디히드로리포아미드탈수소효소

Dihydrolipoamide dehydrogenase
DLD
PDB 1zy8 EBI.png
사용 가능한 구조
PDBOrtholog 검색: PDBe RCSB
식별자
에일리어스DLD, DLDD, DLDH, E3, GCSL, LAD, PHE3, 디히드로리포아미드탈수소효소, 디히드로리포아미드탈수소효소, OGDC-E3
외부 IDOMIM: 238331 MGI: 107450 HomoloGene: 84 GeneCard: DLD
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유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_001289752
NM_000108
NM_001289750
NM_001289751

NM_007861

RefSeq(단백질)

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NP_001276680
NP_001276681

NP_031887

장소(UCSC)Chr 7: 107.89 ~107.93 MbChr 12: 31.38 ~31.4 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

디히드로리포일 탈수소효소, 미토콘드리아라고도 알려진 디히드로리포아미드 탈수소효소는 DLD [5][6][7][8]유전자에 의해 인간에게 암호화되는 효소이다.DLD는 디히드로리포아미드리포아미드로 산화시키는 플라보단백질 효소이다.

디히드로리포아미드탈수소효소(DLD)는 진핵생물에서 에너지 대사에 중요한 역할을 하는 미토콘드리아 효소이다.이 효소는 적어도 5가지 다른 다효소 [9]복합체의 완전한 반응에 필요합니다.또한 DLD는 반응성 디술피드 브릿지와 촉매 작용에 직접 관여하는 FAD 보조 인자를 포함하는 플라보엔자임 산화환원효소이다.효소는 효소 활성에 [10]필요한 단단하게 결합된 호모디머와 결합합니다.

구조.

DLD 유전자에 의해 암호화된 단백질은 다른 단백질과 함께 중앙 대사 경로에서 이합체를 형성합니다.촉매 포켓 내의 여러 아미노산은 [11][12]R281 및 N473을 포함하여 DLD 기능에 중요한 으로 확인되었습니다.인간 효소의 전체적인 접힘은 효모와 유사하지만, 인간 구조는 촉매 작용에 필요한 NAD+ 분자가 결합되었을 때 일반적인 단백질 구조에서 FAD 결합 부위로 확장되는 두 개의 루프를 가지고 있다는 점에서 다르다.그러나 NADH가 대신 결합되면 FAD 중심 구조의 상단에 직접 쌓인다.현재의 hE3 구조는 질병을 유발하는 돌연변이가 인간 효소의 세 곳에서 발생한다는 것을 직접적으로 보여준다: 이합체 인터페이스, 활성 부위, 그리고 FAD와 NAD(+) 결합 부위.[13]

기능.

DLD 호모디머는 미토콘드리아 매트릭스에서 피루브산, α-케토글루타르산, 분기사슬 아미노산 탈수소효소 복합체와 글리신 분해 시스템의 E3 성분으로 기능한다.이들 복합체에서 DLD는 디히드로리포산과 NAD+를 지방산으로 변환하고 NADH도 [14]디아포라아제 활성을 가지며, DLD는 O, 유연철, 산화질소, 유비퀴논 [9]등의 다른2 전자수용체를 사용하여 NADH에서 NAD+로 산화를 촉매할 수 있다.DLD는 산소를 초산화물로 환원하거나 철에서 철로 환원하여 수산기 [15][16]생성을 촉진함으로써 산화 방지 역할을 하는 것으로 생각됩니다.DLD의 디아포라아제 활성은 산화질소를 소거하고 유비퀴논을 유비퀴놀로 [17][18][19]환원하는 능력을 통해 항산화 역할을 할 수 있다.디히롤리파미드탈수소효소 유전자는 여러 스플라이스 변형을 가진 것으로 알려져 있다.

달빛 기능

특정 DLD 돌연변이는 1차 대사 활성의 상실과 달빛 단백질 분해 활성의 증가를 동시에 유도할 수 있다.DLD의 달빛 단백질 분해 활성은 DLD 호모디머를 불안정하게 하고 DLD [9]활성을 감소시키는 조건으로 나타납니다.미토콘드리아 기질의 산성화는 허혈-재류 손상의 결과로 탈수소효소 활성 감소와 디아포라아제 [20]활성 증가를 초래하는 DLD의 4차 구조를 교란시킬 수 있다.DLD의 달빛 단백질 분해 활성은 또한 병리학적 조건 하에서 발생할 수 있다.단백질 분해 활성은 [19]DLD 활성 감소 및 디아포라아제 활성 증가로 인한 에너지 대사 감소 및 산화 손상 증가를 더욱 복잡하게 할 수 있다.단백질 분해 기능을 통해 DLD는 철분 대사 및 항산화 [21][22]보호에 관여하는 미토콘드리아 단백질인 프라탁신의 N 말단에서 기능적으로 중요한 도메인을 제거합니다.

임상적 의의

인간에서 DLD의 돌연변이는 성장 실패, 저혈압, 대사 산증 등과 같은 유아기 중증 질환과 관련이 있다.[23] DLD 결핍은 단백질의 안정성에 대한 다른 DLD 돌연변이의 다양한 영향과 3가지 α-케토산 탈수소효소 [23]복합체의 다른 성분과의 이량화 또는 상호작용 능력에 기인한다.DLD는 단백질 분해 기능을 통해 프라탁신 결핍을 일으켜 신경변성 및 심장질환인 프리드라이히의 운동실조증[24]일으킨다.

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  1. ^ 대화형 경로 맵은 WikiPathways에서 편집할 수 있습니다."TCACycle_WP78".
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alt=용해 및 포도당생성 편집]
당분해 및 글루코네제네시스 편집
  1. ^ 대화형 경로 맵은 WikiPathways에서 편집할 수 있습니다.

효소조절

이 단백질은 알로스테릭 [25]조절모르핀 모델을 사용할 수 있다.

「 」를 참조해 주세요.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG000091140 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000020664 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: dihydrolipoamide dehydrogenase".
  6. ^ Otulakowski G, Robinson BH (December 1987). "Isolation and sequence determination of cDNA clones for porcine and human lipoamide dehydrogenase. Homology to other disulfide oxidoreductases". The Journal of Biological Chemistry. 262 (36): 17313–8. doi:10.1016/S0021-9258(18)45379-3. PMID 3693355.
  7. ^ Pons G, Raefsky-Estrin C, Carothers DJ, Pepin RA, Javed AA, Jesse BW, et al. (March 1988). "Cloning and cDNA sequence of the dihydrolipoamide dehydrogenase component human alpha-ketoacid dehydrogenase complexes". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 85 (5): 1422–6. Bibcode:1988PNAS...85.1422P. doi:10.1073/pnas.85.5.1422. PMC 279783. PMID 3278312.
  8. ^ Scherer SW, Otulakowski G, Robinson BH, Tsui LC (1991). "Localization of the human dihydrolipoamide dehydrogenase gene (DLD) to 7q31----q32". Cytogenetics and Cell Genetics. 56 (3–4): 176–7. doi:10.1159/000133081. hdl:10722/42531. PMID 2055113.
  9. ^ a b c Babady NE, Pang YP, Elpeleg O, Isaya G (April 2007). "Cryptic proteolytic activity of dihydrolipoamide dehydrogenase". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 104 (15): 6158–63. Bibcode:2007PNAS..104.6158B. doi:10.1073/pnas.0610618104. PMC 1851069. PMID 17404228.
  10. ^ Ciszak EM, Makal A, Hong YS, Vettaikkorumakankauv AK, Korotchkina LG, Patel MS (January 2006). "How dihydrolipoamide dehydrogenase-binding protein binds dihydrolipoamide dehydrogenase in the human pyruvate dehydrogenase complex". The Journal of Biological Chemistry. 281 (1): 648–55. doi:10.1074/jbc.M507850200. PMID 16263718.
  11. ^ Kim H (March 2005). "Asparagine-473 residue is important to the efficient function of human dihydrolipoamide dehydrogenase". Journal of Biochemistry and Molecular Biology. 38 (2): 248–52. doi:10.5483/bmbrep.2005.38.2.248. PMID 15826505.
  12. ^ Wang YC, Wang ST, Li C, Chen LY, Liu WH, Chen PR, et al. (January 2008). "The role of amino acids T148 and R281 in human dihydrolipoamide dehydrogenase". Journal of Biomedical Science. 15 (1): 37–46. doi:10.1007/s11373-007-9208-9. PMID 17960497.
  13. ^ Brautigam CA, Chuang JL, Tomchick DR, Machius M, Chuang DT (July 2005). "Crystal structure of human dihydrolipoamide dehydrogenase: NAD+/NADH binding and the structural basis of disease-causing mutations". Journal of Molecular Biology. 350 (3): 543–52. doi:10.1016/j.jmb.2005.05.014. PMID 15946682.
  14. ^ Carothers DJ, Pons G, Patel MS (February 1989). "Dihydrolipoamide dehydrogenase: functional similarities and divergent evolution of the pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductases". Archives of Biochemistry and Biophysics. 268 (2): 409–25. doi:10.1016/0003-9861(89)90309-3. PMID 2643922.
  15. ^ Petrat F, Paluch S, Dogruöz E, Dörfler P, Kirsch M, Korth HG, et al. (November 2003). "Reduction of Fe(III) ions complexed to physiological ligands by lipoyl dehydrogenase and other flavoenzymes in vitro: implications for an enzymatic reduction of Fe(III) ions of the labile iron pool". The Journal of Biological Chemistry. 278 (47): 46403–13. doi:10.1074/jbc.M305291200. PMID 12963736.
  16. ^ Yoneyama K, Shibata R, Igarashi A, Kojima S, Kodani Y, Nagata K, et al. (September 2014). "Proteomic identification of dihydrolipoamide dehydrogenase as a target of autoantibodies in patients with endometrial cancer". Anticancer Research. 34 (9): 5021–7. PMID 25202086.
  17. ^ Igamberdiev AU, Bykova NV, Ens W, Hill RD (June 2004). "Dihydrolipoamide dehydrogenase from porcine heart catalyzes NADH-dependent scavenging of nitric oxide". FEBS Letters. 568 (1–3): 146–50. doi:10.1016/j.febslet.2004.05.024. PMID 15196936. S2CID 20180110.
  18. ^ Olsson JM, Xia L, Eriksson LC, Björnstedt M (April 1999). "Ubiquinone is reduced by lipoamide dehydrogenase and this reaction is potently stimulated by zinc". FEBS Letters. 448 (1): 190–2. doi:10.1016/s0014-5793(99)00363-4. PMID 10217438. S2CID 34370150.
  19. ^ a b Xia L, Björnstedt M, Nordman T, Eriksson LC, Olsson JM (March 2001). "Reduction of ubiquinone by lipoamide dehydrogenase. An antioxidant regenerating pathway". European Journal of Biochemistry. 268 (5): 1486–90. doi:10.1046/j.1432-1327.2001.02013.x. PMID 11231302.
  20. ^ Klyachko NL, Shchedrina VA, Efimov AV, Kazakov SV, Gazaryan IG, Kristal BS, Brown AM (April 2005). "pH-dependent substrate preference of pig heart lipoamide dehydrogenase varies with oligomeric state: response to mitochondrial matrix acidification". The Journal of Biological Chemistry. 280 (16): 16106–14. doi:10.1074/jbc.M414285200. PMID 15710613.
  21. ^ Al-Karadaghi S, Franco R, Hansson M, Shelnutt JA, Isaya G, Ferreira GC (March 2006). "Chelatases: distort to select?". Trends in Biochemical Sciences. 31 (3): 135–42. doi:10.1016/j.tibs.2006.01.001. PMC 2997100. PMID 16469498.
  22. ^ O'Neill HA, Gakh O, Park S, Cui J, Mooney SM, Sampson M, et al. (January 2005). "Assembly of human frataxin is a mechanism for detoxifying redox-active iron". Biochemistry. 44 (2): 537–45. doi:10.1021/bi048459j. PMID 15641778.
  23. ^ a b Quinonez SC, Thoene JG (9 July 2020). "Dihydrolipoamide Dehydrogenase Deficiency". In Adam MP, Ardinger HH, Pagon RA, Wallace SE, Bean LJ, Mirzaa G, Amemiya A (eds.). GeneReviews. University of Washington, Seattle. PMID 25032271.
  24. ^ Ambrus A, Adam-Vizi V (July 2018). "Human dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) deficiency: Novel insights into the structural basis and molecular pathomechanism" (PDF). Neurochemistry International. 117: 5–14. doi:10.1016/j.neuint.2017.05.018. PMID 28579060. S2CID 38777180.
  25. ^ Selwood T, Jaffe EK (March 2012). "Dynamic dissociating homo-oligomers and the control of protein function". Archives of Biochemistry and Biophysics. 519 (2): 131–43. doi:10.1016/j.abb.2011.11.020. PMC 3298769. PMID 22182754.

추가 정보

외부 링크

이 기사에는 미국 국립 의학 도서관(미국 국립 의학 도서관)의 공공 도메인 텍스트가 포함되어 있습니다.