코드 얼라이너

CodonCode Aligner
코드 얼라이너
개발자코돈코드 코퍼레이션
안정된 릴리스
4.2.5 / 2013
운영 체제Mac OS X, Windows
유형생물정보학
면허증.상업용, 한정 사용 무료(표시 및 편집 기능 포함)
웹 사이트http://www.codoncode.com/aligner

CodonCode Aligner는 Mac OS X 및 Windows에서 DNA 시퀀스 어셈블리, 시퀀스 정렬 및 편집을 위한 상용 애플리케이션입니다.

특징들

특징으로는 크로마토그램 편집, 엔드 클리핑 및 벡터 트리밍, 시퀀스 조립 및 콘티그 편집, 게놈 템플릿에 대한 cDNA 정렬 및 편집, ClusteralW, MUSCLE 또는 내장 알고리즘에 의한 콘티그 상호 정렬, 헤테로 접합 단일 뉴클레오티드 폴리몰프 검출 등이 있습니다.hism, 헤테로 접합 삽입 및 삭제 분석, 온라인 BLAST 검색 시작, 제한 분석(제한 컷 부위 찾기 및 보기), 추적 샤프닝, Pred, Phrap, ClusteralW 및 MUSCLE 지원.

역사

CodonCode Aligner의 첫 번째 베타 버전은 2003년 4월에 출시되었고, 첫 번째 정식 버전은 2003년 6월에 출시되었습니다.주요 업그레이드는 2003년, 2004년, 2005년, 2006년, 2007년 및 2008년에 출시되었습니다.

2009년 4월, CodonCode Aligner는 400개가 넘는 과학 출판물에 인용되었습니다.인용문은 HIV 연구,[1][2][3] 생물 지리학 및 환경 생물학,[4][5] DNA 메틸화 연구,[6] 유전병,[7][8][9] 임상 미생물학,[10][11] 진화 연구 및 계통학 [12][13][14]등 다양한 생물의학 연구 분야를 다룬다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Bailey JR, Sedaghat AR, Kieffer T, Brennan T, Lee PK, Wind-Rotolo M, Haggerty CM, Kamireddi AR, Liu Y, Lee J, Persaud D, Gallant JE, Cofrancesco J, Quinn TC, Wilke CO, Ray SC, Siliciano JD, Nettles RE, Siliciano RF (2006). "Residual Human Immunodeficiency Virus Type 1 Viremia in Some Patients on Antiretroviral Therapy Is Dominated by a Small Number of Invariant Clones Rarely Found in Circulating CD4+ T Cells'Ć". J Virol. 80 (13): 6441–6457. doi:10.1128/JVI.00591-06. PMC 1488985. PMID 16775332.
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  14. ^ Stoeck T, Kasper J, Bunge J, Leslin C, Ilyin V, Epstein S (2007). "Protistan Diversity in the Arctic: A Case of Paleoclimate Shaping Modern Biodiversity?". PLOS ONE. 2 (8): e728. Bibcode:2007PLoSO...2..728S. doi:10.1371/journal.pone.0000728. PMC 1940325. PMID 17710128. open access

외부 링크