NCI-60
NCI-60NCI-60 암세포 라인 패널은 국립암연구소(NCI)가 잠재적 항암 활동을 감지하기 위해 화합물 검사에 사용하는 인간 암세포 라인 60개로 구성된 그룹이다.[1]
목적
선별 절차는 NCI-60 인간 종양 세포 라인 화면(Human Tumor Cell Lines Screen)으로 불리며, NCI의 개발 치료 프로그램(DTP)의 Discovery & Development Services 중 하나이다.[2][3][4] 각 세포 라인에 대한 선별률은 시험 물질의 세포성 및 세포독성 영향이다.[2]
세포 라인의 다양성 때문에, 시험된 화합물들을 그들의 효과 패턴, 유사한 효과 메커니즘에 잠재적으로 해당하는 높은 상관관계로 비교하는 것이 가능하다.[2] 88,000개 이상의 순수 화합물과 34,000개 이상의 조제 추출물이 포함된 데이터베이스와의 자동 비교(2017년[update] 1월 6일 기준)는 BEANCE 도구를 통해 제공되며, 이는 주어진 테스트 물질에 대한 피어슨 상관 계수에 의해 순위가 매겨진 물질의 목록을 보여준다.[5]
분자 대상 프로그램의 특성화에는 동일한 패널이 사용된다. 측정에는 단백질 수준, RNA 측정, 돌연변이 상태 및 효소 활동 수준이 포함된다.[6]
셀 선
이 패널에는 백혈병, 흑색종, 비소세포 폐암, 뇌, 난소, 유방, 대장, 신장, 전립선의 암 등을 나타내는 세포선이 들어 있다.[1][2]
13개의 추가 세포 라인이 선별 프로그램에 사용되도록 평가되며, 그 중 지금까지 소세포 폐암으로 표현되지 않은 두 개의 세포 라인이 있다.[1]
1개(2017년[update] 1월 6일 기준)를 제외한 모든 셀 라인은 추가 셀 라인을 포함한 다른 실험실에서 사용할 수 있다.[1]
오식별 및 오분류
새천년이 시작되는 무렵부터 조사 시점이나 그 이전 시점에서는 여러 개의 셀 라인이 잘못 식별되거나 잘못 분류된 것으로 밝혀졌다.[7][8][9]
원래 유방암 세포선으로 분류된 MDA-MB-435는 흑색종 세포선으로 확인되었다.[7] 추가적으로 조사했을 때, 현재의 MDA-MB-435는 셀 라인 M14와 같은 개인으로부터 파생된 것으로 보였다.[7] 클론 검사를 통해 M14와의 혼동이 MDA-MB-435의 역사에서 개발 치료 프로그램(Development Therapeutics Program)에 설립되기 전에 매우 일찍 일어났다는 것이 밝혀졌다.[7]
원래 유방암 세포 라인으로 분류된 NCI/ADR-RES는 난소 종양 세포 라인으로 확인되었다.[8] NCI/ADR-RES는 셀 라인 OVCAR-8에서 어느 시점에 파생된 것으로 보인다.[8] 원래 셀 라인은 MCF-7/ADR-RES로 명명되었다. 분류의 변경과 함께 이름을 바꾸었다.[8]
두 개의 뇌암 세포 선인 SNB-19와 U251이 같은 사람으로부터 온 것으로 밝혀졌다.[9] 이것은 혼동을 일으킬 가능성이 있다.
61번째 셀 라인인 MDA-N은 잘못 분류된 MDA-MB-435 셀 라인에서 파생된 것으로 확인되었다.[7] 그래서 그것은 또한 흑색종 세포 라인으로 잘못 분류되지만, 2018년[update] 1월 6일 현재 공식 웹사이트에는 여전히 유방암 세포 라인으로 등록되어 있다.[1] 이 셀 라인은 2018년[update] 1월 6일 현재 이용할 수 없다.[1]
국제 세포 라인 인증 위원회는 오염된 세포 라인의 목록을 유지하고 있다.[10] 여기에는 상기에 보고된 셀 라인이 포함되지만, 일반적으로 첫 번째 날짜보다 상당히 늦은 날짜와 해당 셀 라인에 대한 특정 우려가 제기되는 기사가 포함된다.[10][7][8][9]
잘못된 분류의 계속 사용
2014년[update] 현재, 2007년 공식적으로 흑색종 세포 라인으로 선언된 이후에도, 그리고 심지어 최고 등급의 국제 동료 평가 저널에서도, 수백 개의 연구 연구들이 여전히 유방암의 모델로 사용되고 있다.[11]MB-435를 사용하고 있다. 다른 잘못 식별된 세포 라인도 이와 유사하다.[11]
NCI-60 셀 라인 목록
NCI의 인간 종양 세포 라인 화면에서 사용하는 NCI-60 세포 라인은 개발 치료 프로그램 웹사이트에 설명되어 있다.[1][12]추가 셀 라인 목록
개발 치료 프로그램 웹사이트에 설명된 대로 NCI의 종양 세포 라인 화면에서 사용하기 위해 평가된 추가 세포 라인.[1]| 셀 라인 | 종양구분 | 종 | 접종 밀도 | 셀로사우루스 식별자 및 링크 |
|---|---|---|---|---|
| LXFL 529 | 비소세포폐 | 인간의 | 10000 | LXFL 529L(RRID:CVCL_D085) |
| DMS 114 | 스몰 셀 폐 | 인간의 | 20000 | DMS 114(RRID:CVCL_1174) |
| SHP-77 | 스몰 셀 폐 | 인간의 | 40000 | SHP-77(RRID:CVCL_1693) |
| DLD-1 | 결장 | 인간의 | 50000 | DLD-1(RRID:CVCL_0248) |
| KM20L2 | 결장 | 인간의 | 10000 | KM20L2(RRID:CVCL_D889) |
| SNB-78 | CNS | 인간의 | 20000 | SNB-78(RRID:CVCL_B321) |
| XF 498 | CNS | 인간의 | 20000 | XF 498(RRID:CVCL_8928) |
| RPMI-7951 | 흑색종 | 인간의 | 20000 | RPMI-7951(RRID:CVCL_1666) |
| M19-MEL | 흑색종 | 인간의 | 10000 | M19-MEL (RRID:CVCL_B415) |
| RXF-631 | 레날 | 인간의 | 10000 | RXF 631L(RRID:CVCL_A780) |
| SN12K1 | 레날 | 인간의 | 10000 | SN12K1(RRID:CVCL_D106) |
| P388 | 백혈병 | 쥐를 잡다 | 50000 | P388(RRID:CVCL_7222) |
| P388/ADR | 백혈병 | 쥐를 잡다 | 50000 | P388/ADR(RRID:CVCL_IZ75) |
참조
- ^ a b c d e f g h "Cell Lines in the In Vitro Screen". Developmental Therapeutics Program. National Cancer Institute. 8 May 2015. Retrieved 6 January 2018.
- ^ a b c d "NCI-60 Human Tumor Cell Lines Screen". Developmental Therapeutics Program. National Cancer Institute. 26 August 2015. Retrieved 6 January 2018.
- ^ "Discovery & Development Services". Developmental Therapeutics Program. National Cancer Institute. 26 August 2015. Retrieved 6 January 2018.
- ^ "Welcome to the Developmental Therapeutics Program". Developmental Therapeutics Program. National Cancer Institute. Retrieved 6 January 2018.
- ^ "COMPARE Analysis". Developmental Therapeutics Program. National Cancer Institute. 11 August 2015. Retrieved 6 January 2018.
- ^ "Molecular Targets". Developmental Therapeutics Program. National Cancer Institute. 12 May 2015. Retrieved 7 January 2018.
- ^ a b c d e f "MDA-MB-435, and its derivation MDA-N, are Melanoma cell lines, not breast cancer cell lines". Developmental Therapeutics Program. National Cancer Institute. 8 May 2015. Retrieved 6 January 2018.
- ^ a b c d e "Cell Line NCI/ADR-RES is an Ovarian tumor cell line, not a Breast line". Developmental Therapeutics Program. National Cancer Institute. 8 May 2015. Retrieved 6 January 2018.
- ^ a b c "CNS cell lines SNB-19 and U251 are derived from the same individual". Developmental Therapeutics Program. National Cancer Institute. 8 May 2015. Retrieved 6 January 2018.
- ^ a b Database of Cross-Contaminated or Misidentified Cell Lines (PDF), 8.0, International Cell Line Authentication Committee (ICLAC), 1 December 2016, retrieved 6 January 2018
- ^ a b Prasad, Vidudala VTS; Gopalan, Ramprasad OG (2 June 2015). "Continued use of MDA-MB-435, a melanoma cell line, as a model for human breast cancer, even in year, 2014". NPJ Breast Cancer. 1: 15002–. doi:10.1038/npjbcancer.2015.2. PMC 5515196. PMID 28721362.
- ^ a b "Cellosaurus search result: 61 hits for "NCI60 cancer cell line panel"". Cellosaurus. Swiss Institute of Bioinformatics. Retrieved 7 January 2018. 참고문헌은 검색결과에 연결된 페이지 목록을 포함한다.
- ^ "Cellosaurus - a knowledge resource on cell lines". Cellosaurus. Swiss Institute of Bioinformatics. Retrieved 17 January 2018. 참조는 추가 셀 라인 목록에 지정된 각 셀 라인 이름으로 검색하여 찾은 페이지를 포함한다.