오픈 트리 오브 라이프

Open Tree of Life
오픈 트리 오브 라이프
다음에서 사용 가능영어
URLopentreeoflife.org
상업적아니요.
등록필수가 아닌
시작됨2015년 9월
현재 상태적극적
콘텐츠 라이선스
BSD 2-클러스터(FreeB)SD)[1]

생명의 열린 나무(Open Tree of Life)는 생명의 온라인 계통적 나무로, 국립과학재단이 후원하는 협력적 노력이다.[2][3] 230만 종을 포함한 초안은 2015년 9월 출시됐다.[4] 인터랙티브 그래프를 통해 사용자는 분류학 분류, 계통생성 트리 및 노드에 대한 정보를 확대할 수 있다. 종을 클릭하면 출처와 참조 분류법이 반환된다.

유카리오타 노드의 생명의 나무

접근하다

이 프로젝트에서는 슈퍼트리 접근방식을 사용하여 종합적인 분류법과 간행된 계통생성 추정치에서 단일 계통생성계수(tree.opentreeoflife.org[5]에서 제공)를 생성한다.

분류법은 다른 프로젝트에서 생성된 몇 가지 대규모 분류의 조합으로, "스마셔"라는 소프트웨어 도구를 사용하여 생성된다. 그 결과 분류법은 OTT(Open Tree Taxonomy)라고 하며 온라인에서 탐색할 수 있다.[7]

역사

이 프로젝트는 2012년 6월 10개 대학 연구진에게 3년간 NSF상을 수여하며 시작됐다. 2015년에는 3개 기관의 연구자들에게 2년 간 보완상이 주어졌다.

참고 항목

참조

  1. ^ "OpenTreeOfLife License".
  2. ^ Hinchliff CE, Smith SA, Allman JF, Burleigh JG, Chaudhary R, Coghill LM, et al. (October 2015). "Synthesis of phylogeny and taxonomy into a comprehensive tree of life". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 112 (41): 12764–9. Bibcode:2015PNAS..11212764H. doi:10.1073/pnas.1423041112. PMC 4611642. PMID 26385966.
  3. ^ "Assembling, Visualizing, and Analyzing the Tree of Life". National Science Foundation (NSF). Retrieved 2016-02-11.
  4. ^ Pennisi E (21 September 2015). "First comprehensive tree of life shows how related you are to millions of species". Science Magazine.
  5. ^ <mtholder@gmail.com>, Open Tree of Life developers. "opentree".
  6. ^ Rees JA, Cranston K (2017). "Automated assembly of a reference taxonomy for phylogenetic data synthesis". Biodiversity Data Journal. 5 (5): e12581. doi:10.3897/BDJ.5.e12581. PMC 5515096. PMID 28765728.
  7. ^ "tree.opentreeoflife.org".