동작하지 않다

BLCAP
동작하지 않다
식별자
에일리어스BLCAP, BC10, 방광암 관련 단백질, 아포토시스 유도인자, BLCAP 아포토시스 유도인자
외부 IDOMIM : 613110 MGI : 1858907 HomoloGene : 38217 GenCard : BLCAP
맞춤법
종.인간마우스
엔트레즈
앙상블
유니프로트
RefSeq(mRNA)

NM_016916
NM_001355426

RefSeq(단백질)

NP_058612
NP_001342355

장소(UCSC)Chr 20: 37.49 ~37.53 MbChr 2: 157.4 ~157.41 Mb
PubMed 검색[3][4]
위키데이터
인간 보기/편집마우스 표시/편집

방광암 관련 단백질인간BLCAP [5][6]유전자에 의해 암호화되는 단백질이다.

기능.

BLCAP은 비침습성 및 침습성 방광 전이 세포암에서 얻은 종양 생체 검사의 차등 표시 절차를 사용하여 식별되었다.데이터베이스 검색 결과 식별 당시 인간 유전자에 대한 상동성이 발견되지 않았지만 쥐, 쥐, 제브라피쉬의 철자법은 그 이후로 확인되었다.그 단백질은 방광암[6]진행되는 동안 하향 조절된 것으로 보인다.

BC10으로 알려진 단백질은 87-아미노산 길이의 단백질이지만 생물학적 기능은 거의 알려지지 않았다.그러나 단백질은 아포토시스 [7]개시를 통해 세포 성장을 감소시킴으로써 종양 억제에 관여한다고 널리 알려져 있다.그것은 널리 발현되는 단백질이지만 특히 뇌와 B 림프구에서 [8]발현이 높다.대체 촉진제 및 대체 스플라이싱을 통해 단백질은 여러 가지 다른 전사 변종으로 존재할 수 있습니다.이 단백질의 사전 mRNA는 여러 RNA 편집 이벤트의 영향을 [9]받기 때문에 이 수치는 더욱 증가합니다.

구조.

단백질의 구조는 2개의 막간([10]TM) 도메인을 가진 구상 단백질로 예측된다.

RNA편집

인간의 BLCAP 유전자는 인트론에 의해 분리된 두 의 엑손으로 구성되어 있다.이 유전자의 엑손1은 5μUTR의 5μ배열을 부호화하며 엑손2는 5μUTR의 나머지 배열, 부호화 영역 및 3μUTR을 포함한다.따라서 BLCAP 유전자의 코드 배열은 [9]인트론리스이다.

유형

A to I RNA 편집은 사전 mRNA의 이중사슬 영역 내에서 아데노신을 특이적으로 인식하고 이노신으로 탈아미노신화하는 RNA(ADAR)에 작용하는 아데노신 탈아미나아제 패밀리에 의해 촉매된다.이노신은 세포 번역기계에 의해 구아노신으로 인식된다.ADAR 패밀리 1-3에는 3개의 멤버가 있으며, ADAR 1과 ADAR 2만이 효소 활성 멤버이다.ADAR3는 뇌에서 조절 역할을 하는 것으로 생각된다.ADAR1과 ADAR2는 조직 내에서 광범위하게 발현되는 반면 ADAR3은 뇌로 제한된다.RNA의 이중 가닥 영역은 일반적으로 인접 인트론에서 잔류물과 함께 편집 부위의 가까운 영역의 잔류물 간에 염기쌍을 형성하지만 엑소닉 배열일 수 있다.편집 영역과 쌍을 이루는 영역을 편집 보완 시퀀스(ECS)라고 합니다.

위치

편집 부위는 모두 인트론 1의 마지막 150개의 뉴클레오티드와 엑손 2의 시작 사이에 집중되어 있다.이 단백질의 사전 mRNA에는 총 17개의 확인된 편집 부위가 있습니다.이 중 11개는 인트로닉 시퀀스(1~11개) 내에서 발견되며, 3개는 5'에서 발견됩니다.UTR 영역(5a, 5b, 5c)은 부호화 시퀀스(Y/C 사이트, Q/R 사이트, K/R 사이트) 내에서 3개가 발견됩니다.이러한 편집 부위 중 일부는 [11]단백질의 고도로 보존된 아미노 말단에서 발생합니다.

Y/C 편집 부위는 최종 단백질의 아미노산 2에 위치한다.코돈 변화는 티로신(UAU)에서 시스테인(UGU) [12]치환을 유도합니다.

Q/R 부위는 최종 단백질의 아미노산 5에서 발견되는 두 번째 코드 영역이다.여기서 글루타민(Q_)은 코돈이며 아르기닌(R)[11]으로 변환된다.

코드 배열 내의 세 번째 K/R 편집 부위는 리신이 아르기닌으로 [11]변환되는 최종 단백질의 아미노산 위치 15에서 발견된다.

ECS는 편집 사이트 17곳을 모두 포함하는 이중 가닥 구조를 가진 인트론에서 발견될 것으로 예상된다.편집 사이트는 모두 듀플렉스 영역에 속하기 때문에 편집은 외부 시퀀스와 인트로닉 시퀀스를 동시에 실행할 수 있습니다.인트로닉 영역의 마지막 150개의 뉴클레오티드와 엑손 [11]2의 시작에 대한 높은 수준의 보존이 있다.

규정

BLCAP 단백질은 신경계와 관련된 것뿐만 아니라 광범위한 조직에서 발현됩니다.이는 편집에 ADAR 1 [9]효소가 포함될 수 있음을 나타냅니다.그러나 ADAR1과 ADAR2는 BLCAP 성적서를 편집하기 위해 협력하는 것으로 입증되었다.이 단백질의 사전 mRNA는 많은 조직(심장, 방광, 림프구, 섬유아세포, 상피세포 및 뇌)에서 편집되지만 편집 빈도는 조직마다 다릅니다.성상세포종, 방광암, 대장암에서 관련 정상 조직과 비교했을 때 BLCAP 편집 수준이 전반적으로 감소한다.EGFP-ADAR1, EGFP-ADAR2 또는 비감염 HEK293 세포로 감염된 HEK 293t 세포를 사용하여 5'의 특정 부위에서 편집에 관여하는 ADAR 효소를 결정했다.UTR 및 코딩 영역.Y/C 부위의 편집 수준은 16%였고 종양 세포는 평균 21%였다.ADAR1은 5' UTR의 사이트를 편집하지 않지만 ADAR2는 5b와 5c 사이트를 편집하는 것으로 나타났다.Y/c는 양쪽에서 편집되며 Q/R 사이트와 K/R 사이트를 ADAR1보다 높은 수준으로 편집합니다.낮은 수준의 편집은 비감염 벡터에서도 검출됩니다.이러한 결과는 ADAR1과 ADAR2가 대부분의 [11]사이트에서 보다 효율적인 ADAR2를 사용하여 모든 사이트를 편집할 수 있음을 나타냅니다.

영향들

Q/R 및 K/R 부위에서 편집하면 단백질의 보존된 아미노 말단에 양전하 아미노산이 배치된다.코딩 시퀀스에서 가능한 3개의 편집 부위는 최대 8개의 다른 단백질 아이소폼을 [11]번역할 수 있습니다.편집으로 인한 단백질 기능의 가능한 변화는 현재 알려져 있지 않습니다.

레퍼런스

  1. ^ a b c GRCh38: 앙상블 릴리즈 89: ENSG00000166619 - 앙상블, 2017년 5월
  2. ^ a b c GRCm38: 앙상블 릴리즈 89: ENSMUSG000067787 - 앙상블, 2017년 5월
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Gromova I, Gromov P, Celis JE (February 1999). "Identification of true differentially expressed mRNAs in a pair of human bladder transitional cell carcinomas using an improved differential display procedure". Electrophoresis. 20 (2): 241–8. doi:10.1002/(SICI)1522-2683(19990201)20:2<241::AID-ELPS241>3.0.CO;2-A. PMID 10197429.
  6. ^ a b "Entrez Gene: BLCAP bladder cancer associated protein".
  7. ^ Misono H, Togawa H, Yamamoto T, Soda K (September 1976). "Occurrence of meso-alpha, epsilon-diaminopimelate dehydrogenase in Bacillus sphaericus". Biochemical and Biophysical Research Communications. 72 (1): 89–93. doi:10.1016/0006-291x(76)90964-5. PMID 10904.
  8. ^ Su AI, Wiltshire T, Batalov S, Lapp H, Ching KA, Block D, Zhang J, Soden R, Hayakawa M, Kreiman G, Cooke MP, Walker JR, Hogenesch JB (April 2004). "A gene atlas of the mouse and human protein-encoding transcriptomes". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 101 (16): 6062–7. Bibcode:2004PNAS..101.6062S. doi:10.1073/pnas.0400782101. PMC 395923. PMID 15075390.
  9. ^ a b c Riedmann EM, Schopoff S, Hartner JC, Jantsch MF (June 2008). "Specificity of ADAR-mediated RNA editing in newly identified targets". RNA. 14 (6): 1110–8. doi:10.1261/rna.923308. PMC 2390793. PMID 18430892.
  10. ^ Clutterbuck DR, Leroy A, O'Connell MA, Semple CA (June 2005). "A bioinformatic screen for novel A-I RNA editing sites reveals recoding editing in BC10". Bioinformatics. 21 (11): 2590–5. doi:10.1093/bioinformatics/bti411. PMID 15797904.
  11. ^ a b c d e f Galeano F, Leroy A, Rossetti C, Gromova I, Gautier P, Keegan LP, Massimi L, Di Rocco C, O'Connell MA, Gallo A (July 2010). "Human BLCAP transcript: new editing events in normal and cancerous tissues". International Journal of Cancer. 127 (1): 127–37. doi:10.1002/ijc.25022. PMC 2958456. PMID 19908260.
  12. ^ Levanon EY, Hallegger M, Kinar Y, Shemesh R, Djinovic-Carugo K, Rechavi G, Jantsch MF, Eisenberg E (2005). "Evolutionarily conserved human targets of adenosine to inosine RNA editing". Nucleic Acids Research. 33 (4): 1162–8. arXiv:q-bio/0502045. Bibcode:2005q.bio.....2045L. doi:10.1093/nar/gki239. PMC 549564. PMID 15731336.

읽고 추가

외부 링크