조나단 마르치니

Jonathan Marchini
조나단 마르치니
Jonathan Marchini.png
태어난
조나단 로렌스 마르치니

1973-05-19 1973년 5월 19일(49세)
치체스터
국적.영국의
모교
어워드
과학 경력
기관
논문뇌 이미지의 통계적 분석 (2002)
박사 어드바이저브라이언 리플리.[2]
웹 사이트jmarchini.org

조나단 로렌스 마르치니(Jonathan Laurence Marchini, 1973년 [3]5월 19일 ~ )는 베이지안 통계학자, 옥스퍼드 대학교 통계학과[4] 교수, 옥스퍼드 서머빌 [5]칼리지 통계학 튜토리얼 펠로우, 겐시(Gensci [6]Ltd.)의 공동 설립자이자 이사이다.그는 하플로타입 레퍼런스 [7]컨소시엄을 공동 이끌고 있다.

교육

그는 1991년부터 [8]94년까지 엑서터 대학에서 순수 수학과 수학 통계학 학사 학위를 취득했습니다.그리고 나서 그는 1994-5년 웨스트 서섹스 고등교육원에서 수학 교육 PGCE를 취득했다.그는 1998년부터 [9]2002년까지 Brian Ripley 교수의 지도 하에 옥스퍼드 대학 통계학과에서 DPhil을 수료했습니다.

경력 및 연구

Marchini는 1995년 9월부터 1998년 [10]9월까지 탄자니아 Iringa 근처에 있는 Tosamaganga Secondary School에서 VSO 자원봉사로 3년간 수학을 가르쳤다.

2002년부터 2005년까지 그는 Lon Cardon 교수와 Peter Donnelly 교수의 지도 아래 수학 생물학에서 Wellcome Trust Training Fellowship을 개최하였습니다.

2006년에는 옥스퍼드대 통계학과 통계게노믹스 대학 강사(부교수)와 맨스필드 칼리지 선임연구원으로 임명됐다.2007년에 그는 옥스퍼드 대학의 웰컴 트러스트 인간[11] 유전학 센터의 제휴 그룹 리더가 되었습니다.2010년 그는 은퇴할 때까지 재임용되었다.

2015년에는 통계게노믹스[13][14] 교수로 승진했다.

Marchini의 연구는 통계 유전학과 집단 유전학에 초점을 맞추고 있으며, 특히 게놈 전체의 연관성 연구를 위한 방법 개발에 중점을 두고 있다.그는 하플로타입 추정,[15][16][17][18] 유전자형 [19]치환, 배열 및 시퀀싱에서의 유전자형 호출, RNA-seq [20]데이터셋의 희박한 텐서 분해, [21]모집단 구조, 표현형 예측 및 혼합 모델,[22] 유전자-유전자 상호[23] 작용 및 뇌 영상 [24]유전학에 대해 연구했습니다.

그는 International HapMap Project, Wellcome Trust Case-Control Consortium, 1000 Genetomes Project 및 UK10K Project 분석팀의 일원이었습니다.그의 연구 그룹은 영국 바이오뱅크 데이터 세트의 하플로타입 추정 및 유전자형 귀속을 담당했습니다.그는 하플로타입 레퍼런스 [25]컨소시엄을 공동 이끌고 있다.

2014년부터[26] 2018년까지 ISI 고인용 연구원으로 재직하고 있습니다.

그는[27] 특허 재판에서 감정인이 되었다

어워드

2012년에는 "집단과 의료 유전학을 위한 강력하고 기발한 새로운 통계 방법론과 더불어 빠른 계산 알고리즘과 소프트웨어를 구축하여 길을 선도한 공로로 Philip Leverhulme 상을[28] 수상했습니다.

레퍼런스

  1. ^ "Leverhulme website" (PDF). Archived from the original (PDF) on 2018-04-02. Retrieved 2018-04-01.
  2. ^ Marchini, J.; Ripley, B. (2000). "A New Statistical Approach to Detecting Significant Activation in Functional MRI. Molecular evolution". NeuroImage. 12 (4): 366–80. doi:10.1006/nimg.2000.0628. PMID 10988031.
  3. ^ "Companies house record".
  4. ^ "Marchini website".
  5. ^ "Somerville website".
  6. ^ "Companies house record".
  7. ^ "HRC website".
  8. ^ "Somerville College Report" (PDF).
  9. ^ Marchini, Jonathan L.; Ripley, Brian D. (October 2000). "A New Statistical Approach to Detecting Significant Activation in Functional MRI". NeuroImage. 12 (4): 366–380. doi:10.1006/nimg.2000.0628. PMID 10988031.
  10. ^ "Photo album".
  11. ^ "WTCHG website".
  12. ^ "Oxford Gazette link".
  13. ^ "Oxford Gazette link".
  14. ^ "Oxford Gazette link".
  15. ^ O'Connell, Jared; Sharp, Kevin; Shrine, Nick; Wain, Louise; Hall, Ian; Tobin, Martin; Zagury, Jean-Francois; Delaneau, Olivier; Marchini, Jonathan (6 June 2016). "Haplotype estimation for biobank-scale data sets". Nature Genetics. 48 (7): 817–820. doi:10.1038/ng.3583. PMC 4926957. PMID 27270105.
  16. ^ O'Connell, Jared; Gurdasani, Deepti; Delaneau, Olivier; Pirastu, Nicola; Ulivi, Sheila; Cocca, Massimiliano; Traglia, Michela; Huang, Jie; Huffman, Jennifer E.; Rudan, Igor; McQuillan, Ruth; Fraser, Ross M.; Campbell, Harry; Polasek, Ozren; Asiki, Gershim; Ekoru, Kenneth; Hayward, Caroline; Wright, Alan F.; Vitart, Veronique; Navarro, Pau; Zagury, Jean-Francois; Wilson, James F.; Toniolo, Daniela; Gasparini, Paolo; Soranzo, Nicole; Sandhu, Manjinder S.; Marchini, Jonathan; Gibson, Greg (17 April 2014). "A General Approach for Haplotype Phasing across the Full Spectrum of Relatedness". PLoS Genetics. 10 (4): e1004234. doi:10.1371/journal.pgen.1004234. PMC 3990520. PMID 24743097.
  17. ^ Delaneau, Olivier; Howie, Bryan; Cox, Anthony J.; Zagury, Jean-François; Marchini, Jonathan (October 2013). "Haplotype Estimation Using Sequencing Reads". The American Journal of Human Genetics. 93 (4): 687–696. doi:10.1016/j.ajhg.2013.09.002. PMC 3791270. PMID 24094745.
  18. ^ Delaneau, Olivier; Zagury, Jean-Francois; Marchini, Jonathan (1 January 2013). "Improved whole-chromosome phasing for disease and population genetic studies". Nature Methods. 10 (1): 5–6. doi:10.1038/nmeth.2307. PMID 23269371.
  19. ^ Howie, Bryan N.; Donnelly, Peter; Marchini, Jonathan; Schork, Nicholas J. (19 June 2009). "A Flexible and Accurate Genotype Imputation Method for the Next Generation of Genome-Wide Association Studies". PLoS Genetics. 5 (6): e1000529. doi:10.1371/journal.pgen.1000529. PMC 2689936. PMID 19543373.
  20. ^ Hore, Victoria; Viñuela, Ana; Buil, Alfonso; Knight, Julian; McCarthy, Mark I; Small, Kerrin; Marchini, Jonathan (1 August 2016). "Tensor decomposition for multiple-tissue gene expression experiments". Nature Genetics. 48 (9): 1094–1100. doi:10.1038/ng.3624. PMC 5010142. PMID 27479908.
  21. ^ Marchini, Jonathan; Cardon, Lon R; Phillips, Michael S; Donnelly, Peter (28 March 2004). "The effects of human population structure on large genetic association studies". Nature Genetics. 36 (5): 512–517. doi:10.1038/ng1337. PMID 15052271.
  22. ^ Dahl, Andrew; Iotchkova, Valentina; Baud, Amelie; Johansson, Åsa; Gyllensten, Ulf; Soranzo, Nicole; Mott, Richard; Kranis, Andreas; Marchini, Jonathan (22 February 2016). "A multiple-phenotype imputation method for genetic studies". Nature Genetics. 48 (4): 466–472. doi:10.1038/ng.3513. PMC 4817234. PMID 26901065.
  23. ^ Marchini, Jonathan; Donnelly, Peter; Cardon, Lon R (27 March 2005). "Genome-wide strategies for detecting multiple loci that influence complex diseases". Nature Genetics. 37 (4): 413–417. doi:10.1038/ng1537. PMID 15793588.
  24. ^ Elliott, Lloyd T.; Sharp, Kevin; Alfaro-Almagro, Fidel; Shi, Sinan; Miller, Karla; Douaud, Gwenaëlle; Marchini, Jonathan; Smith, Stephen (2018). "BioRxiv paper". doi:10.1101/178806. {{cite journal}}:Cite 저널 요구 사항 journal=(도움말)
  25. ^ "HRC website".
  26. ^ "ISI Highly Cited Researchers".
  27. ^ "Illumina vs Premaitha".
  28. ^ "Leverhulme website" (PDF). Archived from the original (PDF) on 2018-04-02. Retrieved 2018-04-01.

외부 링크