므타노칼도코쿠스 야나스키이
Methanocaldococcus jannaschii| 므타노칼도코쿠스 야나스키이 | |
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| 종: | M. 얀나스키 |
| 이항식 이름 | |
| 므타노칼도코쿠스 야나스키이 | |
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메타노칼도코쿠스 야나스키(Methanococcus jannaschii, 구 Methanoccus jannaschii)는 메타노코치 등급의 열성 메타노카노케스 유발 고고학자다. 그것은 완전한 게놈 서열을 작성한 최초의 고고학자였다.[1] 그 염기서열 분석은 고고학자에게 고유한 많은 유전자를 확인했다. 메탄젠 공효소에 대한 많은 합성 경로는 이 유기체에서 생화학적으로 연구되었고,[2] 다른 고고학적 특정 대사 경로도 그러했다.
역사
Methanocaldoccus jannaschii는 우즈홀 해양학 연구소의 잠수함 열수 분출구에서 격리되었다.[3]
시퀀싱
Methanocaldoccus jannaschii는 Graig Venter가[4] 이끄는 TIGR의 한 그룹에 의해 전유전자 엽총 시퀀싱으로 서열화되었다. Methanocaldoccus jannaschii는 그것의 게놈 서열을 정리한 최초의 고고학자를 대표했다. 벤터에 따르면, 게놈의 독특한 특징들은 세 개의 생명체가 살고 있다는 강력한 증거를 제공했다.[4]
분류학
메타노칼도쿠스 얀나스치이는 메타노칼도코쿠스속(이전에는 메타노코쿠스의 일부)의 일원으로, 따라서 "클래스 I" 메타노겐(예: [1])으로 언급되기도 한다.
생물학과 생화학
메탄노칼도쿠스 잔나스치이는 열성 메탄겐으로 메탄을 대사 부산물로 만들어 성장한다는 뜻이다. 포메이트를 1차 에너지원으로도 사용할 수 있는 다른 많은 메타노코쿠스(Methanococcus maripalidus 등)와는 달리 1차 에너지원으로서 이산화탄소와 수소에 대해서만 성장이 가능하다.[3] 게놈에는 5,10메테닐테트라히드로메탄노프테린 수소효소,[5] 페레독신 수소효소(eha), 코엔자임 F420 수소효소 등 많은 수소효소가 포함되어 있다.[6]
단백질학 연구는 M. Jannaschii가 많은 정수를 함유하고 있다는 것을 보여주었다: 한 연구에 의해 19개가 발견되었다.[7]
M. 쟈나스키에서는 많은 메탄 유발 공효소의 합성 경로,[2] 리보플라빈,[8] 새로운 아미노산 합성 경로 등 많은 새로운 신진대사 경로가 마련되어 있다.[citation needed] 고고학적 특이 DNA 중합효소 계열과 같은 이 유기체에서도 많은 정보처리 경로가 연구되어 왔다.[9] M. Jannaschi의 단일 패스 전송 단백질에 대한 정보는 Membranome 데이터베이스에 정리되었다.
참조
- ^ Carol J. Bult, Owen White, Gary J. Olsen, Lixin Zhou, Robert D. Fleischmann, Granger G. Sutton, Judith A. Blake, Lisa M. FitzGerald, Rebecca A. Clayton, Jeannine D. Gocayne, Anthony R. Kerlavage, Brian A. Dougherty, Jean-Francois Tomb, Mark D. Adams, Claudia I. Reich, Ross Overbeek, Ewen F. Kirkness, Keith G. Weinstock, Joseph M. Merrick, Anna Glodek, John L. Scott, Neil S. M. Geoghagen, Janice F. Weidman, Joyce L. Fuhrmann, Dave Nguyen, Teresa R. Utterback, Jenny M. Kelley, Jeremy D. Peterson, Paul W. Sadow, Michael C. Hanna, Matthew D. Cotton, Kevin M. Roberts, Margaret A. Hurst, Brian P. Kaine, Mark Borodovsky, Hans-Peter Klenk, Claire M. Fraser, Hamilton O. Smith, Carl R. Woese & J. Craig Venter (1996). "Complete genome sequence of the methanogenic archaeon, Methanococcus jannaschii". Science. 273 (5278): 1058–1073. Bibcode:1996Sci...273.1058B. doi:10.1126/science.273.5278.1058. PMID 8688087. S2CID 41481616.
{{cite journal}}: CS1 maint: 작성자 매개변수 사용(링크) - ^ a b Robert H. White (2001). "Biosynthesis of the methanogenic cofactors". Vitamins and Hormones. 61: 299–337. doi:10.1016/s0083-6729(01)61010-0. ISBN 9780127098616. PMID 11153270.
- ^ a b W. J. Jones, J. A. Leigh, F. Mayer, C. R. Woese & R. S. Wolfe (1983). "Methanococcus jannaschii sp. nov., an extremely thermophilic methanogen from a submarine hydrothermal vent". Archives of Microbiology. 136 (4): 254–261. doi:10.1007/BF00425213. S2CID 33277659.
{{cite journal}}: CS1 maint: 작성자 매개변수 사용(링크) - ^ a b Nicholas Wade (23 August 1996). "Deep sea yields a clue to life's origin". New York Times.
- ^ Erica J. Lyon, Seigo Shima, Gerrit Buurman, Shantanu Chowdhuri, Alfred Batschauer, Klaus Steinbach & Rudolf K. Thauer (January 2004). "UV-A/blue-light inactivation of the 'metal-free' hydrogenase (Hmd) from methanogenic archaea". European Journal of Biochemistry. 271 (1): 195–204. doi:10.1046/j.1432-1033.2003.03920.x. PMID 14686932.
{{cite journal}}: CS1 maint: 작성자 매개변수 사용(링크) - ^ Rudolf K. Thauer, Anne-Kristin Kaster, Meike Goenrich, Michael Schick, Takeshi Hiromoto & Seigo Shima (2010). "Hydrogenases from methanogenic archaea, nickel, a novel cofactor, and H2 storage". Annual Review of Biochemistry. 79: 507–536. doi:10.1146/annurev.biochem.030508.152103. PMID 20235826.
{{cite journal}}: CS1 maint: 작성자 매개변수 사용(링크) - ^ Wenhong Zhu, Claudia I. Reich, Gary J. Olsen, Carol S. Giometti & John R. Yates III (2004). "Shotgun proteomics of Methanococcus jannaschii and insights into methanogenesis". Journal of Proteome Research. 3 (3): 538–548. doi:10.1021/pr034109s. PMID 15253435.
{{cite journal}}: CS1 maint: 작성자 매개변수 사용(링크) - ^ Ilka Haase, Simone Mörtl, Peter Köhler, Adelbert Bacher & Markus Fischer (2003). "Biosynthesis of riboflavin in Archaea: 6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase of Methanococcus jannaschii". European Journal of Biochemistry. 270 (5): 1025–1032. doi:10.1046/j.1432-1033.2003.03478.x. PMID 12603336.
{{cite journal}}: CS1 maint: 작성자 매개변수 사용(링크) - ^ Yoshizumi Ishino, Kayoko Komori, Isaac K. O. Cann & Yosuke Koga (1998). "A novel DNA polymerase family found in Archaea". Journal of Bacteriology. 180 (8): 2232–2236. doi:10.1128/JB.180.8.2232-2236.1998. PMC 107154. PMID 9555910.
{{cite journal}}: CS1 maint: 작성자 매개변수 사용(링크)
추가 읽기
- Gao, Yongxiang (November 2013). "Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of MJ0458, an adenylate kinase from Methanocaldococcus jannaschii". Acta Crystallographica Section F. 69 (11): 1272–1274. doi:10.1107/S1744309113026638. PMC 3818051. PMID 24192367.
- Wang, Yu; Xu, Huimin; White, Robert H. (August 2014). "Beta-alanine biosynthesis in Methanocaldococcus jannaschii". American Society for Microbiology. 196 (15): 2869–2875. doi:10.1128/JB.01784-14. PMC 4135672. PMID 24891443.
- Allen, Kyle D.; Xu, Huimin; White, Robert H. (September 2014). "Identification of a unique radical S-adenosylmethionine methylase likely involved in methanopterin biosynthesis in Methanocaldococcus jannaschii". Journal of Bacteriology. 196 (18): 3315–3323. doi:10.1128/JB.01903-14. PMC 4135684. PMID 25002541.
- Lee, Eun Hye; Lee, Kitaik; Hwang, Kwang Yeon (13 December 2013). "Structural characterization and comparison of the large subunits of IPM isomerase and homoaconitase from Methanococcus jannaschii". Acta Crystallographica Section D. 70 (4): 922–931. doi:10.1107/S1399004713033762. PMID 24699638.
- 제프리 M. 딕, 에버렛 L. 충격: Ultramafic이 호스팅하는 잠수함 열수생태계의 단백질 합성 중 에너지 방출 In: AGU Journal of Geophysical Research: 생물지질학, 126권, 이슈11, e2021JG006436. doi:10.1029/2021JG006436. 첫 출간: 2021년 10월 30일. 참고 항목: 생명에 대한 새로운 가능성 지구 바다 밑바닥에서의 생명에 대한 새로운 가능성 – 아마도 SciTechDaily의 다른 행성에 있는 해양에서일 것이다. 2021년 11월 28일. 출처: 애리조나 주립 대학교
