Orac(MD 프로그램)

Orac (MD program)
이 기사는 분자역학 프로그램에 관한 것이다.ORAC의 자세한 의미는 ORAC를 참조하십시오.
오락
원저작자마시모 마르키, 피에로 프로카치
개발자CEA, Saclay, 파리, FR; 플로렌스 대학교, IT
초기 릴리즈1990년; 32년 전(1990년)
안정된 릴리스
5.4.1 / 2010, 12년 전(2010년)
프리뷰 릴리즈
6.0 / 2016; 6년 전 (2016)
기입처포트란
운영 체제Unix, Linux
플랫폼IA-32, x86-64, NUMA
이용가능기간:영어
유형분자역학
면허증.GPL
웹 사이트www.chim.unifi.it/orac

컴퓨터 소프트웨어에서 오락은 원자론적 수준에서 복잡한 분자 시스템을 시뮬레이션하는 고전적인 분자 역학 프로그램입니다.1989~1990년 마시모 마르치가 킹스턴(미국)의 국제 비즈니스 머신(IBM)에 머무는 동안 이 코드가 처음 작성되었습니다.1995년에 코드는 Centre européen de calculatomique et moléculaire(CECAM)에서 더욱 개발되었다.프로그래밍 언어 Fortran으로 작성되어 있습니다.1997년에는 GNU General Public License(GPL)[1]로 출시되었습니다.Orac의 최신 릴리스는 표준 MPI(Message Passing Interface) 라이브러리를 사용하여 병렬로 실행할 수 있으며, 복제 교환 시뮬레이션, 다중 워커[3] 메타다이나믹 시뮬레이션 및 다중 조향[4] 분자 역학 비평형 궤적을 사용할 수 있습니다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Procacci, P.; Darden, T.A.; Paci, E.; Marchi, M. (1997). "ORAC: A Molecular Dynamics Program to Simulate Complex Molecular Systems with Realistic Electrostatic Interactions". Journal of Computational Chemistry. 18 (15): 1848–1862. CiteSeerX 10.1.1.554.895. doi:10.1002/(SICI)1096-987X(19971130)18:15<1848::AID-JCC2>3.0.CO;2-O.
  2. ^ Marsili, S.; Signorini, G.F.; Chelli, R.; Marchi, M.; Procacci, P. (2010). "ORAC: A molecular dynamics simulation program to explore free energy surfaces in biomolecular systems at the atomistic level". Journal of Computational Chemistry. 31 (5): 1106–1116. doi:10.1002/jcc.21388. PMID 19824035.
  3. ^ Laio, A.; Gervasio, F. L. (2008). "Metadynamics: A method to simulate rare events and reconstruct the free energy in biophysics, chemistry and material science". Reports on Progress in Physics. 71 (12): 126601. Bibcode:2008RPPh...71l6601L. doi:10.1088/0034-4885/71/12/126601.
  4. ^ Isralewitz, B.; Gao, M.; Schulten, K. (2001). "Steered molecular dynamics and mechanical functions of proteins". Current Opinion in Structural Biology. 11 (2): 224–230. doi:10.1016/S0959-440X(00)00194-9. PMID 11297932.

외부 링크

  • 공식 웹사이트, Universita di Firenze, IT