KiSAO
KiSAO | |
| 내용 | |
|---|---|
| 묘사 | 시뮬레이션 실험을 설명할 때 시뮬레이션 알고리즘을 명확하게 참조할 수 있도록 지원하는 온톨로지. |
| 데이터형 발동. | 시뮬레이션 알고리즘, 그 특성 및 파라미터 |
| 연락 | |
| 연구소 | EMBL-EBI |
| 주요 인용문 | PMID 22027554 |
| 접근 | |
| 표준 | 미리암 |
| data 형식 | 올빼미 |
| 웹 사이트 | KiSAO 홈페이지, KiSAO at BioPortal |
| 다운로드 URL | KiSAO 홈페이지 |
| 도구들 | |
| 스탠드아론 | libKiSAO, KiSAO를 쿼리하기 위한 자바 라이브러리 |
| 여러가지 종류의 | |
| 면허증. | 아티스틱 라이선스 |
| 버전 | 2.3.5 (2014년 4월) |
| 큐레이션 정책 | ○(수동) |
| 북마크 가능 엔티티 | 네. |
KiSAO(Kinetic Simulation Algorithm Ontology)는 시스템 생물학 모델의 시뮬레이션, 특성화 및 상호 관계에 사용할 수 있는 기존 알고리즘에 대한 정보를 제공합니다.KiSAO는 BioModels.net 프로젝트와 COMBINE [1]이니셔티브의 일부입니다.
구조.
KiSAO는 3개의 주요 브랜치로 구성되어 있습니다.
- 시뮬레이션 알고리즘
- 시뮬레이션 알고리즘 특성
- 시뮬레이션 알고리즘 파라미터
각 알고리즘 브랜치의 요소는 특성에 링크되며 사용하는 파라미터 브랜치는 특성을 가지며 그에 따라 파라미터 관계가 있습니다.알고리즘 브랜치 자체는 하위 알고리즘이 보다 일반적인 상위 알고리즘에서 파생되었거나 특정되었음을 나타내는 관계를 사용하여 계층적으로 구조화됩니다.
「 」를 참조해 주세요.
레퍼런스
- ^ Courtot, M.; Juty, N.; Knupfer, C.; Waltemath, D.; Zhukova, A.; Drager, A.; Dumontier, M.; Finney, A.; Golebiewski, M.; Hastings, J.; Hoops, S.; Keating, S.; Kell, D. B.; Kerrien, S.; Lawson, J.; Lister, A.; Lu, J.; Machne, R.; Mendes, P.; Pocock, M.; Rodriguez, N.; Villeger, A.; Wilkinson, D. J.; Wimalaratne, S.; Laibe, C.; Hucka, M.; Le Novere, N. (2014). "Controlled vocabularies and semantics in systems biology". Molecular Systems Biology. 7: 543. doi:10.1038/msb.2011.77. PMC 3261705. PMID 22027554.
