맨해튼 플롯

Manhattan plot
몇 가지 강하게 연관된 위험 위치를 묘사한 맨해튼의 그림

맨해튼 플롯플롯의 일종으로, 데이터 포인트가 많고 진폭이 0이 아닌 것이 많으며, 크기가 더 큰 값의 분포를 갖는 데이터를 표시하는 데 주로 사용된다.이 플롯은 중요한 SNP를 표시하기 위해 게놈 전체 연관 연구(GWAS)에서 일반적으로 사용된다.[1]null

그것은 그러한 음모유사성에서 맨하탄의 스카이라인 즉, 낮은 높이에 따라 달라지는 낮은 층의 "건물" 위에 우뚝 솟은 고층 빌딩의 프로필에서 그 이름을 얻었다.null

GWAS

왜냐하면 가장 강력한 가능성은 작은 p-values, 그들의 neg(예:10−15)다 GWAS 맨해튼 계획에서, 유전자 좌표는 x 축을 따라, 각각의 단일 염기 다형성(스코틀랜드 국민당)은 y 축에 위해 협회는 p값의 부정적인 로그, 그 맨하탄의 대지 위에 각각의 점은 SNP을 의미한다는 점을 의미한다. 표시됩니다.ative 로그가 가장 클 것이다(예: 15).각 블록의 다른 색깔들은 보통 각 염색체의 정도를 보여준다.null

참조

  1. ^ Gibson, Greg (2010). "Hints of hidden heritability in GWAS". Nature Genetics. 42 (7): 558–560. doi:10.1038/ng0710-558. PMID 20581876.