이 클럽은 1997년 카사팔카 광산촌에서 유니온 미나스 데 카사팔카라는 이름으로 설립되었다.다음해 후안 디아즈와 후안 플로레스 밑에서 클럽 보카 주니어와 합병하여 아틀레티코 미네로 개칭하여 클럽의 새 상징과 현재의 상징을 맡기도 하는데, 중남미에서 가장 성공한 팀 중 하나인 브라질 아틀레티코 마이니로를 기반으로 했다고 한다.헥터 가마라, 데니스 데 라 크루스, 페르난도 파첼로가 구단을 이어받아 코파 페루의 가장 매력적인 팀 중 하나가 되었다.그의 첫 번째 주요 캠페인은 2005년, 리마를 대표하는 내셔널 스테이지에서 1위에 올랐다가 8강에 올랐을 때, 그들은 심보테의 호세 갈베즈 FBC에 의해 탈락했다.
2006년에는 2부 리그에 초청되어 두 개의 빈자리 중 하나를 채웠다.다만 초청 대상자들은 1부 리그나 2부 리그에서 자신을 대표하는 팀이 없는 지역이 홈그라운드가 돼야 한다고 요구했다.미네로는 홈구장을 후안카요로 바꿨고, 그곳에서 그들은 1년 내내 경기를 했다.
2007년에는 마투카나로 복귀하여 2부 리그 2위를 차지하였다.그들은 코파 페루 준우승 스포츠 아길라를 상대로 플레이오프를 치러 승리했다.그들은 1사단으로 진급했다.후안 오리히와의 플레이오프 경기에서 패한 후 2008년 2부 리그로 내려왔다.그 이후로 페루 2사단에 남아있다.
페르난도 파첼로
