마이클 그리브스코프
Michael Gribskov
마이클 그리브스코프는 퍼듀 대학의 생물학 및 컴퓨터 과학 교수다.1979년 그리브스코프는 오레곤 주립대학을 졸업했으며, 생화학 및 생물물리학 학사 학위를 받았다.이후 1985년 위스콘신-매디슨 대학에서 분자생물학 박사학위를 마쳤다.[1]
그는 대통령은 국제 사회의 전산 Biology,[2]과 그의 학과 페이지의 주를 단백질 정보 자원 과학 감독과 자문 위원회 때문이 그의 의자 그리고는 일기의 사설 게시판에 Bioinformatics면 필기장 전산 생물학, 화학, 저널 분자 마이크로의. 서빙을 해생물학로지 &[1] 생명 공학
| 연도 | 포지션 |
|---|---|
| 1979 | 오레곤 주립대학 생화학 및 생물물리학에서 명예상을 받은 B.S. |
| 1979–1984 | 위스콘신 매디슨 대학교 NIH 전임자 훈련 |
| 1985 | 위스콘신-매디슨 분자생물대학 박사 |
| 1985–1987 | American Cancer Society of California - 로스엔젤레스 박사 후 펠로우쉽 대학교 |
| 1988–1992 | 국립 암 연구소 과학자 협회—FCRDC |
| 1992 | 직원 과학자 샌디에이고 슈퍼컴퓨터 센터 |
| 1993–1996 | 샌디에이고 슈퍼컴퓨터 센터 선임 과학자 |
| 1993–1999 | 샌디에이고 캘리포니아 생물대학 부교수 |
| 1994–1997 | 핵산 데이터베이스에 대한 주요 조사관 구조 질의 |
| 1999–2003 | 샌디에이고 캘리포니아 생물대학 부교수 |
| 2004-현재 | 퍼듀대 생물과학컴퓨터과학부 교수 |
종단분석
그리브스코프는 다비드 아이젠버그, 앤드류 맥라클란과 함께 1987년 프로파일 분석법을 도입했는데, 이는 시퀀스 비교에 의해 원거리 관련 단백질을 검출하는 방법이다.프로파일은 포지션별 채점 매트릭스로, 이전에 정렬된 시퀀스 그룹(프로브)에서 생성된다.프로브에 대한 다른 시퀀스(표적)의 유사성(1개 이상)은 동적 프로그래밍을 사용하여 대상을 파일과 비교하여 테스트할 수 있다.이 알고리즘은 두 단계로 구성된다.첫 번째 단계는 소프트웨어 PROFWARE를 사용하여 프로필을 생성하는 것으로, 시퀀스 유사성에 기반한 기존 정렬(프로브)이나 해당 3D 구조를 사용하여 프로필을 생성한다.두 번째 단계는 프로파일을 시퀀스 또는 단일 시퀀스의 데이터베이스와 비교하는 것이다.이 단계에서 생성된 프로파일에 기초하여 목표 시퀀스 또는 시퀀스 그룹을 PROFINAL을 사용하여 정렬할 수 있으며, 정렬에서 동적 프로그래밍을 사용한다.[3]
참조
- ^ a b 2011-12-03년 웨이백 머신에 보관된 퍼듀 대학교 교수진 프로파일
- ^ ISCB의 역사
- ^ Gribskov, M; McLachlan, AD; Eisenberg, D (July 1987). "Profile analysis: detection of distantly related proteins". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 84 (13): 4355–8. Bibcode:1987PNAS...84.4355G. doi:10.1073/pnas.84.13.4355. PMC 305087. PMID 3474607.
