C 종단

C-terminus
녹색으로 강조 표시된 N말단α-아미노산(예: L-발린)과 청색으로 표시된 C말단α-아미노산(예: L-알라닌)을 가진 테트라펩타이드(예: Val-Gly-Ser-Ala).

C 말단(카복실 말단, 카르복시 말단, C 말단, C 말단 또는 COOH 말단이라고도 함)은 활성 카르복실기(-COOH)에 의해 종단되는 아미노산 사슬(단백질 또는 폴리펩타이드)의 말단이다.단백질이 메신저 RNA에서 번역될 때, 그것은 N 말단에서 C 말단으로 만들어집니다.펩타이드 배열을 작성하는 관례는 C 말단 끝을 오른쪽에 두고 N 말단에서 C 말단까지의 배열을 작성하는 것이다.

화학

각 아미노산은 카르복실기와 아민기를 가진다.아미노산은 하나의 아미노산의 아민기를 다음 아미노산의 카르복실기에 결합하는 탈수 반응에 의해 서로 결합하여 사슬을 형성한다.따라서 폴리펩타이드 사슬은 결합되지 않은 카르복실기 C-말단과 결합되지 않은 아민기 N-말단을 가진다.단백질은 N 말단에서 시작하여 C 말단에서 자연스럽게 합성된다.

기능.

C 단자 유지 신호

단백질의 N 말단은 종종 표적 신호를 포함하는 반면, C 말단은 단백질 분류를 위한 유지 신호를 포함할 수 있다.가장 일반적인 ER 보유 신호는 C 말단에서 아미노산 배열 -KDEL(Lys-Asp-Glu-Leu) 또는 -HDEL(His-Asp-Glu-Leu)이다.이것은 단백질이 소포체 안에 머무르게 하고 분비 경로로 들어가는 것을 막는다.

C단말기

단백질의 C 말단은 번역 후 수정될 수 있으며, 가장 일반적으로 단백질이 막 통과 도메인을 가지지 않고 막에 삽입될 수 있도록 하는 C 말단에 지질 앵커를 추가함으로써 수정될 수 있다.

프리닐화

주요 기사: 프리닐화

C 말단 수식의 한 가지 형태는 프리닐화이다.프레닐화 중에 C 말단 부근의 시스테인 잔기에 파르네실 또는 게라닐게라닐-이소프레노이드막 앵커를 첨가한다.작은 막 결합 G단백질은 종종 이런 방식으로 변형된다.

GPI 앵커

주요 기사:글리코실포스파티딜이노시톨

C 말단 수식의 또 다른 형태는 막 앵커로서 포스포글리칸인 글리코실포스파티딜이노시톨(GPI)을 첨가하는 것이다.GPI 앵커는 C 말단 프로펩타이드의 단백질 분해 분해 후 C 말단에 부착됩니다.이러한 유형의 변형에 대한 가장 두드러진 예는 프리온 단백질이다.

C 터미널 도메인

RNA POL II 작동 중

일부 단백질의 C 말단 도메인은 특수 기능을 가지고 있다.사람의 경우 RNA 중합효소 II의 CTD는 일반적으로 Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser 배열의 최대 [1]52회 반복으로 구성됩니다.이것은 다른 단백질이 중합효소 활성을 활성화하기 위해 RNA 중합효소의 C 말단 도메인에 결합할 수 있게 한다.이러한 도메인은 DNA 전사의 시작, RNA 전사의 캡핑 및 RNA 스플라이싱을 [2]위한 스플라이세오솜에 대한 부착에 관여한다.

「 」를 참조해 주세요.

  • N 종단
  • TopFIND는 단백질 분해효소, 분해 부위 특이성, 기질, 억제제 및 활성에서 유래한 단백질 말단을 다루는 과학적 데이터베이스입니다.

레퍼런스

  1. ^ Meinhart A, Cramer P (July 2004). "Recognition of RNA polymerase II carboxy-terminal domain by 3'-RNA-processing factors". Nature. 430 (6996): 223–6. Bibcode:2004Natur.430..223M. doi:10.1038/nature02679. hdl:11858/00-001M-0000-0015-8512-8. PMID 15241417. S2CID 4418258.
  2. ^ Brickey WJ, Greenleaf AL (June 1995). "Functional studies of the carboxy-terminal repeat domain of Drosophila RNA polymerase II in vivo". Genetics. 140 (2): 599–613. PMC 1206638. PMID 7498740.