VqmR sRNA
VqmR sRNA| VqmR sRNA | |
|---|---|
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| 식별자 | |
| Rfam | RF02834 |
| 기타 데이터 | |
| 도메인 | 박테리아 |
| 가세요 | GO:0042710, GO:0040033, GO:0003729 |
| 그렇게 | SO:0000370 |
| PDB 구조 | PDBe |
VqmR 작은 RNA비브리오 cholerae는 콜레라를 일으킬 수 있는 박테리아 안에서 미분 RNA및 높은 세포 밀도의quorum(QS)[1]인 QS가 비브리오 cholerae에 독성과인 biofilm의 형성을 관장하는 공부하기 위해 쓰이고 있는 조건에서;그것은 이전에 그것에 의해 연출한 있다는 것을 보였다(sRNA-seq)의 염기 서열을 사용하여 발견되었다. 그Qrr sRNA.[2][3]VqmR은 생물막 형성에 필요한 rtx(독소에서 반복) 독소 유전자와 vpsT를 포함한 여러 mRNA의 발현을 억제하는 것으로 나타났다.실제로 Vibrionaceae에 보존성이 높은 VqmR은 vpsT 유전자를 억제함으로써 바이오막 형성을 강하게 억제하는 것으로 나타나 바이오막 형성과 [1]QS의 연관성이 있을 수 있다.
레퍼런스
- ^ a b Papenfort K, Förstner KU, Cong JP, Sharma CM, Bassler BL (February 2015). "Differential RNA-seq of Vibrio cholerae identifies the VqmR small RNA as a regulator of biofilm formation". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112 (7): E766–775. doi:10.1073/pnas.1500203112. PMC 4343088. PMID 25646441.
- ^ Lenz DH, Mok KC, Lilley BN, Kulkarni RV, Wingreen NS, Bassler BL (July 2004). "The small RNA chaperone Hfq and multiple small RNAs control quorum sensing in Vibrio harveyi and Vibrio cholerae". Cell. 118 (1): 69–82. doi:10.1016/j.cell.2004.06.009. PMID 15242645.
- ^ Bardill JP, Zhao X, Hammer BK (June 2011). "The Vibrio cholerae quorum sensing response is mediated by Hfq-dependent sRNA/mRNA base pairing interactions". Molecular Microbiology. 80 (5): 1381–1394. doi:10.1111/j.1365-2958.2011.07655.x. PMID 21453446.
