카메오3D

CAMEO(Continuous Automated Model EvaluatiOn)는 단백질 구조 예측 서버의 정확성과 신뢰성을 완전 자동화 방식으로 지속적으로 평가하는 지역사회 차원의 프로젝트다.^[1] 카메오는 2년마다 실시되는 CASP 실험의 지속적이고 완전 자동화된 보완물이다.^[2]

현재 카메오는 3차원 단백질 구조 예측(3D), 단백질 내 리간드 결합 부위 예측(LB), 모델 품질 추정 도구(QE) 등을 평가한다.^{[clarification needed]}

워크플로우

COMEO는 단백질 데이터뱅크(PDB)에 의해 새롭게 결정된 실험구조의 주별 출시를 바탕으로 단백질 구조 예측 기법의 맹목적인 평가를 실시한다. 곧 출시될 단백질 구조의 아미노산 시퀀스는 참여 웹서버에 제출된다. 웹서버는 예측을 COMEO에 반환하며, 실험구조가 공개되기 전에 받은 예측은 예측 정확도 평가에 포함된다. CASP 실험과는 대조적으로 예측 데이터와 기준 데이터의 비교는 완전히 자동화되므로 상대적 영역 이동에 대해 강력한 수치 거리 측정이 필요하다.^[3]

역사

카메오는 단백질 구조 이니셔티브의 일환으로 구조 생물학 지식 베이스의^[5] 단백질 모델 포털^[4] 모듈의 일부로 개발되었다^[when?]. 카메오는 SIB스위스 생명정보학 연구소의 컴퓨터 구조 생물학 그룹과 바젤 대학의 바이오젠트럼에 의해 개발되고 있다.^{[citation needed]}

유사한 목적을 가진 초기 프로젝트들은 EVA와 라이브벤치였다.^{[citation needed]}

참고 항목

• 단백질 구조 예측 소프트웨어

참조

외부 링크

• 카메오 홈페이지
• 단백질 모델 포털