맥벡터
MacVector| 개발자 | 맥벡터 주식회사 |
|---|---|
| 안정된 릴리스 | |
| 운영 체제 | MacOS |
| 플랫폼 | X코드 |
| 유형 | 생물정보학 |
| 면허증. | 상업의 |
| 웹 사이트 | macvector.com |
MacVector는 Mac OS X를 실행하는 Apple Macintosh 컴퓨터를 위한 상용 시퀀스 분석 응용 프로그램입니다.이것은 분자생물학자들이 실험실에서 그들의 실험을 분석, 설계, 연구 및 문서화하는 데 사용하는 것을 목적으로 한다.MacVector 18.1은 인텔 및 Apple Silicon Mac에서 실행할 수 있는 유니버설 바이너리입니다.
특징들
MacVector는 단일 시퀀스 편집기, 다중 시퀀스 정렬 편집기 및 콘티그 편집기를 포함하여 다양한 시퀀스 편집기에 연결된 시퀀스 분석 알고리즘 모음입니다.MacVector는 최소한의 창과 단계를 사용하여 모든 기능에 액세스하려고 합니다.기능은 다음과 같습니다.
- 시퀀스 정렬(ClustalW, Muscle 및 T-Coffee) 및 편집.
- 후속 검색 및 ORF(Open Reading Frame) 분석.
- 계통수 구축 UPGMA, 부트스트래핑 및 컨센서스 트리와 네이버 결합
- 온라인 데이터베이스 검색 - Genbank, PubMed, UniProt 등의 NCBI에서 공용 데이터베이스를 검색합니다.
- 온라인 BLAST 검색을 수행합니다.
- 단백질 분석.
- 콘티그 조립 및 크로마토그램 편집
- 게놈 템플릿에 대한 cDNA 정렬
- DNA 대 DNA, 단백질 대 단백질 및 DNA 대 단백질의 점 그림을 만듭니다.
- 제한 분석 - 제한 컷 사이트를 찾아 봅니다.유전자를 벡터로 복제하기 위해 소화 조각을 사용합니다.다중 fragment 연결을 허용하는 요약된 fragment의 이력을 저장합니다.
- PCR 프라이머 설계 - 간단한 프라이머 설계 및 테스트.프라이머3도 사용
- 아가로스 겔 시뮬레이션.
- CRISPR SARH 분석.
MacVector에는 Pred, phrap, Bowtie, SPAdes, Velvet 및 Cross match를 사용하는 Assembly라는 콘티그 어셈블리 플러그인이 있습니다.
버전 13.0.1에서 MacVector는 릴리스 간 업데이트에 Sparkle을 사용합니다.
역사
맥벡터는 1994년 [1]IBI에 의해 처음 개발되었습니다.그것은 코닥에 의해 인수되었고,[2][3] 이어서 1996년에 옥스포드 분자(Oxford Molecular)에 의해 인수되었다.옥스포드 분자는 2001년에 [4]액셀리에 합병되었다.2007년 [5]1월 1일에 MacVector, Inc.에 인수되었습니다.
레퍼런스
- ^ "MacVector: Macintosh용 통합 시퀀스 분석 프로그램"올슨 SA.Mol Biol.(1994) 25,195-201.
- ^ "DNA Sequencing Software - Special Ad Section". Science. 7 June 1996.
- ^ http://findarticles.com/p/articles/mi_hb197/is_/ai_n5566980#[데드링크]
- ^ "About Accelrys, including company leadership, recognition, and news". Accelrys.com. 2009-05-04. Archived from the original on 2010-01-09. Retrieved 2012-07-26.
- ^ "Accelrys - Additional Products". accelrys.com. Archived from the original on 2008-06-07. Retrieved 2012-07-24.
