펜타트리코펩타이드 반복
Pentatricopeptide repeat| 펜타트리코펩타이드 반복 | |||||||||
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| 식별자 | |||||||||
| 기호. | PPR | ||||||||
| 팜 | PF01535 | ||||||||
| 빠맘 클랜 | CL0020 | ||||||||
| 인터프로 | IPR002885 | ||||||||
| 프로 사이트 | PS51375 | ||||||||
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펜타트리코펩타이드 반복(PPR)은 35-아미노산 배열 모티브입니다.펜타트리코펩타이드를 포함한 단백질은 식물계에서 흔히 발견되는 단백질의 한 종류이다.그것들은 탠덤 퇴화 PPR[1] 모티브의 존재와 그것들을 [2]코드하는 유전자의 침입의 상대적 결여로 구별된다.
이러한 단백질은 아라비도시스 게놈에서 약 450개, 쌀 [3]게놈에서 또 다른 477개가 확인되었다.단백질 패밀리의 큰 크기에도 불구하고, 유전자 데이터는 아라비도시스([2]Arabidopsis)의 PPR 단백질 사이에 기능의 중복이 거의 또는 전혀 없음을 시사한다.
PPR 단백질의 목적은 현재 논란이 되고 있다.Arabidopsis에 있는 많은 것들은 미토콘드리아와 다른 기관들과[2] 상호작용하며 RNA 편집에 [4]관여할 가능성이 있는 것으로 나타났다.그러나 이러한 편집이 일어나려면 많은 트랜스 단백질이 필요하며 연구는 어떤 단백질이 [5]필요한지 계속 조사하고 있다.
PPR의 구조는 해결되었습니다.그것은 테트라트리코펩타이드 반복에서 발견되는 것과 유사한 나선-나선-나선 구조로 접힌다.단백질의 여러 반복은 TAL [6]이펙터를 연상시키는 배열에 민감한 방식으로 단일 가닥 RNA 분자 주위에 고리를 형성한다.
예
이 반복을 포함하는 단백질을 코드하는 인간 유전자는 다음과 같다.
레퍼런스
- ^ Mingler MK, Hingst AM, Clement SL, Yu LE, Reifur L, Koslowsky DJ (November 2006). "Identification of pentatricopeptide repeat proteins in Trypanosoma brucei". Mol. Biochem. Parasitol. 150 (1): 37–45. doi:10.1016/j.molbiopara.2006.06.006. PMID 16837079.
- ^ a b c Lurin C, Andrés C, Aubourg S, Bellaoui M, Bitton F, Bruyère C, Caboche M, Debast C, Gualberto J, Hoffmann B, Lecharny A, Le Ret M, Martin-Magniette ML, Mireau H, Peeters N, Renou JP, Szurek B, Taconnat L, Small I (August 2004). "Genome-wide analysis of Arabidopsis pentatricopeptide repeat proteins reveals their essential role in organelle biogenesis". Plant Cell. 16 (8): 2089–103. doi:10.1105/tpc.104.022236. PMC 519200. PMID 15269332.
- ^ O'Toole N, Hattori M, Andres C, Iida K, Lurin C, Schmitz-Linneweber C, Sugita M, Small I (June 2008). "On the expansion of the pentatricopeptide repeat gene family in plants". Mol. Biol. Evol. 25 (6): 1120–8. doi:10.1093/molbev/msn057. PMID 18343892.
- ^ Kotera E, Tasaka M, Shikanai T (January 2005). "A pentatricopeptide repeat protein is essential for RNA editing in chloroplasts". Nature. 433 (7023): 326–30. Bibcode:2005Natur.433..326K. doi:10.1038/nature03229. PMID 15662426. S2CID 4416316.
- ^ Takenaka M, Verbitskiy D, Zehrmann A, Brennicke A (June 2010). "Reverse genetic screening identifies five E-class PPR-proteins involved in RNA editing in mitochondria of Arabidopsis Thaliana". J Biol Chem. 285 (35): 27122–27129. doi:10.1074/jbc.M110.128611. PMC 2930711. PMID 20566637.
- ^ Yin P, Li Q, Yan C, Liu Y, Liu J, Yu F, et al. (December 2013). "Structural basis for the modular recognition of single-stranded RNA by PPR proteins". Nature. 504 (7478): 168–71. Bibcode:2013Natur.504..168Y. doi:10.1038/nature12651. PMID 24162847. S2CID 4471801.
