myGrid

myGrid


myGrid 컨소시엄
포메이션2001
유형e-사이언스 조직
목적과학자를 위한 소프트웨어 도구 개발
위치
캐롤 고블
웹사이트www.mygrid.org.uk

myGrid 컨소시엄은 "e-Scientists가 과학을 발전시키고 과학자들과 잘 지낼 수 있도록" 도구 디자인을 제작하고 사용한다.이 도구는 전자 연구소의 창설을 지원하며 시스템 생물학, 사회과학, 음악, 천문학,[1] 멀티미디어, 화학 등 다양한 영역에서 사용되어 왔다.[2][3]

이 컨소시엄은 영국 맨체스터 대학의 컴퓨터 과학 학과의 캐롤 고블이 이끌고 있다.

myGrid에서 생산 및 사용하는 도구

myGrid 컨소시엄에서 개발한 툴은 다음과 같다.

역사

이 컨소시엄은 세 가지 뚜렷한 단계를 가지고 있다.

1단계

이 컨소시엄은 2001년 구축 맨체스터, 사우샘프턴, 뉴 캐슬, 노팅엄과 셰필드, 캠브리지의 유럽 분자 생물학 Laboratory-European Bioinformatics Institute[22](EMBL-EBI), 산업 파트너 글락소 스미스 클라인, 메르크, AstraZeneca, 선마이크로 시스템즈, IBM, 유전자의 대학에서 친일파를 형성되었다.ticX변화, 인식론 및 대뇌(이전의 네트워크 추론)영국 공학 물리 과학 연구 위원회는 이 프로젝트의 1단계에 350만 파운드의 자금을 지원했다.[23]

현재까지 그리드 개발은 고성능 환경에서 글로벌 과학 커뮤니티의 정보와 도구를 접근 가능하게 하는 데 필요한 스토리지, 연산 및 자원 관리의 기본적인 문제에 초점을 맞추고 있다.그러나, e-Science의 관점에서, 그리드의 목적은 지리적으로 분산된 과학자가 보다 효과적으로 연구 목표를 달성할 수 있는 협력적이고 지원적인 환경을 제공하는 것이다.MyGrid는 복잡한 분산된 자원을 사용하는 과학자를 지원하는 기존 그리드 인프라에 걸쳐 더 높은 수준의 기능을 설계, 개발 및 시연할 것이다.

이 프로젝트에서는 다음을 지원하는 E-Science 워크벤치인 Taborna[4][5][6] 개발했다.

  • 실험 조사, 증거 축적 및 결과 동화의 과학적 과정
  • 과학자의 커뮤니티 정보 사용
  • 역동적인 그룹들이 새로운 연구 문제들을 다루도록 하는 과학적 협력.

myGrid 프로젝트는 또한 Tarbana와 다른 Scientific 워크플로우 시스템의 과학적 워크플로우를 공유할 수 있도록 myExperiment를 개발했다.

Taborna 작업대는 자원 선택, 데이터 관리 및 프로세스 제정과 관련된 개인화 시설을 제공함으로써 개별 과학자를 지원한다.설계와 개발 활동은 많은 공유 도구 자원이 있는 고도로 분산된 커뮤니티에 의해 특징지어지는 생물정보학의 문제를 이용하여 통지되고 평가될 것이다. myGrid는 기능 게놈 데이터 분석에서 개별 과학자를 지원하는 환경과 기능 게놈 데이터 분석에서 개별 과학자를 지원하는 다른 두 가지 응용 환경을 개발할 것이다.패턴 데이터베이스의 주석을 배치한다.이 두 과제 모두 과학적 과정의 명시적 표현과 제정이 필요하며, 도전적인 수행 요건이 있다.

2단계

2단계에서 2006년부터 2009년까지 이 컨소시엄은 오픈 미들웨어 인프라 연구소의 일부로 2백만[24] 파운드의 자금을 지원받는다.컨소시엄 멤버십은 맨체스터 대학엠블-EBI에 집중됐다.

3단계

2008년 12월, 영국의 공학물리 과학 연구 위원회는 팀의 갱신 보조금 제안을 승인했다.이 보조금은 115만[25] 파운드로 2009년 1월에 시작되었다.3단계의 myGrid 팀의 멤버는 맨체스터 대학사우샘프턴 대학이다.프로젝트는 e-Science를 위한 지식 관리, e-Laborates의 메타데이터 관리, Scientific Workflow Design, 관리 및 제정, e-Scientist를 위한 소셜 컴퓨팅의 4가지 테마로 구성된다.소셜 컴퓨팅 테마는 과학 연구 개체의 사회적 큐레이션 및 공유를 위한 myExperiment[7] 가상 연구 환경(VRE)을 중심으로 한다.

참조

  1. ^ Hook, R. N.; Romaniello, M.; Ullgrén, M.; Järveläinen, P.; Maisala, S.; Oittinen, T.; Savolainen, V.; Solin, O.; Tyynelä, J.; Peron, M.; Izzo, C.; Licha, T. (2008). "ESO Reflex: A Graphical Workflow Engine for Running Recipes". The 2007 ESO Instrument Calibration Workshop. ESO Astrophysics Symposia European Southern Observatory. p. 169. doi:10.1007/978-3-540-76963-7_23. ISBN 978-3-540-76962-0.
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