ABCDB

ABCdb
ABCDB
내용
묘사원핵 게놈의 ABC 트랜스포터 시스템에 대한 ABCDB 데이터베이스.
데이터형
발동.		ATP결합 카세트(ABC) 트랜스포터
유기체원핵 생물
연락
연구소CNRS 툴루즈 대학교
실험실.LMGM
주요 인용문PMID 16499625
접근
웹 사이트http://www-abcdb.biotoul.fr/
도구들
웹고급 검색, BLAST
여러가지 종류의
큐레이션 정책있음 - 자동 및 수동
북마크 가능
엔티티		네.

ABCdb는 완전히 배열된 고고학 및 박테리아 게놈에 의해 코드화된 아데노신 삼인산 결합 카세트(ABC) 운반체를 위한 생물학적 데이터베이스이다.이 단백질들은 세포로 물질을 운반하는데 중요하고 모든 살아있는 유기체에서 발견됩니다.

ABC 시스템의 생물학적 기능

대부분의 ABC 시스템은 막을 통해 세포(수입기) 또는 외부(수출기)로 화합물을 운반하는 기능을 하며, 이 경우 시스템은 아데노신 삼인산(ATP)의 가수 분해에 의해 에너지를 생성합니다.ABC 수송기는 모든 살아있는 유기체에서 발생한다.

ABC 트랜스포터 시스템은 ATP 결합 카세트와 막 통과 도메인 또는 막 스패닝 도메인의 두 가지 요소로 구성됩니다.이것들은 보통 분리된 단백질이거나 단백질 도메인으로 발생할 수 있다.전형적인 ABC 트랜스포터는 ATP 가수분해를 통해 트랜스포트를 활성화하는 2개의 뉴클레오티드 결합 도메인과 기질을 위한 막 채널로 작용하는 2개의 막 스패닝 도메인으로 구성됩니다.수입업자는 기질을 인식하고 결합하는 용질 결합 단백질을 필요로 한다.

ABC 시스템의 다른 파트너들은 일반적으로 인접한 유전자에 의해 부호화된다.

특징들

ABC 단백질은 다수의 병렬 유전자에 의해 암호화된 슈퍼 패밀리를 형성한다.염기서열 분석은 ABC 슈퍼패밀리의 구성원들이 일반적인 조상 형태에서 벗어나 ABC 단백질을 하위 패밀리로 조직하는 것을 허용했을 수 있다는 것을 보여준다.ABC 시스템을 (하위) 계열로 분류하면 시스템에 의해 운송될 수 있는 기질을 예측하는 데 도움이 될 수 있다.

ABCDB는 다음과 같은 공공 [1]자원입니다.

  • 종의 나무에서 균주를 선택하고 (하위) 과로 분류된 모든 ABC 시스템을 살펴본다.
  • 특정 ABC (하위)족에 대해, 완전히 배열된 원핵 생물의 모든 단백질을 비교한다.
  • 유사한 단백질에 대한 주석을 찾기 위해 염기서열을 사용하여 ABCdb에 대해 폭파한다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Fichant G, Basse MJ, Quentin Y (Mar 2006). "ABCdb: an online resource for ABC transporter repertories from sequenced archaeal and bacterial genomes". FEMS Microbiology Letters. 256 (2): 333–9. doi:10.1111/j.1574-6968.2006.00139.x. PMID 16499625.

외부 링크