메타바실루스

Metabacillus
메타바실루스
과학적 분류
도메인:
박테리아
문:
바실로타
클래스:
바실리
주문:
바실랄레스
패밀리:
바실라과
속:
메타바실루스 파텔과 굽타 2020
종.

LPSN 2021에 근거한 정보

메타실러스(Metabacillus)는 그램 양성 또는 그램 가변 염색을 보이는 막대 모양의 박테리아로,[1][2] 바실라스목 바실라스과에 속합니다.이 속의 모식종은 메타실러스 파스티디오스입니다.[1]

이 속은 계통학적으로 복잡한 바실루스속과 구분되어 오랫동안 과학계에 [2][3][4]의해 정밀 조사를 받아왔다.바실러스속의 다계통적 특성은 부분적으로 새로운 박테리아를 이 속에 할당하기 위해 사용된 모호한 기준 때문에 다양한 범위의 생화학적 [2]특성을 가진 계통학적으로 관련이 없는 박테리아가 응집된다.이 속 내의 복잡한 관계를 명확히 하기 위해 비교 게놈 연구와 계통학적 분석이 발표되었으며, 그 결과 많은 바실러스 종이 알칼리할로바실루스,[1] 비리기바실루스,[5] 브레비바실루스,[6] 솔리바실루스[7], 페리바실루스 [8]등의 새로운 속으로 옮겨졌다.또, 종에 가까운 종인 세레우스균 뿐만이 아니라,[1][8] 종에 가까운 종인 세레우스균만을 포함하도록 제한되고 있다.

메타바실루스라는 이름은 계통수를 통해 확인된 분류학적 위치로부터 유래되었다.접두사 "meta-"는 그리스 형용사 메타에서 왔고 "beide"로 번역됩니다.바실루스는 '작은 지팡이 또는 막대'와 세균속인 바실루스를 가리키는 라틴어 명사 바실러스에서 유래했다.메타실러스라는 이름은 종합하면 바실러스 [1]외에 다른 속들을 가리킨다.

생화학적 특성 및 분자[1] 시그니처

메타실러스속의 모든 구성원은 호기성이고 내포자 형성을 나타낸다.이 박테리아는 과염색 호수, 해안 해양 지역, 토양 등 다양한 환경에서 발견될 수 있다.어떤 종들은 운동성이 없지만, 대부분의 메타실러스 종들은 운동성이 있다.어떤 종들은 적당히 염분을 잘 견디고 해안 지방과 같은 염수 환경에서 살 수 있다.메타실루스는 4℃~45℃의 온도에서 생존할 수 있지만 25~37℃의 온도에서 최적의 생육이 이루어진다.

3-포스포시키메이트-1-카르복시비닐전달효소, 피브로넥틴/피브리노겐결합단백질, 포자단백질가수분해효소 YyaC, DEAD/DEAH 박스헬리카제 [1]등의 단백질에서 메타실러스종에 특이적으로 6가지 보존된 시그니처인델(CSI)이 확인되었다.이들 CSI는 메타실러스종의 게놈 배열을 분석하여 확인되었으며, 메타실러스속과 다른 바실러스속을 분자적으로 구별할 수 있는 신뢰성 있는 수단을 제공한다.

분류법

2021년 5월 현재 메타실러스속에는 총 15종의 명칭이 기재되어 있다.[9]이 속은 여러 보존단백질의 [1]데이터셋으로부터 연결된 배열로부터 생성된 계통발생학적 나무에서 함께 그룹화되어 단통성 분지를 형성한다.이 단통군은 게놈 분류 데이터베이스(GTDB)[10]에서도 찾을 수 있습니다.

추가적인 계통발생학 연구는 "Bacillus weihaiensis" 종이 계통발생학적 나무에서의 분류학적 위치 및 [8]메타실러스 다른 메타실러스 멤버들과 공유 분자 마커(구체적으로 보존된 시그니처 인델)를 기반으로 메타실러스 멤버임을 확인했다.그러나 스트레인 배양 정보가 부족하여 이전이 제안되지 않았습니다.Bacillus는 신규종과 배열된 게놈이 빈번하게 추가되면서 빠르게 성장하는 속이기 때문에, 이전 분류 제안서의 지속적인 업데이트와 검증이 필요할 것이다.

레퍼런스

  1. ^ a b c d e f g h Patel, Sudip; Gupta, Radhey S. (2020-01-01). "A phylogenomic and comparative genomic framework for resolving the polyphyly of the genus Bacillus: Proposal for six new genera of Bacillus species, Peribacillus gen. nov., Cytobacillus gen. nov., Mesobacillus gen. nov., Neobacillus gen. nov., Metabacillus gen. nov. and Alkalihalobacillus gen. nov". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 70 (1): 406–438. doi:10.1099/ijsem.0.003775. ISSN 1466-5026. PMID 31617837.
  2. ^ a b c Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T.; Garrity, George M.; Boone, David R.; De Vos, Paul; Goodfellow, Michael; Rainey, Fred A.; Schleifer, Karl-Heinz, eds. (2005). Bergey's Manual® of Systematic Bacteriology. doi:10.1007/0-387-28022-7. ISBN 978-0-387-24144-9.
  3. ^ Logan, N.A. (2011-12-20). "Bacillus and relatives in foodborne illness". Journal of Applied Microbiology. 112 (3): 417–429. doi:10.1111/j.1365-2672.2011.05204.x. ISSN 1364-5072. PMID 22121830.
  4. ^ La Duc, Myron T; Satomi, Masataka; Agata, Norio; Venkateswaran, Kasthuri (March 2004). "gyrB as a phylogenetic discriminator for members of the Bacillus anthracis–cereus–thuringiensis group". Journal of Microbiological Methods. 56 (3): 383–394. doi:10.1016/j.mimet.2003.11.004. ISSN 0167-7012. PMID 14967230.
  5. ^ Heyndrickx, M.; Lebbe, L.; Kersters, K.; Hoste, B.; De Wachter, R.; De Vos, P.; Forsyth, G.; Logan, N. A. (1999-07-01). "Proposal of Virgibacillus proomii sp. nov. and emended description of Virgibacillus pantothenticus (Proom and Knight 1950) Heyndrickx et al. 1998". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 49 (3): 1083–1090. doi:10.1099/00207713-49-3-1083. ISSN 1466-5026. PMID 10425765.
  6. ^ Shida, O.; Takagi, H.; Kadowaki, K.; Komagata, K. (1996-10-01). "Proposal for Two New Genera, Brevibacillus gen. nov. and Aneurinibacillus gen. nov". International Journal of Systematic Bacteriology. 46 (4): 939–946. doi:10.1099/00207713-46-4-939. ISSN 0020-7713. PMID 8863420.
  7. ^ Mual, Poonam; Singh, Nitin Kumar; Verma, Ashish; Schumann, Peter; Krishnamurthi, Srinivasan; Dastager, Syed; Mayilraj, Shanmugam (2016-05-01). "Reclassification of Bacillus isronensis Shivaji et al. 2009 as Solibacillus isronensis comb. nov. and emended description of genus Solibacillus Krishnamurthi et al. 2009". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 66 (5): 2113–2120. doi:10.1099/ijsem.0.000982. ISSN 1466-5026. PMID 26907585.
  8. ^ a b c Gupta, Radhey S.; Patel, Sudip; Saini, Navneet; Chen, Shu (2020-11-01). "Robust demarcation of 17 distinct Bacillus species clades, proposed as novel Bacillaceae genera, by phylogenomics and comparative genomic analyses: description of Robertmurraya kyonggiensis sp. nov. and proposal for an emended genus Bacillus limiting it only to the members of the Subtilis and Cereus clades of species". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 70 (11): 5753–5798. doi:10.1099/ijsem.0.004475. ISSN 1466-5026. PMID 33112222.
  9. ^ "Genus: Metabacillus". lpsn.dsmz.de. Retrieved 2021-05-20.
  10. ^ "GTDB - Tree". gtdb.ecogenomic.org. Retrieved 2021-05-25.