플라보박테리아목
Flavobacteriales플라보박테리아목 | |
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베르헤이엘라 동물원 | |
과학적 분류 | |
도메인: | 박테리아 |
망울: | "박테로데테스" |
클래스: | 플라보박테리아 |
순서: | 플라보박테리아목 베르나르데 2012[1] |
패밀리[2] | |
플라보박테리알레스는 여러 종류의 환경 박테리아로 구성되어 있다.[3]
유전체학 및 분자 서명 비교
플라보박테리알레스는 망막 "박테로이드"의 주문 중 하나이다.[2] 비교 유전학 연구는 보존된 몇몇 인델과 이러한 추론을 뒷받침하는 서로 다른 서열화된 플라보박테리알레스와 박테로이데테스 종에 의해 독특하게 공유되는 27개의 단백질을 확인했다.[4][5] 게다가, 이 연구들은 또한 플라보박테리알의 순서에서 그 종에 특정된 것처럼 보이는 38개의 단백질을 확인했다.[5] 이 단백질들 중 26개는 서열화된 모든 종에 존재했고, 나머지 12개는 오직 한 두 종에서만 실종되었다. 이러한 특징적인 단백질은 이 질서에 대한 잠재적인 분자 표지를 제공한다. 플라보박테리알레스와 박테로이데탈레스 주문에 고유한 몇 가지 단백질도 확인되었는데, 이는 이 두 주문의 종들이 다른 "박테로데테스"의 배타적인 공통 조상을 공유했음을 보여준다.[5]
필로제니
현재 받아들여지고 있는 분류법은 명목상의[2] 서열을 가진 원핵생물학적 이름 리스트에 기초하고, 계통생성은 전유전자순서에 기초한다.[6][a]
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메모들
- ^ 블라타박테리아과(Blattabacteria과)는 이 족유전 나무에는 포함되어 있지 않다.
참조
- ^ Bernardet J-F. (2010). "Order I. Flavobacteriales ord. nov.". In Krieg NR, Staley JT, Brown DR, Hedlund BP, Paster BJ, Ward NL, Ludwig W, Whitman WB (eds.). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 4 (2nd ed.). New York, NY: Springer. p. 105.
- ^ a b c Euzéby JP, Parte AC. "Flavobacteriales". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved June 29, 2021.
- ^ Boone DR, Castenholz RW, eds. (2001). Bergey's Manual of Systematic Bacteriology. Vol. 1 (The Archaea and the deeply branching and phototrophic Bacteria) (2nd ed.). New York, NY: Springer-Verlag. pp. 465–466.
- ^ Gupta RS. (2004). "The phylogeny and signature sequences characteristics of Fibrobacteres, Chlorobi, and Bacteroidetes". Critical Reviews in Microbiology. 30 (2): 123–140. doi:10.1080/10408410490435133. PMID 15239383. S2CID 24565648.
- ^ a b c Gupta RS, Lorenzini, E. (2007). "Phylogeny and molecular signatures (conserved proteins and indels) that are specific for the Bacteroidetes and Chlorobi species". BMC Evolutionary Biology. 7: 71. doi:10.1186/1471-2148-7-71. PMC 1887533. PMID 17488508.
- ^ García-López M, Meier-Kolthoff JP, Tindall BJ, Gronow S, Woyke T, Kyrpides NC, Hahnke RL, Göker M (2019). "Analysis of 1,000 Type-Strain Genomes Improves Taxonomic Classification of Bacteroidetes". Front Microbiol. 10: 2083. doi:10.3389/fmicb.2019.02083. PMC 6767994. PMID 31608019.