상보성 결정 영역

Complementarity-determining region
항체의 "상부" 부분(Fab 영역).중쇄의 상보성 결정 영역은 빨간색(PDB: 1IGT)으로 표시됩니다.

상보성 결정 영역(CDR)은 면역글로불린(항체) 수용체와 T세포 수용체의 가변 사슬의 일부이며, 각각 B세포와 T세포에 의해 생성되며, 여기서 이들 분자는 특이 항원에 결합한다.CDR 세트가 파라토프를 구성합니다.CDR은 분자의 가장 가변적인 부분으로서 림프구에 의해 생성되는 항원특성의 다양성에 매우 중요하다.

위치 및 구조

파란색으로 표시된 가변 도메인을 가진 항체 및 연한 파란색으로 표시된 CDR의 스케치.

항원 수용체의 가변 도메인의 아미노산 배열에는 3개의 CDR(CDR1, CDR2, CDR3)이 비연속적으로 배열되어 있다.항원 수용체는 전형적으로 두 개의 가변 도메인(두 개의 다른 폴리펩타이드 사슬, 무거운 사슬 및 가벼운 사슬)으로 구성되기 때문에, 각 항원 수용체에 대해 집단적으로 항원과 접촉할 수 있는 CDR이 6개 있다.단일 항체 분자는 2개의 항원 수용체를 가지며, 따라서 총 12개의 CDR을 포함한다.항체에는 변수 도메인마다 3개의 CDR 루프가 있습니다.오분자 IgM 분자에는 60개의 CDR이 있습니다.

면역글로불린과 T세포 수용체와 관련된 대부분의 배열 변이가 CDR에서 발견되기 때문에, 이러한 영역을 초가변 [1]영역이라고 부르기도 한다.가변 도메인 내에서 CDR1 및 CDR2는 폴리펩타이드 사슬의 가변(V) 영역에서 발견되며, CDR3은 V의 일부, 모든 다양성(D, 중쇄만) 및 결합([2]J) 영역을 포함한다.CDR3은 가장 가변적입니다.

항체의 3차 구조는 새로운 항체를 분석하고 설계하는 데 중요하다.항체의 비 H3 CDR의 3차원 구조는 Chothia [3]등에 의해 클러스터화 및 분류되었으며, [4]최근에는 North 등에 의해 분류되었다.호몰로지 모델링은 아미노산 배열로부터 3차 구조를 구축하는 계산 방법이다.이른바 H3 규칙은 CDR3의 [5]모델을 구축하기 위한 경험적 규칙입니다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ Abbas AK and Lichtman AH (2003). Cellular and Molecular Immunology (5th ed.). Saunders, Philadelphia. ISBN 0-7216-0008-5.
  2. ^ William E. Paul (2008). Fundamental Immunology (6th ed.). Lippincott Williams & Wilkins. ISBN 978-0-7817-6519-0.
  3. ^ Al-Lazikani, B.; Lesk, A. M.; Chothia, C. (1997). "Standard conformations for the canonical structures of immunoglobulins". Journal of Molecular Biology. 273 (4): 927–948. doi:10.1006/jmbi.1997.1354. PMID 9367782.
  4. ^ North, B.; Lehmann, A.; Dunbrack Jr, R. L. (2011). "A New Clustering of Antibody CDR Loop Conformations". Journal of Molecular Biology. 406 (2): 228–256. doi:10.1016/j.jmb.2010.10.030. PMC 3065967. PMID 21035459.
  5. ^ Shirai, H; Kidera, A; Nakamura, H (1999). "H3-rules: identification of CDR-H3 structures in antibodies". FEBS Letters. 455 (1–2): 188–97. doi:10.1016/S0014-5793(99)00821-2. PMID 10428499.

외부 링크