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PRINTS분자생물학에서 PRINTS 데이터베이스는 소위 "지문"[1][2]의 집합체이다. 즉, 단백질 패밀리에 대한 상세한 주석 자원과 새로 결정된 시퀀스에 대한 진단 도구를 모두 제공한다.지문은 다중 배열 정렬에서 가져온 보존 모티브의 그룹입니다. 이 모티브는 정렬된 단백질 패밀리의 특징적인 시그니처를 형성합니다.모티브 자체는 반드시 순차적으로 연속되지 않지만 분자 결합 부위 또는 상호작용 표면을 정의하기 위해 3D 공간에서 함께 모일 수 있습니다.지문의 특정 진단 강도는 씨족, 슈퍼 패밀리, 가족 및 아족 수준에서 배열 차이를 구별할 수 있는 능력에 있습니다.이는 예를 들어 가족 구성원들이 결합하는 리간드 또는 그들이 상호작용하는 단백질에 기초한 가족 구성원 간의 차별을 허용하고 잠재적 올리고머화 또는 알로스테릭 부위를 강조하여 특징지어지지 않은 배열의 세분화된 기능 진단을 가능하게 한다.
PRINTS는 단백질 패밀리, 도메인 및 기능 사이트의 데이터베이스로 널리 사용되는 통합 리소스 InterPro의 창립 파트너입니다.
레퍼런스
- ^ Attwood, T. K.; Bradley, P.; Flower, D. R.; Gaulton, A.; Maudling, N.; Mitchell, A. L.; Moulton, G.; Nordle, A.; Paine, K.; Taylor, P.; Uddin, A.; Zygouri, C. (2003). "PRINTS and its automatic supplement, prePRINTS". Nucleic Acids Research. 31 (1): 400–402. doi:10.1093/nar/gkg030. PMC 165477. PMID 12520033.
- ^ Scordis, P.; Flower, D. R.; Attwood, T. K. (1999). "FingerPRINTScan: Intelligent searching of the PRINTS motif database". Bioinformatics. 15 (10): 799–806. doi:10.1093/bioinformatics/15.10.799. PMID 10705433.
외부 링크
- PRINTS 데이터베이스(맨체스터 대학교 생물정보학 교육연구)
