할로비르
Halovir![]() | 이 기사는 대부분의 독자들이 이해하기에는 너무 전문적일 수 있다.(2022년 11월 (이 의 방법과 합니다) |
상기 할로페롤프(2] (3]()는 입자, 입자, 입자, 입자)에 속하는 다중 아날로그 화합물 화합물을 말한다.2-ami노 알코올이 있는 C-modus)(4] (4] (4] (4])에 위치한 C-m)이다.[1][1][6]이러한 펩타이드들은 흥미로운 미세 [5]이질성을 보인다. 아미노산 코드화의 약간의 변화는 밀접하게 관련된 유사체들의 혼합물을 발생시키고 항균/항바이러스 [2][6]특성을 가진 것으로 나타났다.
배경
비리보솜 펩타이드는 박테리아/풍균 유기체의 중요한 2차 대사물 그룹을 구성합니다(드로소필라 멜라노가스터와 케노하브디티스 엘레강스는 둘 다 비리보솜 펩타아제 합성 효소의 산물을 나타냄).[7][8][9] 자기 방어 물질/철껍질 시데로포체로 기능하는 것이 관찰되었습니다.그것들은 환경 스트레스에 대한 대처 메커니즘으로 작용하고, 병리 발생을 촉진하는 독성 요인/물질로 작용하며, 신호 전달([7][8][9]종간 및 종간 통신)에 작용한다.이러한 기능 대신 많은 비리보솜 펩타이드가 의약품 및 생체조절제 개발에 사용되었습니다(그 예로는 β-락탐스, 답토마이신, 에키노칸딘, 에모데프사이드, 블레오마이신, 시클로스포린 및 바이아라포스가 [7][10][11]있습니다).
펩타이볼은 다양한 아미노아실, 케토아실 또는 히드록시아실 모노머가 비리보솜펩타이드 합성효소(NRPS)[12]로 표시된 진균성 다모듈 메가엔자임에 의해 조립된 결과로 생성되는 선형 양성 폴리펩타이드(일반적으로 4-21개의 아미노산 [7]잔기로 구성됨)의 한 패밀리이다.전형적으로 NRPS는 세 개의 고도로 보존된 핵심 도메인으로 구성된다. 즉, NRPS에 모노머를 인식, 활성화 및 로드하는 아데닐화(A) 도메인, 인접한 NRPS 도메인 간에 공유적으로 연결된 모노머/펩티딜 중간체를 운반하는 티올레이션(T) 도메인(펩티딜 캐리어 단백질 도메인이라고도 함)이다.및 응축(C) 도메인(초기 펩타이드 [7][10][13]사슬 내에서 단량체의 순차 응축을 촉매한다).또, NRPS의 말단에서, 전장 펩타이드 사슬을 선형 또는 순환 형태로 포기하기 위해서, 사슬 종단 도메인[티오에스테라아제(TE) 도메인, 단자 C(CT) 또는 환원효소(R) 도메인]이 공통적으로 관찰된다.또한 종종 나타나는 특성화 도메인[에피머라아제, N-메틸전달효소(M), 산화효소(Ox), 케토아실환원효소(KR) 및 사이클라아제(Cy)]이 있어 모노머/폴리펩타이드 [7][10][13]중간체의 추가 변형을 가능하게 한다.
펩타이볼의 주목할 만한 특징으로는 C 말단 알코올 잔류물(페닐알라니놀, 류시놀, 이소류시놀, [7][14]발리놀), N-아실 말단(일반적으로 아세틸)[14] 및 고농도의 α, α-다이알킬화 비단백질화 아미노산[Aib-aminoic acid(Aib), 이소발레릭산(Provyline)]이 있다.대부분의 경우 펩타이볼은 3차원 구조에서 α-나선 및 β-bend 패턴을 형성한다(α-아미노이소낙산은 턴/[16]나선 형성제이다).펩타이볼의 α,α-다이알킬화 아미노산 잔기는 펩타이드 골격에 상당한 입체구조를 형성하여 오른손잡이 α-나선 [17][18]구조를 형성한다.막변형능력은 트랜스막 전압의존채널의 [14][19][20]형성에 기인할 수 있다.이는 펩타이드가 지질양층 접촉 시 α-나선배열을 취하여 이온채널 [20][21]단백질의 전기생리학적으로 유사한 구성을 가진 이온채널을 뚫어 형성하기 때문에 발생한다.펩타이드의 주요 기능은 막을 파열하고, 다시 삼투압 균형 [21]상실을 통한 세포 분해를 촉발하는 것이다.
구조적으로 볼 때 리포펩타이볼은 N 말단 아미노산[16](따라서 명칭)과 연결된 지방 아실 부분을 가진 펩타이볼로 다수의 토양 곰팡이로부터 분리되었다.기본 구조는 모두 2-(α-) [16]카본에서 L-(S-) 구성을 가집니다.이들은 압도적으로 미세 이질성을 나타낸다(구조적으로 매우 유사하며, 자연 표본의 보존된 변동 풀이 제한된다).
구조.
![](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/f/f8/Halovir_A_modeling.png/220px-Halovir_A_modeling.png)
7 ({ H83N7O9 - 할로비르 A : L-류신, L-발린 및 L-글루타민 함유
N ({ - 할로비르 B : L-알라닌, L-류신, L-글루타민 함유
O ({ H83N7O8 - 할로비르 C: L-류신, L-발린, L-글루타민,
H 9 ({ - 할로비르 D
H 8 ({ - 할로비르 E
H 7 8 ({ - 할로비르 I
H 9 ({ - Halovir J
H 7 ({ - Halovir K
의료 응용 프로그램
이러한 화합물의 항생제 기능은 막 삽입 및 모공 형성 [12]기능에 기인할 수 있으며, 일반적으로 그램 양성 박테리아와 [14][23]곰팡이에서 항균 활성을 보인다.
할로비르스 A-E(Skytidium sp로부터 격리된)는 HSV-1에 대해 강력한 항바이러스 활성을 보였으며 세포독성이 없는 표준 플라크 감소 분석에서 HSV-1과 HSV-2의[24] 복제 억제를 수행하는 것이 관찰되었다.85μM)[24] 역학 연구에 따르면 할로비르는 숙주세포에 영향을 미치기 전에 직접 접촉하여 시간에 의존하여 바이러스를 죽인다.
할로비르 I과 J를 항균 및 세포독성 활성으로 분석하여 그램 양성균 2종(황색포도상구균, 장구균 분변)에 대하여 유의한 성장 억제를 보였으나 그램 음성 [7]대장균은 아니었다.특히 이들 두 할로비르는 메티실린 내성 S. aureus(MRSA)와 반코마이신 내성 E. faeccium에 대해 효과가 있는 것으로 밝혀져 이들에 대한 활성이 [7]지속됨을 나타냈다.또한 인간 폐카리노마 A549, 인간 유방암 MCF-7, 인간 자궁경부암 Hela 세포를 포함한 암세포주 패널에 대해 강한 세포독성 활성이 관찰되었다(참조 연구에서 [7]세포독성은 암세포에 특정되지 않았다).
레퍼런스
- ^ a b "Halovir, an antiviral marine natural product, and derivatives thereof - Patent US-2003013659-A1 - PubChem". pubchem.ncbi.nlm.nih.gov. Retrieved 2022-10-09.
- ^ a b Rowley, David C.; Kelly, Sara; Kauffman, Christopher A.; Jensen, Paul R.; Fenical, William (2004-02-10). "Halovirs A-E, New Antiviral Agents from a Marine-Derived Fungus of the Genus Scytalidium". ChemInform. 35 (6). doi:10.1002/chin.200406159. ISSN 0931-7597.
- ^ Rowley, David C.; Kelly, Sara; Jensen, Paul; Fenical, William (September 2004). "Synthesis and structure–activity relationships of the halovirs, antiviral natural products from a marine-derived fungus". Bioorganic & Medicinal Chemistry. 12 (18): 4929–4936. doi:10.1016/j.bmc.2004.06.044. PMID 15336272.
- ^ Toniolo, C.; Crisma, M.; Formaggio, F.; Peggion, C.; Epand, R.F.; Epand, R.M. (August 2001). "Lipopeptaibols, a novel family of membrane active, antimicrobial peptides". Cellular and Molecular Life Sciences. 58 (9): 1179–1188. doi:10.1007/PL00000932. ISSN 1420-682X. PMID 11577977. S2CID 9679066.
- ^ a b Auvin-Guette, Catherine; Rebuffat, Sylvie; Prigent, Yann; Bodo, Bernard (March 1992). "Trichogin A IV, an 11-residue lipopeptaibol from Trichoderma longibrachiatum". Journal of the American Chemical Society. 114 (6): 2170–2174. doi:10.1021/ja00032a035. ISSN 0002-7863.
- ^ a b Xiao, Dongliang; Zhang, Mei; Wu, Ping; Li, Tianyi; Li, Wenhua; Zhang, Liwen; Yue, Qun; Chen, Xinqi; Wei, Xiaoyi; Xu, Yuquan; Wang, Chen (May 2022). "Halovirs I–K, antibacterial and cytotoxic lipopeptaibols from the plant pathogenic fungus Paramyrothecium roridum NRRL 2183". The Journal of Antibiotics. 75 (5): 247–257. doi:10.1038/s41429-022-00517-7. ISSN 0021-8820. PMID 35288678. S2CID 247451837.
- ^ a b c d e f g h i j Xiao, Dongliang; Zhang, Mei; Wu, Ping; Li, Tianyi; Li, Wenhua; Zhang, Liwen; Yue, Qun; Chen, Xinqi; Wei, Xiaoyi; Xu, Yuquan; Wang, Chen (May 2022). "Halovirs I–K, antibacterial and cytotoxic lipopeptaibols from the plant pathogenic fungus Paramyrothecium roridum NRRL 2183". The Journal of Antibiotics. 75 (5): 247–257. doi:10.1038/s41429-022-00517-7. ISSN 0021-8820. PMID 35288678. S2CID 247451837.
- ^ a b Richardt, Arnd; Kemme, Tobias; Wagner, Stefanie; Schwarzer, Dirk; Marahiel, Mohamed A.; Hovemann, Bernhard T. (2003-10-17). "Ebony, a novel nonribosomal peptide synthetase for beta-alanine conjugation with biogenic amines in Drosophila". The Journal of Biological Chemistry. 278 (42): 41160–41166. doi:10.1074/jbc.M304303200. ISSN 0021-9258. PMID 12900414.
- ^ a b Shou, Qingyao; Feng, Likui; Long, Yaoling; Han, Jungsoo; Nunnery, Joshawna K.; Powell, David H.; Butcher, Rebecca A. (October 2016). "A hybrid polyketide-nonribosomal peptide in nematodes that promotes larval survival". Nature Chemical Biology. 12 (10): 770–772. doi:10.1038/nchembio.2144. ISSN 1552-4469. PMC 5030153. PMID 27501395.
- ^ a b c Süssmuth, Roderich; Müller, Jane; Döhren, Hans von; Molnár, István (2010-12-17). "Fungal cyclooligomer depsipeptides: From classical biochemistry to combinatorial biosynthesis". Natural Product Reports. 28 (1): 99–124. doi:10.1039/C001463J. ISSN 1460-4752. PMID 20959929.
- ^ Felnagle, Elizabeth A.; Jackson, Emily E.; Chan, Yolande A.; Podevels, Angela M.; Berti, Andrew D.; McMahon, Matthew D.; Thomas, Michael G. (2008-04-01). "Nonribosomal Peptide Synthetases Involved in the Production of Medically Relevant Natural Products". Molecular Pharmaceutics. 5 (2): 191–211. doi:10.1021/mp700137g. ISSN 1543-8384. PMC 3131160. PMID 18217713.
- ^ a b Hou, Xuewen; Sun, Ruonan; Feng, Yanyan; Zhang, Runfang; Zhu, Tianjiao; Che, Qian; Zhang, Guojian; Li, Dehai (2022-09-01). "Peptaibols: Diversity, bioactivity, and biosynthesis". Engineering Microbiology. 2 (3): 100026. doi:10.1016/j.engmic.2022.100026. ISSN 2667-3703. S2CID 249417277.
- ^ a b Bills, Gerald; Li, Yan; Chen, Li; Yue, Qun; Niu, Xue-Mei; An, Zhiqiang (2014-09-11). "New insights into the echinocandins and other fungal non-ribosomal peptides and peptaibiotics". Natural Product Reports. 31 (10): 1348–1375. doi:10.1039/C4NP00046C. ISSN 1460-4752. PMID 25156669.
- ^ a b c d e Wiest, Aric; Grzegorski, Darlene; Xu, Bi-Wen; Goulard, Christophe; Rebuffat, Sylvie; Ebbole, Daniel J.; Bodo, Bernard; Kenerley, Charles (2002-06-07). "Identification of Peptaibols from Trichoderma virens and Cloning of a Peptaibol Synthetase *". Journal of Biological Chemistry. 277 (23): 20862–20868. doi:10.1074/jbc.M201654200. ISSN 0021-9258. PMID 11909873.
- ^ Whitmore, Lee; Wallace, B. A. (2004-01-01). "The Peptaibol Database: a database for sequences and structures of naturally occurring peptaibols". Nucleic Acids Research. 32 (Database issue): D593–D594. doi:10.1093/nar/gkh077. ISSN 0305-1048. PMC 308811. PMID 14681489.
- ^ a b c Toniolo, C.; Crisma, M.; Formaggio, F.; Peggion, C.; Epand, R.F.; Epand, R.M. (August 2001). "Lipopeptaibols, a novel family of membrane active, antimicrobial peptides". Cellular and Molecular Life Sciences. 58 (9): 1179–1188. doi:10.1007/PL00000932. ISSN 1420-682X. PMID 11577977. S2CID 9679066.
- ^ Marshall, G R; Hodgkin, E E; Langs, D A; Smith, G D; Zabrocki, J; Leplawy, M T (January 1, 1990). "Factors governing helical preference of peptides containing multiple alpha,alpha-dialkyl amino acids". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 87 (1): 487–491. Bibcode:1990PNAS...87..487M. doi:10.1073/pnas.87.1.487. ISSN 0027-8424. PMC 53289. PMID 2296604.
- ^ Schweitzer-Stenner, Reinhard; Gonzales, Widalys; Bourne, Gregory T.; Feng, Jianwen A.; Marshall, Garland R. (2007-10-01). "Conformational Manifold of α-Aminoisobutyric Acid (Aib) Containing Alanine-Based Tripeptides in Aqueous Solution Explored by Vibrational Spectroscopy, Electronic Circular Dichroism Spectroscopy, and Molecular Dynamics Simulations". Journal of the American Chemical Society. 129 (43): 13095–13109. doi:10.1021/ja0738430. ISSN 0002-7863. PMID 17918837.
- ^ Rebuffat, S.; Duclohier, H.; Auvin-Guette, C.; Molle, G.; Spach, G.; Bodo, B. (September 1992). "Membrane-modifying properties of the pore-forming peptaibols saturnisporin SA IV and harzianin HA V". FEMS Microbiology Immunology. 5 (1–3): 151–160. doi:10.1111/j.1574-6968.1992.tb05886.x. ISSN 0920-8534. PMID 1384595.
- ^ a b Sansom, Mark S. P.; Kerr, Ian D.; Mellor, Ian R. (1991-11-01). "Ion channels formed by amphipathic helical peptides". European Biophysics Journal. 20 (4): 229–240. doi:10.1007/BF00183460. ISSN 1432-1017. PMID 1725513. S2CID 23503646.
- ^ a b Huang, Huey W. (1996), Merz, Kenneth M.; Roux, Benoît (eds.), "Structural Basis and Energetics of Peptide Membrane Interactions", Biological Membranes: A Molecular Perspective from Computation and Experiment, Boston, MA: Birkhäuser, pp. 281–298, doi:10.1007/978-1-4684-8580-6_9, ISBN 978-1-4684-8580-6, retrieved 2022-10-10
- ^ "Support pymol.org". pymol.org. Retrieved 2022-11-27.
- ^ Jen, W. -C.; Jones, G. A.; Brewer, D.; Parkinson, V. O.; Taylor, A. (October 1987). "The antibacterial activity of alamethicins and zervamicins". Journal of Applied Bacteriology. 63 (4): 293–298. doi:10.1111/j.1365-2672.1987.tb02705.x. PMID 3436854.
- ^ a b Rowley, David C.; Kelly, Sara; Kauffman, Christopher A.; Jensen, Paul R.; Fenical, William (2004-02-10). "Halovirs A-E, New Antiviral Agents from a Marine-Derived Fungus of the Genus Scytalidium". ChemInform. 35 (6). doi:10.1002/chin.200406159. ISSN 0931-7597.