소닉 파라노이드

SonicParanoid

SonicParanoid는 여러 [1]종의 직교 유전자의 디-노보 예측을 위한 알고리즘입니다.InParanoid의[2] 주요 아이디어를 차용하여 분석에 필요한 시간을 획기적으로 단축하는 알고리즘을 크게 변경했습니다.또한 SonicParanoid는 단일 연결 계층적 클러스터링 또는 마르코프 클러스터링을 사용하여 입력 단백질 간에 공유되는 직교 유전자 그룹을 생성합니다.

레퍼런스

  1. ^ Cosentino, Salvatore; Iwasaki, Wataru (2019). "SonicParanoid: fast, accurate and easy orthology inference". Bioinformatics. 35 (1): 149–151. doi:10.1093/bioinformatics/bty631. PMC 6298048. PMID 30032301.
  2. ^ Remm, Maido; Christian E.V. Storm; Erik L.L. Sonnhammer (2001). "Automatic clustering of orthologs and in-paralogs from pairwise species comparisons". Journal of Molecular Biology. 314 (5): 1041–1052. CiteSeerX 10.1.1.328.6724. doi:10.1006/jmbi.2000.5197. PMID 11743721.

외부 링크


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