BPTF

BPTF
사용 가능한 구조
PDB	휴먼 유니프로트 검색: PDBe RCSB
PDB ID 코드 목록
	2F6J, 2F6N, 2FSA, 2FUI, 2FU, 2RI7, 3QZS, 3QZT, 3QZV, 3UV2
식별자
에일리어스	BPTF, FAC1, FALZ, NURF301, 브로모도메인 PHD 전사인자, NEDDFL
외부 ID	OMIM : 601819 MGI : 2444008 HomoloGene : 114397 Genecard : BPTF
유전자 위치(인간)
크르.	17번 염색체(인간)
끝.	67,984,378 bp
유전자 위치(마우스)
크르.	11번 염색체(쥐)
끝.	107,022,953 bp
RNA발현패턴
	상단 표시 위치:
	상부 신경; ; 신경절 융기; ; 뇌량; ; 소뇌 반구; ; 흉선; ; 결석골; ; 아킬레스건; ; 신장수질; ; 뇌하수체; ; 폐하엽;
	상단 표시 위치:
	작은 구멍; ; 광학 플래코드; ; 내경동맥; ; 흑색 실체; ; 외경동맥; ; 혈관 형성; ; 수채관; ; 림프절; ; 이차 난모세포; ; 섬모체;
	추가 참조 표현식 데이터
	; ;
	추가 참조 표현식 데이터
유전자 존재론
분자 함수	배열특이적 DNA결합; DNA에 작용하는 ATP 의존성 활성; 전사 인자 결합; 금속 이온 결합; 단백질 결합; 메틸화히스톤결합;
셀룰러 컴포넌트	세포질; 세포체; 핵소체; 수상돌기; NURF 복합체; 세포질핵주위영역; 뉴런 투영; 세포외 엑소좀; 핵; Set1C/CASS 복합체;
생물학적 과정	염색질 리모델링; 신경증식인자 자극에 대한 세포반응; 내배엽 발달; 전사조절, DNA템플릿화; 태반 발달; RNA중합효소II에 의한 전사 음성 조절; 전사, DNA 템플릿; 전사의 양성 조절, DNA 템플릿화; 뇌의 발달; 상처에 대한 반응; 전방/전방 패턴 사양; 크로마틴 조직; RNA중합효소II에 의한 전사조절; RNA중합효소II에 의한 전사의 양성 조절;
	출처:아미고 / QuickGO
맞춤법
	2186
	207165
	ENSG00000171634
	ENSMUSG000040481
	Q12830
	없음
	NM_004459; NM_182641
	NM_001080832; NM_176850; NM_001359590
	NP_004450; NP_872579
	없음
	위키데이터
인간 보기/편집	마우스 표시/편집

뉴클레오좀 리모델링인자 서브유닛 BPTF는 BPTF ^[5]^[6]^[7]^[8]유전자에 의해 인간에서 코드되는 단백질이다.

이 유전자는 알츠하이머병 환자의 뇌 균질화 물질에 대해 준비된 모노클로널 항체에 대한 암호화된 단백질의 반응성으로 확인되었다.DNA 결합 도메인과 아연 핑거 모티브를 포함하는 810 aa 단백질로 식별된 원래 단백질(태아 Alz-50 반응성 클론 1, 또는 FAC1)의 분석은 그것이 전사 조절에 역할을 할 수 있음을 시사했다.태아의 뇌와 신경변성 질환 환자에서 높은 수준의 FAC1이 검출되었다.이 유전자에 의해 암호화된 단백질은 실제로 원래 생각했던 것보다 훨씬 크고, 또한 증식 중에 전사를 조절하는 단백질의 특징인 C 말단 브로모도메인을 포함하고 있다.암호화된 단백질은 드로소필라 NURF(핵소체 리모델링 인자) 복합체의 가장 큰 서브유닛과 매우 유사하다.Drosophila에서는 전사에 필요한 크로마틴 리모델링을 위해 DNA에서 뉴클레오솜 슬라이딩을 촉매하고 배열 특이 전사 인자와 상호작용하는 NURF 복합체가 필요하다.서로 다른 Isoform을 인코딩하는 두 개의 대체 스크립트가 완전히 ^[8]설명되었습니다.

상호 작용

BPTF는 ^[9]MAZ와 상호작용하는 것으로 나타났습니다.

레퍼런스

^ ^a ^b ^c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000171634 - 앙상블, 2017년 5월
^ ^a ^b ^c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000040481 - 앙상블, 2017년 5월
^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
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^ Wysocka J, Swigut T, Xiao H, Milne TA, Kwon SY, Landry J, Kauer M, Tackett AJ, Chait BT, Badenhorst P, Wu C, Allis CD (July 2006). "A PHD finger of NURF couples histone H3 lysine 4 trimethylation with chromatin remodelling". Nature. 442 (7098): 86–90. Bibcode:2006Natur.442...86W. doi:10.1038/nature04815. PMID 16728976. S2CID 4389087.
^ ^a ^b "Entrez Gene: BPTF bromodomain PHD finger transcription factor".
^ Jordan-Sciutto, K L; Dragich J M; Caltagarone J; Hall D J; Bowser R (March 2000). "Fetal Alz-50 clone 1 (FAC1) protein interacts with the Myc-associated zinc finger protein (ZF87/MAZ) and alters its transcriptional activity". Biochemistry. UNITED STATES. 39 (12): 3206–15. doi:10.1021/bi992211q. ISSN 0006-2960. PMC 3667205. PMID 10727212.

외부 링크

UCSC Genome Browser의 인간 BPTF 게놈 위치 및 BPTF 유전자 세부 정보 페이지.

추가 정보

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Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10.1101/gr.6.9.791. PMID 8889548.
Zhu P, Bowser R (1997). "Identification and analysis of the complete cDNA sequence for the human FAC1 gene". Biochim. Biophys. Acta. 1309 (1–2): 5–8. doi:10.1016/s0167-4781(96)00127-3. PMID 8950167.
Mu X, Springer JE, Bowser R (1997). "FAC1 expression and localization in motor neurons of developing, adult, and amyotrophic lateral sclerosis spinal cord". Exp. Neurol. 146 (1): 17–24. doi:10.1006/exnr.1997.6508. PMID 9225734. S2CID 25924273.
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Jordan-Sciutto KL, Dragich JM, Rhodes JL, Bowser R (2000). "Fetal Alz-50 clone 1, a novel zinc finger protein, binds a specific DNA sequence and acts as a transcriptional regulator". J. Biol. Chem. 274 (49): 35262–8. doi:10.1074/jbc.274.49.35262. PMC 3670955. PMID 10575013.
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Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
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Li H, Ilin S, Wang W, et al. (2006). "Molecular basis for site-specific read-out of histone H3K4me3 by the BPTF PHD finger of NURF". Nature. 442 (7098): 91–5. Bibcode:2006Natur.442...91L. doi:10.1038/nature04802. PMC 4690523. PMID 16728978.

인간 염색체 17번 유전자에 대한 이 기사는 짧은 글이다.위키피디아를 확장함으로써 위키피디아를 도울 수 있습니다.

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000171634 - 앙상블, 2017년 5월

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000040481 - 앙상블, 2017년 5월

[3] "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[4] "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.

[pmid8975731-5] Bowser R (March 1997). "Assignment of the human FAC1 gene to chromosome 17q24 by fluorescence in situ hybridization". Genomics. 38 (3): 455–7. doi:10.1006/geno.1996.0657. PMID 8975731.

[pmid10662542-6] Jones MH, Hamana N, Shimane M (April 2000). "Identification and characterization of BPTF, a novel bromodomain transcription factor". Genomics. 63 (1): 35–9. doi:10.1006/geno.1999.6070. PMID 10662542.

[pmid16728976-7] Wysocka J, Swigut T, Xiao H, Milne TA, Kwon SY, Landry J, Kauer M, Tackett AJ, Chait BT, Badenhorst P, Wu C, Allis CD (July 2006). "A PHD finger of NURF couples histone H3 lysine 4 trimethylation with chromatin remodelling". Nature. 442 (7098): 86–90. Bibcode:2006Natur.442...86W. doi:10.1038/nature04815. PMID 16728976. S2CID 4389087.

[entrez-8] "Entrez Gene: BPTF bromodomain PHD finger transcription factor".

[pmid10727212-9] Jordan-Sciutto, K L; Dragich J M; Caltagarone J; Hall D J; Bowser R (March 2000). "Fetal Alz-50 clone 1 (FAC1) protein interacts with the Myc-associated zinc finger protein (ZF87/MAZ) and alters its transcriptional activity". Biochemistry. UNITED STATES. 39 (12): 3206–15. doi:10.1021/bi992211q. ISSN 0006-2960. PMC 3667205. PMID 10727212.

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