SARS-CoV-2 계통 B.1.617

SARS-CoV-2 lineage B.1.617

리니지 B.1.617은 COVID-19를 [1]일으키는 바이러스인 SARS-CoV-2의 계통이다.2021년 3월 말 새롭게 설립된 INSACOG가 인도의 여러 주에서 양성 샘플에 대한 유전자 염기서열 분석을 수행한 후 처음으로 국제적인 주목을 받게 되었다.Maharashtra의 샘플 분석 결과, 2020년 12월에 비해 E484Q와 L452R [2]돌연변이를 가진 샘플의 비율이 증가했다.리니지 B.1.617은 나중에 [3]뉴스에 의해 이중 돌연변이로 불리게 되었다.

PANGO 명명법에 따라 리니지 B.1.617에는 다음 3개의 서브라인이 있습니다.

돌연변이

SARS-CoV-2 '스파이크' 단백질

여기 계보 B.1.617의 스파이크 단백질에 존재하는 일반적인 돌연변이 몇 가지가 있다.B.1.617의 모든 하위 라인이 동일한 돌연변이를 공유하지는 않습니다.

  • L452R. 위치 452에서의 류신 대 아르기닌 치환으로 ACE2 수용체에 대한 스파이크 단백질의 친화력이 더욱 강해지고 면역계의 [5][6]인식능력이 저하된다.이러한 돌연변이는 개별적으로 복용할 경우 변종에만 고유한 것이 아니라 동시에 발생한다.[5][7]이 돌연변이는 B.1.617의 세 가지 하위 계통 모두에 존재한다.
  • T478K. 위치 478에서의 치환, 트레오닌 대 리신 [8]치환은 혈통 B.1.617.[9]2에서만 발견된다.
  • E484Q. 위치 484에서의 글루탐산글루타민 치환은 혈통 B.1.617을 인간 ACE2 수용체에 더 강한 결합 전위를 부여하고 다른 변종과 비교하여 숙주의 면역체계를 회피하는 더 나은 능력을 부여한다.이 돌연변이는 B.1.617.2 [10]게놈에는 존재하지 않는다.
  • D614G. 위치 614에서의 치환인 아스파르트산글리신 치환기는 B.1.1.7, B.1.351 P.[11]1같은 전염성이 높은 다른 계통과 공유된다.
  • P681R. 위치 681에서의 치환. 윌리엄 A에 따르면 프롤린 대 아르기닌 치환. 하셀틴은 "활성 S1/S2 [10]구성에 대한 S 전구 단백질의 분열을 촉진함으로써" 변종의 세포 수준 감염성을 증가시킬 수 있다.이 돌연변이는 B.1.617의 세 가지 하위 계통 모두에 존재한다.

역사

[12]소식통에 따르면 첫 번째 B.1.617 게놈 배열은 2020년 가을 GISAID에 제출되었다.SARS-CoV-2의 계통수를 수동으로 치료하고 있는 PANGO의 팀은 가장 이른 서열이 2020년 12월 7일부터라고 언급했다.그들은 G142D, L452R, E484Q, D614G, P681R 등 스파이크 단백질의 돌연변이를 포함하는 변종에 대한 새로운 명칭을 제안하였고,[13] 이 변종은 2021년 4월 1일 PANGO 계보 B.1.617로 지정되었다.그들은 2021년 4월 21일 PANGOLIN 도구에 의해 할당된 모든 게놈 배열이 동일한 일련의 [14]돌연변이를 포함하지 않는다는 것을 발견하고 계통수를 수정하여 B.1.617의 세 개의 하위 계열을 포함시켰다.

2021년 4월 중순까지 인도가 가장 많은 B.1.617 게놈을 제출했고 영국과 미국이 그 뒤를 이었다.게놈 정보에 근거해, 영국에서는 2021년 2월 22일에, 미국에서는 2021년 [12]2월 23일에 혈통 B.1.617이 최초로 검출되었다.

영국 공중위생국은 2021년 4월 중순 영국에서 77건의 혈통 B.1.617이 검출된 뒤 [15]이 혈통을 조사 대상 변종으로 지정했다.두 달도 안 되어, 델타 변종은 영국에서 우세한 변종이 될 것이고, 연구자들은 초기 증거가 이전에 우세한 알파 [16]변종에 비해 델타에 대한 입원 위험이 증가할 수 있다고 말했다.

레퍼런스

  1. ^ "Lineage B.1.617". PANGO lineages. Retrieved 12 June 2021.
  2. ^ "Genome Sequencing by INSACOG shows variants of concern and a Novel variant in India". Press Information Bureau Government of India. 24 March 2021.
  3. ^ "Covid-19: Double mutation variant fuels fears". The Telegraph online. 17 March 2021.
  4. ^ "Lineage B.1.617.3". cov-lineages.org. Retrieved 10 July 2021.{{cite web}}: CS1 maint :url-status (링크)
  5. ^ a b Starr, Tyler N.; Greaney, Allison J.; Dingens, Adam S.; Bloom, Jesse D. (April 2021). "Complete map of SARS-CoV-2 RBD mutations that escape the monoclonal antibody LY-CoV555 and its cocktail with LY-CoV016". Cell Reports Medicine. 2 (4): 100255. doi:10.1016/j.xcrm.2021.100255. ISSN 2666-3791. PMC 8020059. PMID 33842902.
  6. ^ Zhang, Wenjuan; Davis, Brian D.; Chen, Stephanie S.; Sincuir Martinez, Jorge M.; Plummer, Jasmine T.; Vail, Eric (6 April 2021). "Emergence of a Novel SARS-CoV-2 Variant in Southern California". JAMA. 325 (13): 1324–1326. doi:10.1001/jama.2021.1612. PMC 7879386. PMID 33571356.
  7. ^ Koshy, Jacob (8 April 2021). "Coronavirus Indian 'double mutant' strain named B.1.617". The Hindu. Retrieved 19 April 2021. Though these mutations have individually been found in several other coronavirus variants, the presence of both these mutations together have been first found in some coronavirus genomes from India.
  8. ^ Greenwood, Michael (30 March 2021). "SARS-CoV-2 mutation T478K spreading at alarming speed in Mexico". Medical News. Retrieved 6 September 2021. The T478K mutation constitutes the exchange of the non-charged amino acid threonine with the positively charged lysine at position 478...
  9. ^ Delphine Planas (8 July 2021). "Reduced sensitivity of SARS-CoV-2 variant Delta to antibody neutralization". Nature. 596 (7871): 276–280. Bibcode:2021Natur.596..276P. doi:10.1038/s41586-021-03777-9. PMID 34237773. S2CID 235775860. The T478K mutation in the RBD is unique to the Delta variant...
  10. ^ a b Haseltine, William. "An Indian SARS-CoV-2 Variant Lands In California. More Danger Ahead?". Forbes. Retrieved 20 April 2021.
  11. ^ "SARS-CoV-2 variants of concern as of 3 June 2021". European Centre for Disease Prevention and Control. Archived from the original on 3 June 2021.
  12. ^ a b "Expert reaction to cases of variant B.1.617 (the 'Indian variant') being investigated in the UK". Science Media Centre. Retrieved 20 April 2021.
  13. ^ "Proposed new B.1 sublineage circulating in India #38". GitHub. Retrieved 2 April 2021.
  14. ^ "Potential sequences that should be included in B.1.617 #49". GitHub. Retrieved 28 February 2021.
  15. ^ "Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK". www.gov.uk. 15 April 2021. Archived from the original on 16 April 2021. This article contains OGL licensed text 이 문서에는 British Open Government License v3.0에 따라 발행된 텍스트가 포함되어 있습니다.
  16. ^ "Confirmed cases of COVID-19 variants identified in UK". www.gov.uk. 3 June 2021. Archived from the original on 4 June 2021. This article contains OGL licensed text 이 문서에는 British Open Government License v3.0에 따라 발행된 텍스트가 포함되어 있습니다.