아비다

Avida
아비다
Avida 2.6 screenshot.png
Avida 2.6에 대한 지도 탭
원본 작성자찰스 오브리아, 크리스 아다미
개발자샤를 오브리아
안정적 해제
2.14.0 / 2014년 2월 6일; 8년 전(2014-02-06)[1]
기록 위치C++, 목표-C
운영 체제Microsoft Windows 7 이상, MacOS 10.8 이상
유형인공생명체
면허증LGPL

아비다는 자기복제·진화하는 컴퓨터 프로그램(디지털 유기체)의 진화생물학을 연구하기 위한 인공생명 소프트웨어 플랫폼이다.아비다는 미시간 주립대학의 찰스 오프리아의 디지털 에볼루션 연구소에 의해 활발하게 개발 중에 있다; 아비다의 첫 번째 버전은 오프리아, 크리스 아다미, C에 의해 1993년에 설계되었다.칼텍의 티투스 브라운은 그 후 여러 차례에 걸쳐 오프리아에 의해 완전히 재설계되었다.이 소프트웨어는 원래 티에라 시스템에서 영감을 얻었다.

설계원리

티에라는 컴퓨터 자원, 특히 프로세서(CPU) 시간과 메인 메모리에 대한 접근을 위해 경쟁하는 컴퓨터 프로그램을 도입함으로써 진화 시스템을 시뮬레이션했다.이 점에서 그것은 코어 워즈와 비슷했지만, 시뮬레이션에서 실행 중인 프로그램들이 스스로 수정하여 진화할 수 있다는 점에서 차이가 있었다.티에라의 프로그램은 인공 생물이었다.[citation needed]

티에라와는 달리, 아비다는 모든 디지털 유기체에게 자신의 보호된 기억 영역을 할당하고, 그것을 별도의 가상 CPU로 실행한다. 기본적으로 다른 디지털 유기체는 읽거나 쓰기를 위해서도 이 기억 공간에 접근할 수 없고, 자신의 기억 공간에 없는 코드를 실행할 수 없다.

두 번째 주요한 차이점은 다른 유기체의 가상 CPU가 다른 속도로 실행될 수 있다는 것이다. 예를 들어, 한 유기체가 다른 유기체와 같은 시간 간격에 두 배의 명령을 실행하는 것과 같은 것이다.가상 CPU가 실행되는 속도는 여러 요인에 의해 결정되지만, 가장 중요한 것은 유기체가 수행하는 작업, 즉 유기체가 보너스로 추가 CPU 속도를 얻기 위해 수행할 수 있는 논리 연산된다.

연구에 사용하다

아다미, 오프리아는 타인과 공동으로 아비다를 이용해 디지털 진화 연구를 진행해왔으며, 과학전문지 네이처 앤 사이언스(Nature and Science)는 4편의 논문을 발표했다.

2003년 논문 "복잡한 특성의 진화 기원"은 단순한 비트 연산으로부터 수학적 동일 연산의 진화를 설명한다.[2]

교육에 사용

아비다-ED
원본 작성자제프 클룬
개발자다이앤 블랙우드
안정적 해제
3 / 2021년 10월 10일; 4개월 전(2021-10-10)[3]
기록 위치C++, 자바스크립트
유형인공생명체
면허증GPL
웹사이트주: avida-ed.msu.edu, 미러: avida-ed-mirror1.beacon-center.org

아비다-ED 프로젝트(Avida-ED)는 고등학교 및 학부 대학 수준의 진화 교육 지도에 사용하기에 적합한 단순한 그래픽 사용자 인터페이스 내에서 아비다 소프트웨어 플랫폼을 사용하며, 자유롭게 이용할 수 있는 소프트웨어, 문서화, 튜토리얼, 레슨 계획 및 기타 강좌 자료를 제공한다.[4][5]아비다-ED 소프트웨어는 브라우저에서 웹 애플리케이션으로 실행되며, 자바스크립트와 아비다에서 구현된 사용자 인터페이스가 엠시센을 이용하여 자바스크립트에 컴파일되어 있어 교실에서 흔히 사용하는 장치와 폭넓게 호환이 가능하다.[6]이러한 접근방식은 학생들의 진화에 대한 이해도를 높이는 데 효과가 있는 것으로 나타났다.[7][8][9]아비다-ED 프로젝트는 2017 국제인공생명교육학회 및 아웃리치상 수상작이다.[10]

참고 항목

참조

  1. ^ "Avida Digital Life Platform download". sourceforge.net. Retrieved 2021-03-27.
  2. ^ Lenski, R. E.; Ofria, C.; Pennock, R. T.; Adami, C. (2003). "The evolutionary origin of complex features" (PDF). Nature. 423 (6936): 139–144. Bibcode:2003Natur.423..139L. doi:10.1038/nature01568. PMID 12736677. S2CID 4401833.
  3. ^ "Avida-ED User Interface". github.com. Retrieved 2021-10-11.
  4. ^ Smith, James J.; Johnson, Wendy R.; Lark, Amy M.; Mead, Louise S.; Wiser, Michael J.; Pennock, Robert T. (2016). "An Avida-ED digital evolution curriculum for undergraduate biology". Evolution: Education and Outreach. 9 (1). doi:10.1186/s12052-016-0060-0. ISSN 1936-6426.
  5. ^ Anonymous (5 February 2018). "Online tool speeds up evolution education". ScienceDaily. Retrieved 3 July 2021.
  6. ^ Taylor, Tim; Auerbach, Joshua E.; Bongard, Josh; Clune, Jeff; Hickinbotham, Simon; Ofria, Charles; Oka, Mizuki; Risi, Sebastian; Stanley, Kenneth O.; Yosinski, Jason (2016). "WebAL Comes of Age: A Review of the First 21 Years of Artificial Life on the Web". Artificial Life. 22 (3): 364–407. doi:10.1162/ARTL_a_00211. hdl:2241/00154082. ISSN 1064-5462.
  7. ^ Pennock, Robert T.; Smith, James J.; Mead, Louise S.; Richmond, Gail; Lark, Amy (2018). "Exploring the Relationship between Experiences with Digital Evolution and Students' Scientific Understanding and Acceptance of Evolution". The American Biology Teacher. 80 (2): 74–86. doi:10.1525/abt.2018.80.2.74. ISSN 0002-7685.
  8. ^ Abi Abdallah, Delbert S.; Fonner, Christopher W.; Lax, Neil C.; Babeji, Matthew R.; Palé, Fatimata A. (2020). "Evaluating the Use of Avida-ED Digital Organisms to Teach Evolution & Natural Selection". The American Biology Teacher. 82 (2): 114–119. doi:10.1525/abt.2020.82.2.114. ISSN 0002-7685.
  9. ^ Pennock, Robert T.; Richmond, Gail; Lark, Amy (2014). "Modeling Evolution in the Classroom". The American Biology Teacher. 76 (7): 450–454. doi:10.1525/abt.2014.76.7.6. ISSN 0002-7685.
  10. ^ Taylor, Tim (16 September 2017). "2017 ISAL Awards: Winners - Artificial Life". Artificial Life. Retrieved 3 July 2021.

외부 링크

아비다가 등장하는 과학 출판물

  • C. Adami와 C.T. Brown(1994), 2D 인공생명 시스템 Avida의 진화적 학습, in: R. Brooks, P. Maes (Eds.), Proc.인공생명 IV, MIT 프레스, 캠브리지, MA, 페이지 377-381. arXiv:adap-org/9405003
  • R. E. Lenski, C. Ofria, T. C. Collier, C.아다미(1999년).디지털 유기체의 게놈 복잡성, 강건성, 유전적 상호작용.자연 400:661-664.
  • C.O. Wilke, J.L. Wang, C. Ofria, R.E. Lenski, C.아다미(2001년).높은 돌연변이 비율의 디지털 유기체의 진화는 가장 평평한 생물체의 생존을 이끈다.자연 412:331-333.
  • R.E.렌스키, C.오프라, R.T 페녹, C.아다미(2003년).복잡한 특성의 진화적 기원.자연 423:139-145.
  • S.S. Chow, C.O. Wilke, C. Ofria, R.E. Lenski, C.아다미(2004년).디지털 유기체 자원 경쟁에서의 적응형 방사선.과학 305:84-86.
  • J. 클룬, D.미세빅, C.오프리아, R.E.렌스키, S.F.엘레나, R.산후안.자연 선택은 험준한 건강 환경에서 장기 적응을 위한 돌연변이 비율을 최적화하지 못한다.PLoS Computing Biology 4(9): 2008. doi:10.1371/journal.pcbi.1000187
  • Clune J, Goldsby HJ, Ofria C, Pennock RT(2011) 다음을 대상으로 하는 정확한 이타주의를 위한 선택적 압력:포괄적 피트니스 이론의 테스트하기 어려운 측면에 대한 디지털 진화의 증거.왕립 협회의 절차.pdf(fdf)
  • 벤자민 E.베크만, 필립 K.맥킨리, 찰스 오브리아(2007)디지털 유기체에서 적응형 수면 반응의 진화.ECAL 2007 pdf