이 박테리아는 77개의 RNA 인코딩 유전자를 포함한 2,707개의 코딩 시퀀스를 가지고 있는 것으로 밝혀졌다.[6]128개의 대사 경로가 재건되었으며 27개의 단백질 복합체와 64개의 tRNA가 재건되었다.[7]계통적으로 F. prausnitzi의 변종은 계통조직 I과 II를 구성한다.M에 의해 고립된 이 종의 새로운 고립의 대부분은.탄위어 칸은 필로그룹 2세에 속한다.[8]이 박테리아가 생산한 단백질은 항염증 효과와 연관되어 있다.[9]

임상 관련성

건강한 성인의 경우 파칼리박테리움 프라우스니츠이는 장내 세균의 5% 이상을 대표해 가장 흔한 장내 세균 중 하나로 꼽힌다.그것은 항염증 성질을 가지고 있고, 이질로 이어지는 장내 세균의 불균형을 개선할 수 있다.[10]장내 F.프라우스니츠이(F. prausnitsi)의 정상치보다 낮은 수치는 크론병, 비만, 천식, 주요 우울증 등과 연관되어 있으며,[11][12][13][14] 평소보다 높은 수치는 건선과 연관되어 있다.[15]Faecalibacterium prausnitzi장막 기능을 개선할 수 있다.[16]

염증성 장질환

크론병에서 2015년 현재 대부분의 연구에서는 F. prausnitsi의 수치가 감소했다는 것을 발견했다;[17] 이는 대변과 점막 샘플 모두에서 발견되었다.[18]그러나 산소에 민감하고 장에 전달하기 어려운 까다로운 유기체다.[18]

크론즈에서 해방을 유도하는 것으로 알려진 전용 장내 영양분이 대응자 F.프라우스니츠이를 감소시키는 것으로 나타났다.[19]

참조

  1. ^ Martín R, Miquel S, Benevides L, Bridonneau C, Robert V, Hudault S, Chain F, Berteau O, Azevedo V, Chatel JM, Sokol H, Bermúdez-Humarán LG, Thomas M, Langella P (2017). "F. prausnitzii as a Next-Generation Probiotic". Frontiers in Microbiology. 8: 1226. doi:10.3389/fmicb.2017.01226. PMC 5492426. PMID 28713353.
  2. ^ Martín R, Miquel S, Benevides L, Bridonneau C, Robert V, Hudault S, Chain F, Berteau O, Azevedo V, Chatel JM, Sokol H, Bermúdez-Humarán LG, Thomas M, Langella P (2017). "F. prausnitzii as a Next-Generation Probiotic". Frontiers in Microbiology. 8: 1226. doi:10.3389/fmicb.2017.01226. PMC 5492426. PMID 28713353.
  3. ^ Khan MT, Duncan SH, Stams AJ, van Dijl JM, Flint HJ, Harmsen HJ (August 2012). "The gut anaerobe Faecalibacterium prausnitzii uses an extracellular electron shuttle to grow at oxic-anoxic interphases". The ISME Journal. 6 (8): 1578–85. doi:10.1038/ismej.2012.5. PMC 3400418. PMID 22357539.
  4. ^ Bag S, Ghosh TS, Das B (November 2017). "Faecalibacterium prausnitzii Isolated from the Gut of a Healthy Indian Adult". Genome Announcements. 5 (46). doi:10.1128/genomeA.01286-17. PMC 5690339. PMID 29146862.
  5. ^ Duncan SH, Hold GL, Harmsen HJ, Stewart CS, Flint HJ (November 2002). "Growth requirements and fermentation products of Fusobacterium prausnitzii, and a proposal to reclassify it as Faecalibacterium prausnitzii gen. nov., comb. nov". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52 (Pt 6): 2141–6. doi:10.1099/00207713-52-6-2141. PMID 12508881.
  6. ^ Bag S, Ghosh TS, Das B (November 2017). "Faecalibacterium prausnitzii Isolated from the Gut of a Healthy Indian Adult". Genome Announcements. 5 (46). doi:10.1128/genomeA.01286-17. PMC 5690339. PMID 29146862.
  7. ^ "Summary of Faecalibacterium prausnitzii, Strain A2-165, version 21.5". BioCyc.
  8. ^ Lopez-Siles M, Khan TM, Duncan SH, Harmsen HJ, Garcia-Gil LJ, Flint HJ (January 2012). "Cultured representatives of two major phylogroups of human colonic Faecalibacterium prausnitzii can utilize pectin, uronic acids, and host-derived substrates for growth". Applied and Environmental Microbiology. 78 (2): 420–8. Bibcode:2012ApEnM..78..420L. doi:10.1128/AEM.06858-11. PMC 3255724. PMID 22101049.
  9. ^ Quévrain E, Maubert MA, Michon C, Chain F, Marquant R, Tailhades J, Miquel S, Carlier L, Bermúdez-Humarán LG, Pigneur B, Lequin O, Kharrat P, Thomas G, Rainteau D, Aubry C, Breyner N, Afonso C, Lavielle S, Grill JP, Chassaing G, Chatel JM, Trugnan G, Xavier R, Langella P, Sokol H, Seksik P (March 2016). "Identification of an anti-inflammatory protein from Faecalibacterium prausnitzii, a commensal bacterium deficient in Crohn's disease". Gut. 65 (3): 415–425. doi:10.1136/gutjnl-2014-307649. PMC 5136800. PMID 26045134.
  10. ^ Miquel S, Martín R, Rossi O, Bermúdez-Humarán LG, Chatel JM, Sokol H, Thomas M, Wells JM, Langella P (June 2013). "Faecalibacterium prausnitzii and human intestinal health". Current Opinion in Microbiology. 16 (3): 255–61. doi:10.1016/j.mib.2013.06.003. PMID 23831042.
  11. ^ Sokol H, Pigneur B, Watterlot L, Lakhdari O, Bermúdez-Humarán LG, Gratadoux JJ, Blugeon S, Bridonneau C, Furet JP, Corthier G, Grangette C, Vasquez N, Pochart P, Trugnan G, Thomas G, Blottière HM, Doré J, Marteau P, Seksik P, Langella P (October 2008). "Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 105 (43): 16731–6. doi:10.1073/pnas.0804812105. PMC 2575488. PMID 18936492.
  12. ^ "Bacterium 'to blame for Crohn's'". BBC News. 2008-10-21. Retrieved 2008-10-21.
  13. ^ Newton, Ryan J.; McLellan, Sandra L.; Dila, Deborah K.; Vineis, Joseph H.; Morrison, Hilary G.; Eren, A. Murat; Sogin, Mitchell L. (May 2015). "Sewage Reflects the Microbiomes of Human Populations". mBio. 6 (2): e02574-14. doi:10.1128/mBio.02574-14. PMC 4358014. PMID 25714718.
  14. ^ Jiang H, Ling Z, Zhang Y, Mao H, Ma Z, Yin Y, Wang W, Tang W, Tan Z, Shi J, Li L, Ruan B (August 2015). "Altered fecal microbiota composition in patients with major depressive disorder". Brain, Behavior, and Immunity. 48: 186–94. doi:10.1016/j.bbi.2015.03.016. PMID 25882912.
  15. ^ Codoñer FM, Ramírez-Bosca A, Climent E, Carrión-Gutierrez M, Guerrero M, Pérez-Orquín JM, Horga de la Parte J, Genovés S, Ramón D, Navarro-López V, Chenoll E (February 2018). "Gut microbial composition in patients with psoriasis". Scientific Reports. 8 (1): 3812. Bibcode:2018NatSR...8.3812C. doi:10.1038/s41598-018-22125-y. PMC 5830498. PMID 29491401.
  16. ^ Stenman LK, Burcelin R, Lahtinen S (2015). "Establishing a causal link between gut microbes, body weight gain and glucose metabolism in humans - towards treatment with probiotics". Beneficial Microbes. 7 (1): 11–22. doi:10.3920/BM2015.0069. PMID 26565087.
  17. ^ Wright EK, Kamm MA, Teo SM, Inouye M, Wagner J, Kirkwood CD (June 2015). "Recent advances in characterizing the gastrointestinal microbiome in Crohn's disease: a systematic review". Inflammatory Bowel Diseases. 21 (6): 1219–28. doi:10.1097/MIB.0000000000000382. PMC 4450900. PMID 25844959.
  18. ^ a b El Hage R, Hernandez-Sanabria E, Van de Wiele T (2017-09-29). "Emerging Trends in "Smart Probiotics": Functional Consideration for the Development of Novel Health and Industrial Applications". Frontiers in Microbiology. 8: 1889. doi:10.3389/fmicb.2017.01889. PMC 5626839. PMID 29033923.
  19. ^ Edwards, Christine A.; McGrogan, Paraic; Blaut, Michael; Hanske, Laura; Bertz, Martin; Loman, Nick; Quince, Christopher; Hansen, Richard; Russell, Richard (2014-07-01). "Role of Faecalibacterium prausnitzii in Crohn's Disease: Friend, Foe, or Does Not Really Matter?". Inflammatory Bowel Diseases. 20 (7): E18–E19. doi:10.1097/MIB.0000000000000079. ISSN 1078-0998. PMID 24859302.