메타바이러스

Metavirus
메타바이러스
바이러스 분류 e
(랭킹되지 않음): 바이러스
영역: 리보비리아
킹덤: 파라나비레아과
망울: 아르트베르비리코타
클래스: 레브트라비리케테스
순서: 오르테르비르목
패밀리: 메타비루스과
속: 메타바이러스

메타바이러스(Metavirus)는 Metavirus과에 속하는 바이러스의 속이다.[1] 그것들은 진핵 숙주 게놈을 침범하는 역트랜스포존이며 바이러스가 숙주를 감염시킨 후에야 복제될 수 있다.[2] 이러한 유전적 원소는 숙주 게놈에 감염되고 복제되기 위해 존재하며 숙주와 무관한 조상 원소에서 유래한다. 메타바이러스는 전염을 위해 여러 다른 숙주를 사용할 수 있으며, 일부 식물의 난자와 꽃가루를 통해 전염이 가능한 것으로 밝혀졌다.[3]

메타바이러스는 1개 또는 2개의 개방된 프레임을 가진 Ty3/Gypy 요소의 5개 계열을 포함한다. 이들 계열은 mdg1, mdg3, 블라스토피아, 412, 마이크로피아이다.[4] 다섯 가족 각각은 하나 또는 두 개의 열린 읽기 프레임인 개그3 및/또는 pol3를 포함하고 있다.[5] 호스트 게놈 원소의 아미노산 결핍이 Ty3 원소를 향한 프레임시프트를 자주 일으켰다는 것을 뒷받침하는 증거가 있다.[6] 메타바이러스는 오그레/타트 유전자와 일치한다.[7]

형태학

메타바이러스의 종은 단일 가닥 RNA 역트랜스포존이다. 그들은 동면체 및 선형 순응을 가지고 있으며 봉투에 싸여 있지 않다.[8] 그들의 지름은 대략 50 nm이며 보통 42 52 nm 사이이다.[8] 이 유전 원소들은 코어와 캡시드를 포함하고 있다.

종

다음과 같은 종을 인정한다.[1]

진화

이들의 높은 돌연변이와 재조합률과 수평적 유전자 전달 수행 능력 때문에, 많은 소자의 진화 이력은 추적하기 어려울 수 있다(Benachenoue et al., 2013).[9] 과학자들은 종종 핵산 염기서열을 다른 바이러스의 염기서열과 비교하기 위해 메타바이러스의 게놈을 주시하며, 선형을 구성하고 공통 조상을 제안한다.

메타바이러스의 다중 세자는 다른 메타비르과의 유전적 순서와 공통 조상 및/또는 공진화를 제안하는 유전적 순서가 있다.[10] 과학자들은 종종 메타바이러스 진화의 증거를 위해 캡시드 단백질을 관찰한다.[11] 메타바이러스의 혈통 중 많은 부분이 미해결 상태로 남아 있으며 현재 연구 중에 있다.

연구

마스카니 외 연구진(2017년)은 해바라기 종의 동질성을 찾아내고 가닥을 식별하기 위해 연구를 실시했다. 이 실험에서 다양한 헬리안투스 종에서 DNA를 추출했고, ROVERSX 분석을 통해 레트로트랜스포존스의 게놈을 확인했다. 계통생성 나무는 인접 군집화 방법을 사용하여 건설되었으며, 유전학적 분석이 가능하도록 생물정보화 파이프라인을 건설하였다. SECUR와 헬리콥터라는 두 개의 원소가 각각 확인되어 집시와 코피아 초가족에 배치되었다.[12] 따라서 SECUR 원소는 메타바이러스 속 오그레/타트 혈통의 집시 그룹에 속한다.[12] 추가 분석을 통해 마스카니 외 연구진(2017년)은 돌연변이를 파악하고 메타바이러스 혈통이 시레바이러스 이전에 진화했다는 결론을 내렸다. 마스카니 외 연구진(2017)도 SECUR 원소와 헬리콥터 원소가 혼성되어 새로운 라인의 가능성이 있다는 증거를 발견했다.

네페도바와 김씨(2009)는 메타바이러스의 선형을 더 알아보기 위해 드로필라 멜라노가스터에 대한 연구를 실시했다. 이전에 역트랜스포존의 추출한 DNA에서 동질성이 확인되었으며, 드로소필라 멜라노가스터와 계통생성 나무가 조성되었다.[13] 메타비루스는 주변 유전자를 갖고 있어 감염이 가능하며 네페도바와 김(2009)은 바쿨로비루스에서 수평 유전자가 전이돼 얻은 것으로 결론을 내렸다.[13] 메타바이러스는 에란티바이러스에서 유전자가 전이되어 얻은 것으로 생각되는 roo 원소를 함유하고 있으며, 혹은 더 가능성이 높은 두 제네랄은 공통의 조상을 공유하고 있다.[13]

참조

  1. ^ a b "ICTV Report Metaviridae".
  2. ^ Siebert, C (2006). "Unintelligent Design" (PDF). Discover.
  3. ^ Singh, R; Finnie, R (September 1973). "Seed transmission of potato spindle tuber Metavirus through the ovule of Scopolia sinensis". Canadian Plant Disease Journal. 53: 153–154.
  4. ^ Nefedova, Lidia; Kim, Alexander. "Mechanisms of LTR-Retroelement Transposition: Lessons from Drosophilia melanogaster". Viruses. 9: 1–10.
  5. ^ Levy, Camille; et al. (2013). "Virus-like particle vaccine induces cross-protection against human metapneumovirus infections in mice". Vaccine. 31 (25): 2778–2785. doi:10.1016/j.vaccine.2013.03.051. PMID 23583815.
  6. ^ Turkel, Sezai (June 2016). "Amino Acid Starvation Enhances Programmed Ribosomal Frameshift in Metavirus Ty3 of Saccharomyces cerevisiae". Advances in Biology. 2016: 1–6. doi:10.1155/2016/1840782.
  7. ^ Neumann, P; Pozarkova, D; Macas, J (2003). "Highly abundant pea LTR retrotransposon Ogre is constitutively transcribed and partially spliced". Plant Molecular Biology. 53 (3): 399–410. doi:10.1023/B:PLAN.0000006945.77043.ce. PMID 14750527.
  8. ^ a b Menees, Thomas (2018). The Springer Index of Viruses. Springer Nature. pp. 843–849.
  9. ^ Benachenhou, Farid; Sperber, Göran O.; Bongcam-Rudloff, Erik; Andersson, Göran; Boeke, Jef D.; Blomberg, Jonas (2013). "Conserved structure and inferred evolutionary history of long terminal repeats (LTRs)". Mobile DNA. 4 (1): 5. doi:10.1186/1759-8753-4-5. PMC 3601003. PMID 23369192.
  10. ^ Koonin, M; Dolja, V; Krupovic, M (2015). "Origins and evolution of viruses of eukaryotes: The ultimate modularity". Virology. doi:10.1016/j.virol.2015.02.039.
  11. ^ Gong, Z; Han, G (2018). "Insect Retroelements Provide Novel Insights into the Origin of Hepatitis B Viruses". Molecular Biology and Evolution. 35 (9): 2254–2259. doi:10.1093/molbev/msy129. PMID 29924338.
  12. ^ a b Mascagni, Farid (2017). "Different histories of two highly variable LTR retrotransposons in sunflower species" (PDF). Gene. 634: 5–14. doi:10.1016/j.gene.2017.08.014. hdl:11568/885451. PMID 28867564.
  13. ^ a b c Nefedove, L (2009). "Molecular phylogeny and systematics of drosophila retrotransposons and retroviruses". Molecular Biology. 43 (5): 747–756. doi:10.1134/S0026893309050069.

외부 링크