시퀀스 피쳐 변형 유형
Sequence feature variant type시퀀스 특성 변종 유형(SFVT)은 단백질에서 주어진 시퀀스 특성의 정의된 시퀀스 변화(혼합)를 가리킨다.단백질을 고려해보면, 단백질의 아미노산 염기서열은 단백질 구조와 기능을 결정한다.염기서열의 일부 영역은 주로 단백질 접힘과 관련이 있는 반면, 다른 영역은 효소 촉매 부위와 같은 단백질 기능과 관련이 있다.관련된 많은 종에 걸쳐, 해당 단백질에 속하는 지역은 종마다 보존되어 있는 반면, 각 위치에 있는 정확한 아미노산은 변화할 수 있고, 변화할 수 있다.기능 영역의 보존된 특성과 실제 아미노산의 정확한 변화를 명확하게 설명하기 위해 시퀀스 특성 변종 유형을 정의한다.
시퀀스 피쳐
시퀀스 특성은 기본적으로 단백질 내 아미노산의 집합이며, 여기서 수집은 연속 범위 또는 일부 이산적 잔류물이 될 수 있다.대부분의 시퀀스 특성은 실험 결과에서 나온 것이지만, 계산 분석에서 나온 것도 있다.
시퀀스 피쳐 변형 유형
각 시퀀스 특징에 대해, 다양한 관련 종의 많은 단백질들 사이에 변화가 존재한다.변종 유형은 형상의 각 위치에서 정확한 아미노산을 정의한다.형상에 대한 각 위치의 돌연변이가 클수록 변종 유형의 수가 커진다.주어진 단백질의 경우 아미노산 염기서열이 결정되면 염기서열 특성 변종 유형이 결정된다.
적용
SFVT는 많은 관련 종에 걸쳐 단백질 기능을 연구하는데 사용될 수 있다.그러한 연구는 몇몇 인간 병원균에 대해 수행되었다.
SFVT는 독감 단백질을 위한 인플루엔자 연구 데이터베이스와 뎅기 바이러스를 위한 바이러스 병원체 데이터베이스 및 분석 리소스에서도 이용할 수 있다.
