시조류

Archaeocin

시조균은 [1]시조균군으로부터 파생된 잠재적으로 유용한 항생제의 새로운 유형에 붙여진 이름이다.8개의 아르케오신이 부분적으로 또는 완전히 특징지어졌지만, 수백 개의 아르케오신이 특히 할로아카이아 내에 존재하는 것으로 여겨진다.이러한 고대 단백질 항균제의 생산은 막대 모양의 할로아카이아의 [2]거의 보편적인 특징이다.

이 도메인의 다른 구성원들로부터의 고세균의 유행은 단지 아무도 그것들을 찾지 않았기 때문에 알려지지 않았다.새로운 고고학 발견은 환경으로부터 고고학 유기체의 회복과 재배에 달려있다.예를 들어,[3] 유타 주 동부의 피시 스프링스 국립 야생동물 보호구역에 있는 새로운 초염색 필드 사이트인 윌슨 온천의 샘플은 350개의 할로필성 유기체를 회수했다. 75개의 분리물에 대한 예비 분석 결과 48개는 고고생물이고 27개는 [4]세균이었다.

할로신류

상세 정보:할로신

할로신은 펩타이드( 10 10kDa; '마이크로할로신') 또는 고균류 할로박테리아과(Halobacteriaceae)에 의해 생성되는 단백질(> 10kDa) 항생제로 분류된다.현재까지 알려진 모든 할로신 유전자는 메가플라스미드(> 100kbp)에 암호화되어 있으며 전형적인 후광상피 TATA 및 BRE 프로모터 영역을 가지고 있다.할로신 전사물은 리더리스이며, 아미노 말단 내에 Tat 신호 모티브(인접한 2개의 아르기닌 잔기)가 존재하기 때문에 번역된 사전단백질 또는 사전단백질은 트윈 아르기닌 전위(Tat) 경로를 사용하여 수출될 가능성이 높다.할로신 유전자는 지수적 성장과 정지적 성장 사이의 전환에서 거의 보편적으로 발현된다; 유일한 예외는 지수적 단계에서 유도되는 할로신 H1이다.이와는 대조적으로, 더 큰 할로신 단백질은 열 연성이며 일반적으로 염분을 제거하면 활성을 잃기 때문에 필연적으로 할로겐화성이 있다.

마이크로할로신, 펩티드할로신

현재 단백질 및/또는 유전자 수준에서 HalS8, HalR1, HalC8, HalH7, HalU1의 5가지 펩타이드 할로신이 부분적으로 또는 완전히 특징지어졌다.이러한 항균성 펩타이드는 분자량에서 ~3 ~ 7.4 kDa이며, 아미노산 잔기 36 ~ 76개로 구성되어 있다.2개의 마이크로할로신(HalS8 및 HalC8)은 미지의 기구에 의해 보다 큰 전단백질로부터 단백질 분해 분해되어 제조된다.마이크로할로신은 탈염 및/또는 4°C에서 저장하더라도 활성 상태를 유지하고 열 및 유기 용제에 상당히 둔감한 소수성 펩타이드이다.최초의 마이크로할로신은 미국 [4]UT,[5] 그레이트솔트레이크에서 분리된 특성화되지 않은 할로아카이온 S8a에 의해 생산된 HalS8이었다.

단백질 할로신

두 가지는 단백질 할로신으로 분류할 수 있습니다.HalH1과 HalH4; 나머지 할로신의 분자량은 아직 밝혀지지 않았다.할로신 H1은 스페인 알리칸테 인근 솔턴에서 분리된 Hfx. mediterranei M2a(구주 Xia3)에 의해 생산된다.31kDa 단백질로 열가소성이며 탈염 시 활성을 잃고 할로아카이아 내에서 광범위한 억제를 나타낸다.할로신 H1은 단백질과 유전자 수준에서 아직 특징지어지지 않았다.반면 Hfx. mediterranei R4(ATCC 33500)가 생산한 HalH4도 스페인 알리칸테 인근 솔턴에서 분리된 최초의 [6]할로신이었다.성숙한 HalH4 단백질의 분자량은 34.9kDa(359개의 아미노산)이며, 39.6kDa의 사전단백질에서 처리된다. 처리 메커니즘은 알려져 있지 않다.할로신 H4는 고분해성 할로신이며 막 [4]투과성을 방해할 수 있는 민감한 Hbt. 살리나룸 세포에 흡착됩니다.

술폴로포비아신

Sulfolobus에 의해 생산된 고세균은 그들의 활동이 상등물이 아닌 세포와 주로 연관되어 있기 때문에 할로신과는 완전히 다르다.현재까지 술폴로포비아신 활성의 스펙트럼은 술폴로발레스의 다른 구성원으로 제한되는 것으로 보인다. 술폴로포비아신은 S. solfataricus P1, S. sibatae B12 및 S. islandicus의 비생산주 6개.활동은 고고학살로 보이지만 고고학살은 [4]아니다.술폴로포비아신 생성에 관여하는 2개의 유전자가 S.acidocaldarius와 S. tokodaii에서 확인되었다.술폴로포시린은 항균성 [7]단백질의 새로운 종류를 나타내는 것으로 보인다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Blum P, ed. (2008). Archaea: New Models for Prokaryotic Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-27-1.
  2. ^ O'Connor EM; Shand RF (2002). "Halocins and sulfolobicins: the emerging story of archaeal protein and peptide antibiotics". J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 28 (1): 23–31. doi:10.1038/sj/jim/7000190. PMID 11938468. S2CID 16583426.
  3. ^ Pete Polsgrove; Amy Fleishman Littlejohn; Barry Roberts; Richard F. Shand; Northern Arizona University (June 4–5, 2005). "Wilson Hot Springs - A Desert Hypersaline Salt Marsh Research Site". Archived from the original on 2008-12-17.
  4. ^ a b c d Shand RF; Leyva KJ (2008). "Archaeal Antimicrobials: An Undiscovered Country". Archaea: New Models for Prokaryotic Biology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-27-1.
  5. ^ Price LB; Shand RF (2000). "Halocin S8: a 36-amino-acid microhalocin from the haloarchaeal strain S8a". J. Bacteriol. 182 (17): 4951–8. doi:10.1128/JB.182.17.4951-4958.2000. PMC 111376. PMID 10940040.
  6. ^ Cheung J; Danna KJ; O'Connor EM; Price LB; Shand RF (1997). "Isolation, sequence, and expression of the gene encoding halocin H4, a bacteriocin from the halophilic archaeon Haloferax mediterranei R4". J. Bacteriol. 179 (2): 548–51. doi:10.1128/jb.179.2.548-551.1997. PMC 178729. PMID 8990311.
  7. ^ Ellen AF; Rohulya OV; Fusetti F; Wagner M; Albers SV; Driessen AJ (2011). "The sulfolobicin genes of Sulfolobus acidocaldarius encode novel antimicrobial proteins". J. Bacteriol. 193 (17): 4380–87. doi:10.1128/jb.05028-11. PMC 3165506. PMID 21725003.