나노디스크

Nanodisc
Schematic illustration of a nanodisc with a 7-transmembrane protein embedded.
7-막 통과 단백질이 내장된 MSP 나노디스크의 개략도.직경은 약 10 nm입니다.Sligar Lab의 사진

나노디스크는 막 [1]단백질 연구를 돕는 합성 모형 막 시스템이다.나노디스크는 지질 이중층이 단백질, 펩타이드, 합성 [2]고분자를 포함한 양친매성 분자로 둘러싸인 원반형 단백질이다.그것은 두 의 양성 단백질에 의해 가려진 소수성 가장자리와 함께 인지질의 지질 이중층으로 구성되어 있다.이 단백질들은 막 비계 단백질이라고 불리며 이중 띠 형태로 [3][4][5]정렬됩니다.때문에 그들은stabilise를 나타내liposome보다 막 proteins[6]좀 더 자연스런 환경 solubilise 수 있Nanodiscs 구조적으로 매우 중실 고밀도 lipoproteins에(HDL)과apolipoprotein A1(apoA1)의 스코틀랜드 하원 의원이 수정 버전, HDL.Nanodiscs의 주성분 세포막 단백질의 연구에 유용한 비슷하다.s, 세정제 미셀, 이세균, 암피폴.

나노디스크를 만드는 기술은 입자를 만들기 위해 MSP와 지질만을 사용하는 과거로 발전했고, 더 단순한 단백질을 사용하는 펩타이드 나노디스크와 안정화를 위해 단백질이 필요 없는 합성 나노디스크와 같은 대체 전략으로 이어졌다.

MSP 나노디스크

원래 나노디스크는 2002년부터 [3]apoA1에서 파생된 MSP에 의해 생산되었다.이러한 디스크의 크기와 안정성은 이러한 단백질의 크기에 따라 달라지는데, 이는 절단 및 융합에 의해 조절될 수 있다.일반적으로 MSP1 단백질은 한 번의 반복으로 구성되며, MSP2는 두 배의 [7][8]크기이다.

펩타이드 나노디스크

펩타이드 나노디스크에서는 지질 이중층이 2개의 MSP 대신 양성 펩타이드로 스크리닝된다.펩타이드 나노디스크는 구조적으로 MSP 나노디스크와 유사하며 펩타이드도 이중 벨트로 배열된다.그들은 막 [9]단백질을 안정시킬 수 있지만 다분산성이 높고 구조적으로 MSP 나노디스크보다 덜 안정적이다.그러나 최근의 연구는 펩타이드의 이량화와[10] 중합이[11] 펩타이드를 보다 안정적으로 만든다는 것을 보여주었다.

합성/네이티브 나노디스크

토종 지질막을 모방하는 또 다른 방법은 합성 고분자이다.SMALP 또는 리포디스크라고 불리는 스티렌-말레산 공동 중합체(SMA)[12][13]와 디이소부틸렌-말레산(DIBMA)[14]은 그러한 합성 폴리머(DIBMA)이다.세포나 생추출물에서 직접 막 단백질을 가용화할 수 있다.그것들은 또한 몇몇 [15][16][17]유기체의 지질 구성을 연구하는데 사용되어 왔다.스티렌과 말레인산기를 함유한 모든 합성 고분자가 단백질을 [18]가용화할 수 있다는 것이 밝혀졌다.이러한 SMA 나노 입자는 또한 가능한 약물 전달[19] 매개체로서 그리고 원어민 질량 [20]분석법에 의한 막 단백질의 접힘, 번역 후 변형 및 지질 상호작용 연구를 위해 테스트되었다.

레퍼런스

  1. ^ Liszewski K (1 October 2015). "Dissecting the Structure of Membrane Proteins". Genetic Engineering & Biotechnology News. 35 (17): 16–18, 21. doi:10.1089/gen.35.07.09. Nanodiscs are self-assembling nanoscale phospholipid bilayers that are stabilized using engineered membrane scaffold proteins.
  2. ^ Anada, Chiharu; Ikeda, Keisuke; Egawa, Ayako; Fujiwara, Toshimichi; Nakao, Hiroyuki; Nakano, Minoru (April 2021). "Temperature- and composition-dependent conformational transitions of amphipathic peptide–phospholipid nanodiscs". Journal of Colloid and Interface Science. 588: 522–530. doi:10.1016/j.jcis.2020.12.090. ISSN 0021-9797. PMID 33429348.
  3. ^ a b Bayburt TH, Grinkova YV, Sligar SG (2002). "Self-Assembly of Discoidal Phospholipid Bilayer Nanoparticles with Membrane Scaffold Proteins". Nano Letters. 2 (8): 853–856. Bibcode:2002NanoL...2..853B. doi:10.1021/nl025623k.
  4. ^ Bayburt TH, Sligar SG (May 2010). "Membrane protein assembly into Nanodiscs". FEBS Letters. 584 (9): 1721–7. doi:10.1016/j.febslet.2009.10.024. PMC 4758813. PMID 19836392.
  5. ^ Skar-Gislinge N, Simonsen JB, Mortensen K, Feidenhans'l R, Sligar SG, Lindberg Møller B, et al. (October 2010). "Elliptical structure of phospholipid bilayer nanodiscs encapsulated by scaffold proteins: casting the roles of the lipids and the protein". Journal of the American Chemical Society. 132 (39): 13713–22. doi:10.1021/ja1030613. PMC 4120756. PMID 20828154.
  6. ^ Denisov IG, Sligar SG (January 2011). "Cytochromes P450 in nanodiscs". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics. 1814 (1): 223–9. doi:10.1016/j.bbapap.2010.05.017. PMC 2974961. PMID 20685623.
  7. ^ Denisov IG, Grinkova YV, Lazarides AA, Sligar SG (March 2004). "Directed self-assembly of monodisperse phospholipid bilayer Nanodiscs with controlled size". Journal of the American Chemical Society. 126 (11): 3477–87. doi:10.1021/ja0393574. PMID 15025475.
  8. ^ Grinkova YV, Denisov IG, Sligar SG (November 2010). "Engineering extended membrane scaffold proteins for self-assembly of soluble nanoscale lipid bilayers". Protein Engineering, Design & Selection. 23 (11): 843–8. doi:10.1093/protein/gzq060. PMC 2953958. PMID 20817758.
  9. ^ Midtgaard SR, Pedersen MC, Kirkensgaard JJ, Sørensen KK, Mortensen K, Jensen KJ, Arleth L (February 2014). "Self-assembling peptides form nanodiscs that stabilize membrane proteins". Soft Matter. 10 (5): 738–52. doi:10.1039/c3sm51727f. PMID 24651399.
  10. ^ Larsen AN, Sørensen KK, Johansen NT, Martel A, Kirkensgaard JJ, Jensen KJ, et al. (July 2016). "Dimeric peptides with three different linkers self-assemble with phospholipids to form peptide nanodiscs that stabilize membrane proteins". Soft Matter. 12 (27): 5937–49. Bibcode:2016SMat...12.5937L. doi:10.1039/c6sm00495d. PMID 27306692.
  11. ^ Kondo H, Ikeda K, Nakano M (October 2016). "Formation of size-controlled, denaturation-resistant lipid nanodiscs by an amphiphilic self-polymerizing peptide". Colloids and Surfaces. B, Biointerfaces. 146: 423–30. doi:10.1016/j.colsurfb.2016.06.040. PMID 27393815.
  12. ^ Bada Juarez JF, Harper AJ, Judge PJ, Tonge SR, Watts A (July 2019). "From polymer chemistry to structural biology: The development of SMA and related amphipathic polymers for membrane protein extraction and solubilisation". Chemistry and Physics of Lipids. 221: 167–175. doi:10.1016/j.chemphyslip.2019.03.008. PMID 30940445.
  13. ^ Knowles TJ, Finka R, Smith C, Lin YP, Dafforn T, Overduin M (June 2009). "Membrane proteins solubilized intact in lipid containing nanoparticles bounded by styrene maleic acid copolymer". Journal of the American Chemical Society. 131 (22): 7484–5. doi:10.1021/ja810046q. PMID 19449872.
  14. ^ Oluwole AO, Klingler J, Danielczak B, Babalola JO, Vargas C, Pabst G, Keller S (December 2017). "Formation of Lipid-Bilayer Nanodiscs by Diisobutylene/Maleic Acid (DIBMA) Copolymer". Langmuir. 33 (50): 14378–14388. doi:10.1021/acs.langmuir.7b03742. PMID 29160078.
  15. ^ Lavington S, Watts A (November 2020). "Lipid nanoparticle technologies for the study of G protein-coupled receptors in lipid environments". Biophysical Reviews. 12 (6): 1287–1302. doi:10.1007/s12551-020-00775-5. PMC 7755959. PMID 33215301.
  16. ^ Barniol-Xicota M, Verhelst SH (February 2021). "Lipidomic and in-gel analysis of maleic acid co-polymer nanodiscs reveals differences in composition of solubilized membranes". Communications Biology. 4 (1): 218. doi:10.1038/s42003-021-01711-3. PMC 7886889. PMID 33594255.
  17. ^ Bada Juarez JF, O'Rourke D, Judge PJ, Liu LC, Hodgkin J, Watts A (August 2019). "Lipodisqs for eukaryote lipidomics with retention of viability: Sensitivity and resistance to Leucobacter infection linked to C.elegans cuticle composition". Chemistry and Physics of Lipids. 222: 51–58. doi:10.1016/j.chemphyslip.2019.02.005. PMID 31102583.
  18. ^ "Diisobutylene-maleic acid (DIBMA)". Cube Biotech. Retrieved 2019-02-21.
  19. ^ Torgersen ML, Judge PJ, Bada Juarez JF, Pandya AD, Fusser M, Davies CW, et al. (April 2020). "Physicochemical Characterization, Toxicity and In Vivo Biodistribution Studies of a Discoidal, Lipid-Based Drug Delivery Vehicle: Lipodisq Nanoparticles Containing Doxorubicin". Journal of Biomedical Nanotechnology. 16 (4): 419–431. doi:10.1166/jbn.2020.2911. hdl:10852/85267. PMID 32970975.
  20. ^ Hoi KK, Bada Juarez JF, Judge PJ, Yen HY, Wu D, Vinals J, et al. (March 2021). "Detergent-free Lipodisq Nanoparticles Facilitate High-Resolution Mass Spectrometry of Folded Integral Membrane Proteins". Nano Letters. 21 (7): 2824–2831. doi:10.1021/acs.nanolett.0c04911. PMC 8050825. PMID 33787280.

외부 링크