고생물학

Paleovirology

고생물학은 과거에 존재했지만 지금은 멸종된 바이러스에 대한 연구이다.일반적으로 바이러스는 물리적인 [1]화석을 남길 수 없기 때문에 간접적인 증거가 과거를 재구성하는 데 사용된다.예를 들어, 바이러스는 호스트의 진화를 일으킬 수 있으며,[2] 그 진화의 시그니처는 현재에 와서도 발견 및 해석할 수 있습니다.또한, 고대 유기체의 생식세포에 통합된 일부 바이러스 유전자 조각은 바이러스 [2]화석, 즉 내인성 바이러스 요소(EVE)[3]로 우리 시대에 전해져 왔다.레트로바이러스의 통합에서 유래한 EVE는 내인성 레트로바이러스로 알려져 있으며, 대부분의 바이러스 화석은 EERV이다.[4]비록 아무도 광물 화석에서 바이러스를 발견하지 못했지만, 그들은 수백만 년 전의 유전자 코드를 보존할 수 있고, 따라서 "화석"[2]이라는 용어를 사용할 수 있다.가장 놀라운 바이러스 화석은 비레트로바이러스 DNA와 RNA 바이러스에서 유래한다.

용어.

EVE에 대한 공식적인 분류 체계는 없지만, 바이러스 기원의 분류법에 따라 분류된다.실제로 볼티모어 분류에 의해 정의된 모든 알려진 바이러스 게놈 유형과 복제 전략은 게놈 [5][6]화석 기록에서 발견되었습니다.두문자어는 다양한 종류의 바이러스 화석을 설명하기 위해 지정되었다.

  • EVE: 내인성 바이러스 요소
  • ERV: 내인성 레트로바이러스
  • HERV: 인간 내인성 레트로바이러스
  • NIRV: 비레트로바이러스 RNA 바이러스에서 유래한 바이러스 화석은 비레트로바이러스 집적 RNA 바이러스 또는 NIRV라고 [7][8]불립니다.다른 종류의 바이러스 화석과 달리, NIRV 형성은 숙주 게놈이나 공동 감염 레트로바이러스에 [9]의해 코드화된 통합 기구를 빌려야 한다.

다른 바이러스 화석들은 헤파드나바이러스와 같은 DNA 바이러스로부터 유래한다.[10]

부활.

DNA 화석에서 멸종된 바이러스를 "복원"하려는 성공적인 시도가 보고되었다.[11]게다가, 피토바이러스 시베리쿰은 러시아 [12][13]시베리아의 영구 동토층에서 수확한 3만년 된 얼음 핵에서 되살아났다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Laidler, J.R.; Stedman, K.M. (2010). "Virus Silicification under Simulated Hot Spring Conditions". Astrobiology. 10 (6): 569–576. Bibcode:2010AsBio..10..569L. doi:10.1089/ast.2010.0463. PMID 20735248.
  2. ^ a b c Emerman, M.; Malik, H.S. (2010). "Paleovirology – Modern Consequences of Ancient Viruses". PLOS Biology. 8 (2): e1000301. doi:10.1371/journal.pbio.1000301. PMC 2817711. PMID 20161719.
  3. ^ Katzourakis, Aris; Gifford, Robert J. (18 November 2010). "Endogenous Viral Elements in Animal Genomes". PLOS Genetics. 6 (11): e1001191. doi:10.1371/journal.pgen.1001191. PMC 2987831. PMID 21124940.
  4. ^ Weiss, RA (Oct 3, 2006). "The discovery of endogenous retroviruses". Retrovirology. 3: 67. doi:10.1186/1742-4690-3-67. PMC 1617120. PMID 17018135.
  5. ^ Pakorn Aiewsakun, Aris Katzourakis (2015). "Endogenous viruses: Connecting recent and ancient viral evolution". J. Virol. 479–480: 26–37. doi:10.1016/j.virol.2015.02.011. PMID 25771486.
  6. ^ Aris Katzourakis, Robert J. Gifford (2010). "Endogenous Viral Elements in Animal Genomes". PLOS Genet. 6 (11): e1001191. doi:10.1371/journal.pgen.1001191. PMC 2987831. PMID 21124940.
  7. ^ Taylor, D. J.; J. Bruenn (2009). "The evolution of novel fungal genes from non-retroviral RNA viruses". BMC Biology. 7: 88. doi:10.1186/1741-7007-7-88. PMC 2805616. PMID 20021636.
  8. ^ Koonin, E. (2010). "Taming of the shrewd: novel eukaryotic genes from RNA viruses". BMC Biology. 8: 2. doi:10.1186/1741-7007-8-2. PMC 2823675. PMID 20067611.
  9. ^ Lida, Atsuo (2020). "Heritable endogenization of an RNA virus in a mammalian species". bioRxiv. doi:10.1101/2020.01.19.911933.
  10. ^ Catherine Harmon, Scientific American, 2010년 9월 29일 "고대 "화석" 바이러스, 수백만 년 전의 감염을 나타냄"
  11. ^ "멸종한 레트로바이러스를 부활시키는 방법", Scientific American, 2006년 11월 2일
  12. ^ Yong, Ed (3 March 2014). "Giant virus resurrected from 69,000-year-old ice". Nature. doi:10.1038/nature.2014.14801. S2CID 87146458.
  13. ^ Morelle, Rebecca (3 March 2014). "30,000-year-old giant virus 'comes back to life'". BBC News.