이중 플래시 플롯

Dual-flashlight plot
높은 처리량 선별 데이터 집합을 보여주는 이중 플래시 플롯.

통계에서 이중 플래시 플롯 플롯은 관심의 비교를 나타내는 대조도 변수의 평균에 대해 표준화된 평균(SMCV)이 표시된 산점도의 한 유형이다.[1]일반적으로 사용되는 이중 플래시 플롯은 마이크로레이와 고투과 선별 연구와 같은 고투과 실험에서 두 그룹 간의 차이에 대한 것으로, 우리는 expe로 조사된 모든 유전자 또는 화합물(siRNA 또는 작은 분자 등)에 대해 각각 y축과 x축에 SSMD 대 평균 로그 접힘 변화를 플롯한다.리멘트.[1] 전체적으로 이중 플래시 플롯의 포인트는 머리가 두 개인 손전등의 빔처럼 생겼기 때문에 이중 플래시 플롯이라는 이름이 붙었다.[1]

이중 플래시 플롯을 통해 우리는 어떻게 유전자나 화합물이 실제 크기의 각 범주에 분포하는지 알 수 있다.한편, 우리는 또한 각각의 유전자나 화합물에 대한 평균적인 접힘 변화를 볼 수 있다.이중 플래쉬라이트 플롯은 화산 플롯과 비슷하다.화산 그림에서는 SMCV 또는 SSMD 대신 p-값(또는 q-값[clarification needed])이 평균 접이식 변화에 대해 표시된다.[3]p-값(또는 q-값)보다 SMCV를 사용하는 이점은 유전자 또는 화합물에 0이 아닌 실제 효과가 있는 경우 추정 SMCV는 모집단 값으로 이동하는 반면, 표본 크기가 증가하면 평균 차이(또는 0 대비 평균)를 검사하는 p-값(또는 q-값)은 0으로 된다는 것이다.[4]따라서 SMCV의 값은 비교 가능한 반면 p-값 또는 q-값의 값은 표본 크기가 다른 실험에서는 비교가 되지 않는 반면, 특히 조사된 유전자나 화합물이 정확히 0의 영향을 미치지 않는 경우 더욱 그러하다.이중 플래쉬라이트 플롯은 화산 플롯과 비교했을 때 SMCV가 가지고 있는 것과 동일한 장점을 가지고 있다.

참고 항목

추가 읽기

참조

  1. ^ a b c Zhang XHD (2010). "Assessing the size of gene or RNAi effects in multifactor high-throughput experiments". Pharmacogenomics. 11 (2): 199–213. doi:10.2217/PGS.09.136. PMID 20136359.
  2. ^ Jin W, Riley RM, Wolfinger RD, White KP, Passador-Gurgel G, Gibson G (2001). "The contributions of sex, genotype and age to transcriptional variance in Drosophila melanogaster". Nature Genetics. 29 (4): 389–95. doi:10.1038/ng766. PMID 11726925. S2CID 16841881.
  3. ^ Cui X, Churchill GA (2003). "Statistical tests for differential expression in cDNA microarray experiments". Genome Biology. 4 (4): 210. doi:10.1186/gb-2003-4-4-210. PMC 154570. PMID 12702200.
  4. ^ Zhang XHD (2010). "Strictly standardized mean difference, standardized mean difference and classical t-test for the comparison of two groups". Statistics in Biopharmaceutical Research. 2 (2): 292–99. doi:10.1198/sbr.2009.0074. S2CID 119825625.